From bdb676158a0444d6d590412fba5e4094d27db7ab Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: 40b967d450cc73a5ec8d086a42cb7ff3 Date: Tue, 2 Nov 2021 16:10:20 +0100 Subject: [PATCH] toy_document_orgmode_R_fr.org: Update --- module2/exo1/toy_document_orgmode_R_fr.org | 82 ++-------------------- 1 file changed, 4 insertions(+), 78 deletions(-) diff --git a/module2/exo1/toy_document_orgmode_R_fr.org b/module2/exo1/toy_document_orgmode_R_fr.org index 3d28af5..9a81598 100644 --- a/module2/exo1/toy_document_orgmode_R_fr.org +++ b/module2/exo1/toy_document_orgmode_R_fr.org @@ -1,6 +1,4 @@ -#+TITLE: À propos du calcul de \pi -#+AUTHOR: Arnaud Legrand -#+DATE: [21:51:00; 19.09.2018] +#+TITLE: À propos du calcul de $\pi$ #+LANGUAGE: fr # #+PROPERTY: header-args :eval never-export @@ -13,7 +11,7 @@ * En demandant à la lib maths -Mon ordinateur m'indique que \pi vaut /approximativement/ +Mon ordinateur m'indique que $\pi$ vaut /approximativement/ #+begin_src R :results output :session *R* :exports both pi #+end_src @@ -40,7 +38,7 @@ theta = pi/2*runif(N) * Avec un argument "fréquentiel" de surface Sinon, une méthode plus simple à comprendre et ne faisant pas -intervenir d'appel à la fonction sinus se base sur le fait que si X ~ U(0,1) et Y ~ U(0,1) alors P[X² + Y² <= 1] = \pi/4 (voir +intervenir d'appel à la fonction sinus se base sur le fait que si $X \sim U(0,1)$ et $Y \sim U(0,1)$ alors $P[X² + Y² \le 1] = \pi/4$ (voir [[https://fr.wikipedia.org/wiki/M%C3%A9thode_de_Monte-Carlo#D%C3%A9termination_de_la_valeur_de_%CF%80][méthode de Monte Carlo sur Wikipédia]]). Le code suivant illustre ce fait : @@ -57,7 +55,7 @@ ggplot(df, aes(x=X,y=Y,color=Accept)) + geom_point(alpha=.2) + coord_fixed() + t [[file:/tmp/babel-mEAAPj/figureTP5NNK.png]] Il est alors aisé d'obtenir une approximation (pas terrible) de \pi en -comptant combien de fois, en moyenne, X² + Y² est inférieur à 1 : +comptant combien de fois, en moyenne, $X² + Y²$ est inférieur à 1 : #+begin_src R :results output :session *R* :exports both 4*mean(df$Accept) @@ -65,75 +63,3 @@ comptant combien de fois, en moyenne, X² + Y² est inférieur à 1 : #+RESULTS: : [1] 3.156 - -* Quelques explications :noexport: - -Ceci est un document org-mode avec quelques exemples de code -R. Une fois ouvert dans emacs, ce document peut aisément être -exporté au format HTML, PDF, et Office. Pour plus de détails sur -org-mode vous pouvez consulter https://orgmode.org/guide/. - -Lorsque vous utiliserez le raccourci =C-c C-e h o=, ce document sera -compilé en html. Tout le code contenu sera ré-exécuté, les résultats -récupérés et inclus dans un document final. Si vous ne souhaitez pas -ré-exécuter tout le code à chaque fois, il vous suffit de supprimer -le # et l'espace qui sont devant le ~#+PROPERTY:~ au début de ce -document. - -Comme nous vous l'avons montré dans la vidéo, on inclut du code -R de la façon suivante (et on l'exécute en faisant ~C-c C-c~): - -#+begin_src R :results output :exports both -print("Hello world!") -#+end_src - -#+RESULTS: -: [1] "Hello world!" - -Voici la même chose, mais avec une session R (c'est le cas le -plus courant, R étant vraiment un langage interactif), donc une -persistance d'un bloc à l'autre (et on l'exécute toujours en faisant -~C-c C-c~). - -#+begin_src R :results output :session *R* :exports both -summary(cars) -#+end_src - -#+RESULTS: -: speed dist -: Min. : 4.0 Min. : 2.00 -: 1st Qu.:12.0 1st Qu.: 26.00 -: Median :15.0 Median : 36.00 -: Mean :15.4 Mean : 42.98 -: 3rd Qu.:19.0 3rd Qu.: 56.00 -: Max. :25.0 Max. :120.00 - -Et enfin, voici un exemple de sortie graphique: -#+begin_src R :results output graphics :file "./cars.png" :exports results :width 600 :height 400 :session *R* -plot(cars) -#+end_src - -#+RESULTS: -[[file:./cars.png]] - -Vous remarquerez le paramètre ~:exports results~ qui indique que le code -ne doit pas apparaître dans la version finale du document. Nous vous -recommandons dans le cadre de ce MOOC de ne pas changer ce paramètre -(indiquer ~both~) car l'objectif est que vos analyses de données soient -parfaitement transparentes pour être reproductibles. - -Attention, la figure ainsi générée n'est pas stockée dans le document -org. C'est un fichier ordinaire, ici nommé ~cars.png~. N'oubliez pas -de le committer si vous voulez que votre analyse soit lisible et -compréhensible sur GitLab. - -Enfin, pour les prochains exercices, nous ne vous fournirons pas -forcément de fichier de départ, ça sera à vous de le créer, par -exemple en repartant de ce document et de le commiter vers -gitlab. N'oubliez pas que nous vous fournissons dans les ressources de -ce MOOC une configuration avec un certain nombre de raccourcis -claviers permettant de créer rapidement les blocs de code R (en -faisant ~