From 783b20c15cbabcd5884bb0438f0722e8e662c1b2 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Thibault CARIOU Date: Mon, 14 Dec 2020 10:51:22 +0100 Subject: [PATCH] Ajout commentaires exo1 module 3 --- module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd | 12 +++++++++--- 1 file changed, 9 insertions(+), 3 deletions(-) diff --git a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd index c6c74a9..d3c90ce 100644 --- a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd +++ b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd @@ -19,9 +19,13 @@ header-includes: knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE) ``` -## Préparation des données +## Préparation des données, téléchargement + +Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. + +L'adresse URL ayant changé entre le début du MOOC et aujourd'hui, le choix est fait de téléchargé les données en local en premier lieu. Afin de ne pas télécharger le fichier à chaque exécution du script, on ajoute une condition d'existence du fichier avant le téléchargement. + -Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. L'URL est: ```{r} if(file.exists("incidence-PAY-3.csv")==F){ data_url = "https://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv" @@ -46,7 +50,9 @@ Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https:// | `geo_name` | Libellé de la zone géographique (ce libellé peut être modifié sans préavis) | La première ligne du fichier CSV est un commentaire, que nous ignorons en précisant `skip=1`. -### Téléchargement + +### Lecture + ```{r} data = read.csv("~/MOOC/MOOC_repro/mooc-rr/module3/exo1/incidence-PAY-3.csv", skip=1) ``` -- 2.18.1