diff --git a/journal/Readme.md b/journal/Readme.md index fabe4ae1237b234287b2a29527aec9235a6d6b08..9d283657c186332a5f2b1fe101342e7fae92c91f 100644 --- a/journal/Readme.md +++ b/journal/Readme.md @@ -64,4 +64,43 @@ Nous utilisons DocFetcher. Pour éviter l'abondance de résultats, on peut utiliser les commentaires Markdown pour stocker les étiquettes. +## Module 2 + +### Module 2.1 + +Exemple d'études dont les résultats ont été controversés. + +Je connaissais déjà la première histoire (notamment grace à [la vidéo de ScienceEtonnante](https://youtu.be/yeX_Zs7zztY?si=OUk__7fL6lGyh3-c)) et des politiques du monde entier se basaient de cette statistique erronnée, par "mégarde" d'après les auteurs (bizarrement cela arrangeait la conclusion). + +Deuxième exemple sur l'IRM où le bruit n'était pas assez pris en considération. + +Autre exemple sur un bug dans un logiciel, mais au final c'est surtout la méthodologie à revoir. + +Dernier exemple en cristallographie : Reprise d'un code qui était incorrect et qui a ainsi engendré un souci au niveau de l'analyse. + +### Module 2.2 + +Différents critères à propos de pourquoi c'est difficile de tout faire proprement : + +- Manque d'informations (expliciter ses sources, données, choix) => Cahier de laboratoire peut aider +- Mauvaise utilisation de l'ordinateur (tableur alors que ce n'est pas forcèment adapté à cause de macro et formatage automatique) + de logiciels dont on ne sait pas si le contenu est correct +- Manque de riqueur / organisation (backup, historique, etc.) +- Dimension culturelle et sociale (éthique des données etc.) +- Rendre public ou non (on peut trouver des erreurs ou voir les faiblesses dans notre étude, d'autres peuvent réutiliser notre code ou données, il y a des données sensibles (mais on peut utiliser de l'anonymisation crypto)). + +Outils à éviter et alternatives + +1. Eviter suite Microsoft, privilégier les formats texte +2. Eviter les logiciels propriétaires comme matlab et privilégier Scilab, R, Python +3. Utiliser des clouds qui garantissent la pérennité (GitHub, GitLab) +4. Outils "intuitifs" qui ne permettent pas de voir ce qu'il se passe derrière le rideau + +### Module 2.3 + +Principes du document computationnel : +- Inspecter ce qui a été fait (comprendre choix etc.) +- Refaire (reproduire, utiliser les mêmes données, etc.) + +La vitrine est lue par le lecture, mais s'il veut en savoir plus il doit avoir accès au code qui génère les graphiques, données, etc. +