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module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd

@@ -21,7 +21,11 @@ knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
 
 ## Préparation des données
 
-Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. L'URL est:
+Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous
+les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous
+téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. 
+
+L'URL est:
 ```{r}
 data_url = "http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv"
 ```
@@ -43,8 +47,16 @@ Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://
 
 La première ligne du fichier CSV est un commentaire, que nous ignorons en précisant `skip=1`.
 ### Téléchargement
+Pour nous protéger contre une éventuelle disparition ou modification du serveur du Réseau Sentinelles, nous faisons une copie locale
+de ce jeux de données que nous préservons avec notre analyse. Il est inutile et même risquée de télécharger les données à chaque exécution, car dans le cas d'une panne nous pourrions remplacer nos données par un fichier défectueux. Pour cette raison, nous téléchargeons les données seulement si la copie locale n'existe pas.
+
 ```{r}
-data = read.csv(data_url, skip=1)
+data_file = "syndrome-grippal.csv"
+if (! file.exists(data_file)){
+   download.file(data_url, data_file)
+    }
+    
+data = read.csv(data_file, skip=1)
 ```
 
 Regardons ce que nous avons obtenu: