diff --git a/module2/exo2/exercice_fr.Rmd b/module2/exo2/exercice_fr.Rmd index 51b2e2bee84240e43c1d14c9203497ef14753c8b..2fc2bd37f6224469c6542334959fc0fcb95e0319 100644 --- a/module2/exo2/exercice_fr.Rmd +++ b/module2/exo2/exercice_fr.Rmd @@ -16,5 +16,5 @@ knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE) df = data.frame(x = c(14.0, 7.6, 11.2, 12.8, 12.5, 9.9, 14.9, 9.4, 16.9, 10.2, 14.9, 18.1, 7.3, 9.8, 10.9,12.2, 9.9, 2.9, 2.8, 15.4, 15.7, 9.7, 13.1, 13.2, 12.3, 11.7, 16.0, 12.4, 17.9, 12.2, 16.2, 18.7, 8.9, 11.9, 12.1, 14.6, 12.1, 4.7, 3.9, 16.9, 16.8, 11.3, 14.4, 15.7, 14.0, 13.6, 18.0, 13.6, 19.9, 13.7, 17.0, 20.5, 9.9, 12.5, 13.2, 16.1, 13.5, 6.3, 6.4, 17.6, 19.1, 12.8, 15.5, 16.3, 15.2, 14.6, 19.1, 14.4, 21.4, 15.1, 19.6, 21.7, 11.3, 15.0, 14.3, 16.8, 14.0, 6.8, 8.2, 19.9, 20.4, 14.6, 16.4, 18.7, 16.8, 15.8, 20.4, 15.8, 22.4, 16.2, 20.3, 23.4, 12.1, 15.5, 15.4, 18.4, 15.7, 10.2, 8.9, 21.0)) library(prettyR) -describe(df, num.desc = c("sd", "min", "median", "max")) -``` \ No newline at end of file +describe(df, num.desc = c("sd", "min", "mean", "median", "max")) +``` diff --git a/module2/exo3/exercice_fr.Rmd b/module2/exo3/exercice_fr.Rmd index 7eece5e296bb586e88166aa8a263ca75b44c2b9e..e069c1133fd9b0a22460acdd12ad7a77e01ddf7c 100644 --- a/module2/exo3/exercice_fr.Rmd +++ b/module2/exo3/exercice_fr.Rmd @@ -10,24 +10,16 @@ output: html_document knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE) ``` -## Quelques explications +# Réaliser un affichage graphique -Ceci est un document R markdown que vous pouvez aisément exporter au format HTML, PDF, et MS Word. Pour plus de détails sur R Markdown consultez . +```{r} +df = data.frame(x = c(14.0, 7.6, 11.2, 12.8, 12.5, 9.9, 14.9, 9.4, 16.9, 10.2, 14.9, 18.1, 7.3, 9.8, 10.9,12.2, 9.9, 2.9, 2.8, 15.4, 15.7, 9.7, 13.1, 13.2, 12.3, 11.7, 16.0, 12.4, 17.9, 12.2, 16.2, 18.7, 8.9, 11.9, 12.1, 14.6, 12.1, 4.7, 3.9, 16.9, 16.8, 11.3, 14.4, 15.7, 14.0, 13.6, 18.0, 13.6, 19.9, 13.7, 17.0, 20.5, 9.9, 12.5, 13.2, 16.1, 13.5, 6.3, 6.4, 17.6, 19.1, 12.8, 15.5, 16.3, 15.2, 14.6, 19.1, 14.4, 21.4, 15.1, 19.6, 21.7, 11.3, 15.0, 14.3, 16.8, 14.0, 6.8, 8.2, 19.9, 20.4, 14.6, 16.4, 18.7, 16.8, 15.8, 20.4, 15.8, 22.4, 16.2, 20.3, 23.4, 12.1, 15.5, 15.4, 18.4, 15.7, 10.2, 8.9, 21.0)) -Lorsque vous cliquerez sur le bouton **Knit** ce document sera compilé afin de ré-exécuter le code R et d'inclure les résultats dans un document final. Comme nous vous l'avons montré dans la vidéo, on inclue du code R de la façon suivante: +df$y <- seq(1, 100, 1) -```{r cars} -summary(cars) -``` - -Et on peut aussi aisément inclure des figures. Par exemple: +library(ggplot2) +ggplot(df, aes(x = y , y = x)) + geom_line(color = "blue") -```{r pressure, echo=FALSE} -plot(pressure) +ggplot(df, aes(x = x)) + geom_histogram(bins = 10, color="black", fill="blue") ``` -Vous remarquerez le paramètre `echo = FALSE` qui indique que le code ne doit pas apparaître dans la version finale du document. Nous vous recommandons dans le cadre de ce MOOC de ne pas utiliser ce paramètre car l'objectif est que vos analyses de données soient parfaitement transparentes pour être reproductibles. - -Comme les résultats ne sont pas stockés dans les fichiers Rmd, pour faciliter la relecture de vos analyses par d'autres personnes, vous aurez donc intérêt à générer un HTML ou un PDF et à le commiter. - -Maintenant, à vous de jouer! Vous pouvez effacer toutes ces informations et les remplacer par votre document computationnel. diff --git a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd index 771e78faac371f23c921f7f7aecc87f2100e9059..7f5dc2adab1ef1a55048ccfd68b3f660273fa268 100644 --- a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd +++ b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd @@ -44,7 +44,7 @@ Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https:// La première ligne du fichier CSV est un commentaire, que nous ignorons en précisant `skip=1`. ### Téléchargement ```{r} -data = read.csv(data_url, skip=1) +data = read.csv("incidence-PAY-3.csv", skip=1) ``` Regardons ce que nous avons obtenu: