From ca0130448b31b493cc4d6b83be803862f9079131 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Adam Taheraly Date: Tue, 31 Mar 2020 15:00:34 +0200 Subject: [PATCH] Commit exo 2 --- module2/exo1/toy_document_orgmode_R_fr.org | 12 ++-- module2/exo2/exercice_R_fr.org | 83 ++++------------------ 2 files changed, 18 insertions(+), 77 deletions(-) diff --git a/module2/exo1/toy_document_orgmode_R_fr.org b/module2/exo1/toy_document_orgmode_R_fr.org index f5bc96b..6c8b099 100644 --- a/module2/exo1/toy_document_orgmode_R_fr.org +++ b/module2/exo1/toy_document_orgmode_R_fr.org @@ -1,21 +1,21 @@ #+TITLE: À propros du calcul de $\pi$ +#+LANGUAGE: fr #+AUTHOR: Adam Taheraly #+DATE: Lundi 30 Mars #+EMAIL: taheraly.adam@gmail.com #+DESCRIPTION: Exercice Mooc RR sur le calcul de \pi #+KEYWORDS: MOOC-RR exo1 -#+LANGUAGE: fr #+TEXT: #+OPTIONS: H:1 num:t toc:t \n:nil @:t ::t |:t ^:t -:t f:f todo:f tasks:nil pri:t tags:not-in-toc <:f *:t TeX:t LaTeX:t skip:t author:f email:f creator:f timestamp:f d:t -#+BIND: lisp-var lisp-val -#+LINK_UP: -#+LINK_HOME: -#+LaTeX_HEADER: \usepackage[utf8]{inputinc} -#+LaTeX_HEADER: \usepackage[T1]{fontinc} +#+LaTeX_HEADER: \usepackage[utf8]{inputenc} +#+LaTeX_HEADER: \usepackage[T1]{fontenc} #+LaTeX_HEADER: \usepackage[francais]{babel} #+LaTeX_HEADER: \usepackage{amsmath} #+LaTeX_HEADER: \usepackage{amssymb} #+LaTeX_HEADER: \usepackage{mathrsfs} +#+BIND: lisp-var lisp-val +#+LINK_UP: +#+LINK_HOME: #+EXPORT_EXCLUDE_TAGS: #+PROPERTY: header-args :session :export-both diff --git a/module2/exo2/exercice_R_fr.org b/module2/exo2/exercice_R_fr.org index 1bb8f61..f5ceaac 100644 --- a/module2/exo2/exercice_R_fr.org +++ b/module2/exo2/exercice_R_fr.org @@ -1,6 +1,6 @@ -#+TITLE: Votre titre -#+AUTHOR: Votre nom -#+DATE: La date du jour +#+TITLE: Savoir faire un calcul simple soi-même +#+AUTHOR: Adam Taheraly +#+DATE: Mardi 31 Mars 2020 #+LANGUAGE: fr # #+PROPERTY: header-args :eval never-export @@ -11,74 +11,15 @@ #+HTML_HEAD: #+HTML_HEAD: -* Quelques explications - -Ceci est un document org-mode avec quelques exemples de code -R. Une fois ouvert dans emacs, ce document peut aisément être -exporté au format HTML, PDF, et Office. Pour plus de détails sur -org-mode vous pouvez consulter https://orgmode.org/guide/. - -Lorsque vous utiliserez le raccourci =C-c C-e h o=, ce document sera -compilé en html. Tout le code contenu sera ré-exécuté, les résultats -récupérés et inclus dans un document final. Si vous ne souhaitez pas -ré-exécuter tout le code à chaque fois, il vous suffit de supprimer -le # et l'espace qui sont devant le ~#+PROPERTY:~ au début de ce -document. - -Comme nous vous l'avons montré dans la vidéo, on inclut du code -R de la façon suivante (et on l'exécute en faisant ~C-c C-c~): - -#+begin_src R :results output :exports both -print("Hello world!") -#+end_src - -#+RESULTS: -: [1] "Hello world!" - -Voici la même chose, mais avec une session R (c'est le cas le -plus courant, R étant vraiment un langage interactif), donc une -persistance d'un bloc à l'autre (et on l'exécute toujours en faisant -~C-c C-c~). - +* Chargement des librairies #+begin_src R :results output :session *R* :exports both -summary(cars) +library(prettyR) #+end_src - -#+RESULTS: -: speed dist -: Min. : 4.0 Min. : 2.00 -: 1st Qu.:12.0 1st Qu.: 26.00 -: Median :15.0 Median : 36.00 -: Mean :15.4 Mean : 42.98 -: 3rd Qu.:19.0 3rd Qu.: 56.00 -: Max. :25.0 Max. :120.00 - -Et enfin, voici un exemple de sortie graphique: -#+begin_src R :results output graphics :file "./cars.png" :exports results :width 600 :height 400 :session *R* -plot(cars) +* Chargement des données +#+begin_src R :results output :session *R* :exports results +df <- data.frame(x = c(14.0, 7.6, 11.2, 12.8, 12.5, 9.9, 14.9, 9.4, 16.9, 10.2, 14.9, 18.1, 7.3, 9.8, 10.9,12.2, 9.9, 2.9, 2.8, 15.4, 15.7, 9.7, 13.1, 13.2, 12.3, 11.7, 16.0, 12.4, 17.9, 12.2, 16.2, 18.7, 8.9, 11.9, 12.1, 14.6, 12.1, 4.7, 3.9, 16.9, 16.8, 11.3, 14.4, 15.7, 14.0, 13.6, 18.0, 13.6, 19.9, 13.7, 17.0, 20.5, 9.9, 12.5, 13.2, 16.1, 13.5, 6.3, 6.4, 17.6, 19.1, 12.8, 15.5, 16.3, 15.2, 14.6, 19.1, 14.4, 21.4, 15.1, 19.6, 21.7, 11.3, 15.0, 14.3, 16.8, 14.0, 6.8, 8.2, 19.9, 20.4, 14.6, 16.4, 18.7, 16.8, 15.8, 20.4, 15.8, 22.4, 16.2, 20.3, 23.4, 12.1, 15.5, 15.4, 18.4, 15.7, 10.2, 8.9, 21.0)) +#+end_src +* Calcul +#+begin_src R :results output :session *R* :exports results +describe(df, num.desc = c("sd", "min", "mean", "median", "max")) #+end_src - -#+RESULTS: -[[file:./cars.png]] - -Vous remarquerez le paramètre ~:exports results~ qui indique que le code -ne doit pas apparaître dans la version finale du document. Nous vous -recommandons dans le cadre de ce MOOC de ne pas changer ce paramètre -(indiquer ~both~) car l'objectif est que vos analyses de données soient -parfaitement transparentes pour être reproductibles. - -Attention, la figure ainsi générée n'est pas stockée dans le document -org. C'est un fichier ordinaire, ici nommé ~cars.png~. N'oubliez pas -de le committer si vous voulez que votre analyse soit lisible et -compréhensible sur GitLab. - -Enfin, pour les prochains exercices, nous ne vous fournirons pas -forcément de fichier de départ, ça sera à vous de le créer, par -exemple en repartant de ce document et de le commiter vers -gitlab. N'oubliez pas que nous vous fournissons dans les ressources de -ce MOOC une configuration avec un certain nombre de raccourcis -claviers permettant de créer rapidement les blocs de code R (en -faisant ~