From 72c81dc7cebc0019960833fa703d50415c174268 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: 23f4754674d3575f868479865ddf701f <23f4754674d3575f868479865ddf701f@app-learninglab.inria.fr> Date: Mon, 10 Jan 2022 14:43:30 +0000 Subject: [PATCH] Update analyse-syndrome-grippal.Rmd --- module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd | 14 +++++++++++--- 1 file changed, 11 insertions(+), 3 deletions(-) diff --git a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd index 771e78f..5dfd82a 100644 --- a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd +++ b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd @@ -21,9 +21,16 @@ knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE) ## Préparation des données -Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. L'URL est: +Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. +Les données sont téléchargées en local avant l'analyse. + ```{r} data_url = "http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv" +data_file = "syndrome-grippal.csv" +if (!file.exists(data_file)) { + download.file(data_url, data_file, method="auto") +} + ``` Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://ns.sentiweb.fr/incidence/csv-schema-v1.json): @@ -42,9 +49,10 @@ Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https:// | `geo_name` | Libellé de la zone géographique (ce libellé peut être modifié sans préavis) | La première ligne du fichier CSV est un commentaire, que nous ignorons en précisant `skip=1`. -### Téléchargement +### Lecture du dataset (dl en local) + ```{r} -data = read.csv(data_url, skip=1) +data = read.csv(data_file, skip=1) ``` Regardons ce que nous avons obtenu: -- 2.18.1