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Commit 7893ffdc authored by François Févotte's avatar François Févotte
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module3/exo3/exercice.html
View file @ 7893ffdc
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module3/exo3/exercice.jmd
View file @ 7893ffdc
......@@ -2,15 +2,17 @@
title : Analyse de la concentration de CO2 dans l'atmosphère depuis 1958
author : François Févotte
date: avril 2020
options:
css: skeleton_css.css
---
# Gestion des dépendances
### Environnement
## Environnement
```julia; echo=false; results="hidden"
@info "Instantiating project"
@info "* Instantiating project"
```
Nous utilisons Julia dans sa version 1.4.0, sur une architecture matérielle de
......@@ -37,10 +39,10 @@ Pkg.instantiate()
```
### Chargement des dépendances
## Chargement des dépendances
```julia; echo=false; results="hidden"
@info "Loading dependencies"
@info "* Loading dependencies"
```
Tant que nous y sommes, profitons en pour charger dès maintenant les paquets
......@@ -68,10 +70,10 @@ CO2](https://scrippsco2.ucsd.edu/data/atmospheric_co2/primary_mlo_co2_record.htm
fondons l'analyse sur le jeu de données contenant des observations hebdomadaires.
### Téléchargement
## Téléchargement
```julia; echo=false; results="hidden"
@info "Retrieving data"
@info "* Retrieving data"
```
Le jeu de données est téléchargé une seule fois ; c'est une copie locale qui
......@@ -112,10 +114,10 @@ end
```
### Lecture
## Lecture
```julia; echo=false; results="hidden"
@info "Parsing data"
@info "* Parsing data"
```
Les données d'entrée sont stockées au format CSV, et contiennent 44 lignes
......@@ -144,10 +146,10 @@ info(data_raw)
```
### Vérification des données manquantes
## Vérification des données manquantes
```julia; echo=false; results="hidden"
@info "Checking for missing values"
@info "* Checking for missing values"
```
Les relevés étant hebdomadaires, l'écart entre deux dates successives du jeu de
......@@ -168,10 +170,10 @@ Il y a 12 périodes durant lesquelles les données sont manquantes, dont une en
particulier ayant duré 19 semaines en 1964. Le traitement devra en tenir compte.
### Aperçu global des données
## Aperçu global des données
```julia; echo=false; results="hidden"
@info "Plotting raw data"
@info "* Plotting raw data"
```
Une visualisation de l'ensemble des données semble montrer une augmentation
......@@ -225,7 +227,7 @@ annuel, nous allons commencer par interpoler les données à une maille
journalière. Ceci nous permettra de découper le jeu de données en années.
### Travaux sur les dates
## Travaux sur les dates
Il est plus simple d'interpoler entre deux nombres qu'entre deux dates. Dans la
suite, nous adopterons une convention selon laquelle chaque date peut être
......@@ -263,10 +265,10 @@ présence d'années bissextiles, mais rien n'a été fait pour les traiter à pa
l'impact, de l'ordre de 1/365 une année sur 4, a été jugé négligeable a priori.
### Interpolation à la maille journalière
## Interpolation à la maille journalière
```julia; echo=false; results="hidden"
@info "Interpolating daily data"
@info "* Interpolating daily data"
```
On construit un interpolateur linéaire basé sur les mesures de CO2 en fonction
......@@ -358,10 +360,10 @@ plot(xlabel="Jour de l'année", ylabel="Nombre de valeurs")
histogram!(data.day, bins=0:31:365, label=nothing)
```
### Analyse des variations annuelles
## Analyse des variations annuelles
```julia; echo=false; results="hidden"
@info "Fitting yearly oscillations"
@info "* Fitting yearly oscillations"
```
Pour chaque année, on commence par tenter d'extraire la composante oscillante de
......@@ -469,10 +471,10 @@ moyen est suffisamment représentatif pour permettre d'extraire la composante
tendancielle lisse des données.
### Analyse des variations tendancielles
## Analyse des variations tendancielles
```julia; echo=false; output="hidden"
@info "Fitting underlying trend"
@info "* Fitting underlying trend"
```
Nous sommes maintenant prêts à extraire la composante tendancielle des
......@@ -543,10 +545,10 @@ plot!(data.date, α .+ β1 * data.date_num .+ γ*data.date_num.^2, linecolor="re
plot!(data.date, α .+ β2 * data.date_num .+ γ*data.date_num.^2, linecolor="red", label=nothing)
```
### Reconstruction du signal complet et prédiction
## Reconstruction du signal complet et prédiction
```julia; echo=false; output="hidden"
@info "Reconstructing and predicting complete signal"
@info "* Reconstructing and predicting complete signal"
```
Nous avons maintenant tous les éléments nécessaires afin de reconstruire
......@@ -591,10 +593,10 @@ plot!(prediction.date, prediction.theta, label="tendance")
plot!(prediction.date, prediction.val, label="prédiction")
```
### Pour aller plus loin
## Pour aller plus loin
```julia; echo=false
@info "Studying alternate model"
@info "* Studying alternate model"
```
En utilisant des modèles plus complexes, il est possible de mieux caractériser
......@@ -637,4 +639,5 @@ closeall()
<!-- Local Variables: -->
<!-- mode: markdown -->
<!-- ispell-local-dictionary: "french" -->
<!-- End: -->
module3/exo3/skeleton_css.css 0 → 100644
View file @ 7893ffdc
@font-face {
font-style: normal;
font-weight: 300;
}
@font-face {
font-style: normal;
font-weight: 400;
}
@font-face {
font-style: normal;
font-weight: 600;
}
html {
font-family: sans-serif; /* 1 */
-ms-text-size-adjust: 100%; /* 2 */
-webkit-text-size-adjust: 100%; /* 2 */
}
body {
margin: 0;
}
article,
aside,
details,
figcaption,
figure,
footer,
header,
hgroup,
main,
menu,
nav,
section,
summary {
display: block;
}
audio,
canvas,
progress,
video {
display: inline-block; /* 1 */
vertical-align: baseline; /* 2 */
}
audio:not([controls]) {
display: none;
height: 0;
}
[hidden],
template {
display: none;
}
a:active,
a:hover {
outline: 0;
}
abbr[title] {
border-bottom: 1px dotted;
}
b,
strong {
font-weight: bold;
}
dfn {
font-style: italic;
}
h1 {
font-size: 2em;
margin: 0.67em 0;
}
mark {
background: #ff0;
color: #000;
}
small {
font-size: 80%;
}
sub,
sup {
font-size: 75%;
line-height: 0;
position: relative;
vertical-align: baseline;
}
sup {
top: -0.5em;
}
sub {
bottom: -0.25em;
}
img {
border: 0;
}
svg:not(:root) {
overflow: hidden;
}
figure {
margin: 1em 40px;
}
hr {
-moz-box-sizing: content-box;
box-sizing: content-box;
height: 0;
}
pre {
overflow: auto;
}
code,
kbd,
pre,
samp {
font-family: monospace, monospace;
font-size: 1em;
}
button,
input,
optgroup,
select,
textarea {
color: inherit; /* 1 */
font: inherit; /* 2 */
margin: 0; /* 3 */
}
button {
overflow: visible;
}
button,
select {
text-transform: none;
}
button,
html input[type="button"], /* 1 */
input[type="reset"],
input[type="submit"] {
-webkit-appearance: button; /* 2 */
cursor: pointer; /* 3 */
}
button[disabled],
html input[disabled] {
cursor: default;
}
button::-moz-focus-inner,
input::-moz-focus-inner {
border: 0;
padding: 0;
}
input {
line-height: normal;
}
input[type="checkbox"],
input[type="radio"] {
box-sizing: border-box; /* 1 */
padding: 0; /* 2 */
}
input[type="number"]::-webkit-inner-spin-button,
input[type="number"]::-webkit-outer-spin-button {
height: auto;
}
input[type="search"] {
-webkit-appearance: textfield; /* 1 */
-moz-box-sizing: content-box;
-webkit-box-sizing: content-box; /* 2 */
box-sizing: content-box;
}
input[type="search"]::-webkit-search-cancel-button,
input[type="search"]::-webkit-search-decoration {
-webkit-appearance: none;
}
fieldset {
border: 1px solid #c0c0c0;
margin: 0 2px;
padding: 0.35em 0.625em 0.75em;
}
legend {
border: 0; /* 1 */
padding: 0; /* 2 */
}
textarea {
overflow: auto;
}
optgroup {
font-weight: bold;
}
table {
font-family: monospace, monospace;
font-size : 0.8em;
border-collapse: collapse;
border-spacing: 0;
}
td,
th {
padding: 0;
}
thead th {
border-bottom: 1px solid black;
background-color: white;
}
tr:nth-child(odd){
background-color: rgb(248,248,248);
}
/*
* Skeleton V2.0.4
* Copyright 2014, Dave Gamache
* www.getskeleton.com
* Free to use under the MIT license.
* http://www.opensource.org/licenses/mit-license.php
* 12/29/2014
*/
.container {
position: relative;
width: 100%;
max-width: 960px;
margin: 0 auto;
padding: 0 20px;
box-sizing: border-box; }
.column,
.columns {
width: 100%;
float: left;
box-sizing: border-box; }
@media (min-width: 400px) {
.container {
width: 85%;
padding: 0; }
}
@media (min-width: 550px) {
.container {
width: 80%; }
.column,
.columns {
margin-left: 4%; }
.column:first-child,
.columns:first-child {
margin-left: 0; }
.one.column,
.one.columns { width: 4.66666666667%; }
.two.columns { width: 13.3333333333%; }
.three.columns { width: 22%; }
.four.columns { width: 30.6666666667%; }
.five.columns { width: 39.3333333333%; }
.six.columns { width: 48%; }
.seven.columns { width: 56.6666666667%; }
.eight.columns { width: 65.3333333333%; }
.nine.columns { width: 74.0%; }
.ten.columns { width: 82.6666666667%; }
.eleven.columns { width: 91.3333333333%; }
.twelve.columns { width: 100%; margin-left: 0; }
.one-third.column { width: 30.6666666667%; }
.two-thirds.column { width: 65.3333333333%; }
.one-half.column { width: 48%; }
/* Offsets */
.offset-by-one.column,
.offset-by-one.columns { margin-left: 8.66666666667%; }
.offset-by-two.column,
.offset-by-two.columns { margin-left: 17.3333333333%; }
.offset-by-three.column,
.offset-by-three.columns { margin-left: 26%; }
.offset-by-four.column,
.offset-by-four.columns { margin-left: 34.6666666667%; }
.offset-by-five.column,
.offset-by-five.columns { margin-left: 43.3333333333%; }
.offset-by-six.column,
.offset-by-six.columns { margin-left: 52%; }
.offset-by-seven.column,
.offset-by-seven.columns { margin-left: 60.6666666667%; }
.offset-by-eight.column,
.offset-by-eight.columns { margin-left: 69.3333333333%; }
.offset-by-nine.column,
.offset-by-nine.columns { margin-left: 78.0%; }
.offset-by-ten.column,
.offset-by-ten.columns { margin-left: 86.6666666667%; }
.offset-by-eleven.column,
.offset-by-eleven.columns { margin-left: 95.3333333333%; }
.offset-by-one-third.column,
.offset-by-one-third.columns { margin-left: 34.6666666667%; }
.offset-by-two-thirds.column,
.offset-by-two-thirds.columns { margin-left: 69.3333333333%; }
.offset-by-one-half.column,
.offset-by-one-half.columns { margin-left: 52%; }
}
html {
font-size: 62.5%; }
body {
font-size: 1.5em; /* currently ems cause chrome bug misinterpreting rems on body element */
line-height: 1.6;
font-weight: 400;
font-family: "Raleway", "HelveticaNeue", "Helvetica Neue", Helvetica, Arial, sans-serif;
color: #222; }
h1, h2, h3, h4, h5, h6 {
margin-top: 2rem;
margin-bottom: 0;
font-weight: 300; }
h1 { font-size: 3.6rem; line-height: 1.2; letter-spacing: -.1rem;}
h2 { font-size: 3.0rem; line-height: 1.25; letter-spacing: -.1rem; }
h3 { font-size: 2.8rem; line-height: 1.3; letter-spacing: -.1rem; }
h4 { font-size: 2.6rem; line-height: 1.35; letter-spacing: -.08rem; }
h5 { font-size: 2.4rem; line-height: 1.5; letter-spacing: -.05rem; }
h6 { font-size: 1.5rem; line-height: 1.6; letter-spacing: 0; }
p {
margin-top: 0; }
a {
color: #1EAEDB; }
a:hover {
color: #0FA0CE; }
.button,
button,
input[type="submit"],
input[type="reset"],
input[type="button"] {
display: inline-block;
height: 38px;
padding: 0 30px;
color: #555;
text-align: center;
font-size: 11px;
font-weight: 600;
line-height: 38px;
letter-spacing: .1rem;
text-transform: uppercase;
text-decoration: none;
white-space: nowrap;
background-color: transparent;
border-radius: 4px;
border: 1px solid #bbb;
cursor: pointer;
box-sizing: border-box; }
.button:hover,
button:hover,
input[type="submit"]:hover,
input[type="reset"]:hover,
input[type="button"]:hover,
.button:focus,
button:focus,
input[type="submit"]:focus,
input[type="reset"]:focus,
input[type="button"]:focus {
color: #333;
border-color: #888;
outline: 0; }
.button.button-primary,
button.button-primary,
input[type="submit"].button-primary,
input[type="reset"].button-primary,
input[type="button"].button-primary {
color: #FFF;
background-color: #33C3F0;
border-color: #33C3F0; }
.button.button-primary:hover,
button.button-primary:hover,
input[type="submit"].button-primary:hover,
input[type="reset"].button-primary:hover,
input[type="button"].button-primary:hover,
.button.button-primary:focus,
button.button-primary:focus,
input[type="submit"].button-primary:focus,
input[type="reset"].button-primary:focus,
input[type="button"].button-primary:focus {
color: #FFF;
background-color: #1EAEDB;
border-color: #1EAEDB; }
input[type="email"],
input[type="number"],
input[type="search"],
input[type="text"],
input[type="tel"],
input[type="url"],
input[type="password"],
textarea,
select {
height: 38px;
padding: 6px 10px; /* The 6px vertically centers text on FF, ignored by Webkit */
background-color: #fff;
border: 1px solid #D1D1D1;
border-radius: 4px;
box-shadow: none;
box-sizing: border-box; }
/* Removes awkward default styles on some inputs for iOS */
input[type="email"],
input[type="number"],
input[type="search"],
input[type="text"],
input[type="tel"],
input[type="url"],
input[type="password"],
textarea {
-webkit-appearance: none;
-moz-appearance: none;
appearance: none; }
textarea {
min-height: 65px;
padding-top: 6px;
padding-bottom: 6px; }
input[type="email"]:focus,
input[type="number"]:focus,
input[type="search"]:focus,
input[type="text"]:focus,
input[type="tel"]:focus,
input[type="url"]:focus,
input[type="password"]:focus,
textarea:focus,
select:focus {
border: 1px solid #33C3F0;
outline: 0; }
label,
legend {
display: block;
margin-bottom: .5rem;
font-weight: 600; }
fieldset {
padding: 0;
border-width: 0; }
input[type="checkbox"],
input[type="radio"] {
display: inline; }
label > .label-body {
display: inline-block;
margin-left: .5rem;
font-weight: normal; }
ul {
list-style: circle; }
ol {
list-style: decimal; }
ul ul,
ul ol,
ol ol,
ol ul {
margin: 1.5rem 0 1.5rem 3rem;
font-size: 90%; }
li > p {margin : 0;}
th,
td {
padding: 5px 15px;
text-align: left;
border-bottom: 1px solid #E1E1E1; }
th:first-child,
td:first-child {
padding-left: 0; }
th:last-child,
td:last-child {
padding-right: 0; }
button,
.button {
margin-bottom: 1rem; }
input,
textarea,
select,
fieldset {
margin-bottom: 1.5rem; }
pre,
blockquote,
dl,
figure,
table,
p,
ul,
ol,
form {
margin-bottom: 1.0rem; }
.u-full-width {
width: 100%;
box-sizing: border-box; }
.u-max-full-width {
max-width: 100%;
box-sizing: border-box; }
.u-pull-right {
float: right; }
.u-pull-left {
float: left; }
hr {
margin-top: 3rem;
margin-bottom: 3.5rem;
border-width: 0;
border-top: 1px solid #E1E1E1; }
.container:after,
.row:after,
.u-cf {
content: "";
display: table;
clear: both; }
pre {
display: block;
padding: 9.5px;
margin: 0 0 10px;
font-size: 13px;
line-height: 1.42857143;
word-break: break-all;
word-wrap: break-word;
border: 1px solid #ccc;
border-radius: 4px;
}
pre.hljl {
margin: 0 0 10px;
display: block;
background: #f5f5f5;
border-radius: 4px;
padding : 5px;
}
pre.output {
background: #ffffff;
}
pre.code {
background: #ffffff;
}
pre.julia-error {
color : red
}
code,
kbd,
pre,
samp {
font-family: Menlo, Monaco, Consolas, "Courier New", monospace;
font-size: 0.9em;
}
@media (min-width: 400px) {}
@media (min-width: 550px) {}
@media (min-width: 750px) {}
@media (min-width: 1000px) {}
@media (min-width: 1200px) {}
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div.title {text-align: center;}
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h1 {counter-reset: h2counter;}
h2 {counter-reset: h3counter;}
h1.title:before {
content: none;
counter-increment: none;
}
h1:before {
content: counter(h1counter) "\0000a0-\0000a0";
counter-increment: h1counter;
}
h2:before {
content: counter(h1counter) "." counter(h2counter) "\0000a0-\0000a0";
counter-increment: h2counter;
}
h3:before {
content: counter(h1counter) "." counter(h2counter) "." counter(h3counter) "\0000a0-\0000a0";
counter-increment: h3counter;
}
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