From 642fed5a0f355f2e0a671801e454e1a62c075db9 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Thibault CARIOU Date: Mon, 14 Dec 2020 10:32:52 +0100 Subject: [PATCH] Module3 Exo1 --- module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd | 8 ++++++-- 1 file changed, 6 insertions(+), 2 deletions(-) diff --git a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd index 771e78f..c6c74a9 100644 --- a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd +++ b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd @@ -23,7 +23,11 @@ knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE) Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. L'URL est: ```{r} -data_url = "http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv" +if(file.exists("incidence-PAY-3.csv")==F){ + data_url = "https://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv" + download.file(data_url, destfile = "~/MOOC/MOOC_repro/mooc-rr/module3/exo1", method="curl") +} + ``` Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://ns.sentiweb.fr/incidence/csv-schema-v1.json): @@ -44,7 +48,7 @@ Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https:// La première ligne du fichier CSV est un commentaire, que nous ignorons en précisant `skip=1`. ### Téléchargement ```{r} -data = read.csv(data_url, skip=1) +data = read.csv("~/MOOC/MOOC_repro/mooc-rr/module3/exo1/incidence-PAY-3.csv", skip=1) ``` Regardons ce que nous avons obtenu: -- 2.18.1