From bc02ae6925a0276bf3228f5d393cde45a87304b7 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Emmanuel Guiffart Date: Mon, 1 Jun 2020 13:29:24 +0200 Subject: [PATCH] hoping to function --- module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd | 9 +++++---- 1 file changed, 5 insertions(+), 4 deletions(-) diff --git a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd index 159149f..c0b1569 100644 --- a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd +++ b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd @@ -21,13 +21,14 @@ knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE) ## Préparation des données -Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. L'URL est: +Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. + +En pratique, nous chargons les données grâce à une copie du fichier enregistrée localement. Un code télécharge directement et enregistre une copie au cas où ce fichier n'exste pas encore en local. ```{r} -if ("incidence-PAY-3.csv" %notin% dir(path=getwd()) then write.csv("http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv","incidence-PAY-3.csv") -# "http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv" +if ("incidence-PAY-3.csv" %in% dir(path=getwd())=='FALSE') write.csv("http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv",file = "incidence-PAY-3.csv") -# data_url = read.csv(file = "incidence-PAY-3.csv") +data_url <- read.csv(file = "incidence-PAY-3.csv") ``` Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://ns.sentiweb.fr/incidence/csv-schema-v1.json): -- 2.18.1