From 4416264ec5c1eaee89cab896596c2aecfee5cf57 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: 36cf6267d1f8856c85d87f0f287ea039 <36cf6267d1f8856c85d87f0f287ea039@app-learninglab.inria.fr> Date: Wed, 16 Jun 2021 17:24:35 +0000 Subject: [PATCH] Update by Mohamed analyse-syndrome-grippal.Rmd --- module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd | 14 ++++++++++++-- 1 file changed, 12 insertions(+), 2 deletions(-) diff --git a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd index 771e78f..660ef6a 100644 --- a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd +++ b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd @@ -24,6 +24,16 @@ knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE) Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. L'URL est: ```{r} data_url = "http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv" + +``` + +Pour nous protéger contre une éventuelle disparition ou modification du serveur du Réseau Sentinelles, nous faisons une copie locale de ce jeux de données que nous préservons avec notre analyse. Il est inutile et même risquée de télécharger les données à chaque exécution, car dans le cas d'une panne nous pourrions remplacer nos données par un fichier défectueux. Pour cette raison, nous téléchargeons les données seulement si la copie locale n'existe pas. + +```{r} +data_file = "syndrome-grippal.csv" +if (!file.exists(data_file)) { + download.file(data_url, data_file, method="auto") +} ``` Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://ns.sentiweb.fr/incidence/csv-schema-v1.json): @@ -42,9 +52,9 @@ Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https:// | `geo_name` | Libellé de la zone géographique (ce libellé peut être modifié sans préavis) | La première ligne du fichier CSV est un commentaire, que nous ignorons en précisant `skip=1`. -### Téléchargement +### Lecture ```{r} -data = read.csv(data_url, skip=1) +data = read.csv(data_file, skip=1) ``` Regardons ce que nous avons obtenu: -- 2.18.1