Savoir faire un calcul simple soi-même

Table des matières

1 Chargement des librairies

library(prettyR)

2 Chargement des données

3 calcul

Description of df 

 Numeric 
    sd min  mean median  max
x 4.33 2.8 14.11   14.5 23.4

4 Quelques explications

Ceci est un document org-mode avec quelques exemples de code R. Une fois ouvert dans emacs, ce document peut aisément être exporté au format HTML, PDF, et Office. Pour plus de détails sur org-mode vous pouvez consulter https://orgmode.org/guide/.

Lorsque vous utiliserez le raccourci C-c C-e h o, ce document sera compilé en html. Tout le code contenu sera ré-exécuté, les résultats récupérés et inclus dans un document final. Si vous ne souhaitez pas ré-exécuter tout le code à chaque fois, il vous suffit de supprimer le # et l'espace qui sont devant le #+PROPERTY: au début de ce document.

Comme nous vous l'avons montré dans la vidéo, on inclut du code R de la façon suivante (et on l'exécute en faisant C-c C-c):

print("Hello world!")
[1] "Hello world!"

Voici la même chose, mais avec une session R (c'est le cas le plus courant, R étant vraiment un langage interactif), donc une persistance d'un bloc à l'autre (et on l'exécute toujours en faisant C-c C-c).

summary(cars)
    speed           dist       
Min.   : 4.0   Min.   :  2.00  
1st Qu.:12.0   1st Qu.: 26.00  
Median :15.0   Median : 36.00  
Mean   :15.4   Mean   : 42.98  
3rd Qu.:19.0   3rd Qu.: 56.00  
Max.   :25.0   Max.   :120.00

Et enfin, voici un exemple de sortie graphique:

cars.png

Vous remarquerez le paramètre :exports results qui indique que le code ne doit pas apparaître dans la version finale du document. Nous vous recommandons dans le cadre de ce MOOC de ne pas changer ce paramètre (indiquer both) car l'objectif est que vos analyses de données soient parfaitement transparentes pour être reproductibles.

Attention, la figure ainsi générée n'est pas stockée dans le document org. C'est un fichier ordinaire, ici nommé cars.png. N'oubliez pas de le committer si vous voulez que votre analyse soit lisible et compréhensible sur GitLab.

Enfin, pour les prochains exercices, nous ne vous fournirons pas forcément de fichier de départ, ça sera à vous de le créer, par exemple en repartant de ce document et de le commiter vers gitlab. N'oubliez pas que nous vous fournissons dans les ressources de ce MOOC une configuration avec un certain nombre de raccourcis claviers permettant de créer rapidement les blocs de code R (en faisant <r ou <R suivi de Tab).

Maintenant, à vous de jouer! Vous pouvez effacer toutes ces informations et les remplacer par votre document computationnel.

Date: Mardi 31 Mars 2020

Auteur: Adam Taheraly

Created: 2020-03-31 mar. 14:45

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