From b0bc594bdc72ba78d2136f34fe85201c31f32414 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: 42eaffb07ab321885c173115fa1a5bf9 <42eaffb07ab321885c173115fa1a5bf9@app-learninglab.inria.fr> Date: Fri, 21 Oct 2022 15:07:15 +0000 Subject: [PATCH] Update exercice_R_fr.org --- module2/exo3/exercice_R_fr.org | 95 +++++++++++----------------------- 1 file changed, 31 insertions(+), 64 deletions(-) diff --git a/module2/exo3/exercice_R_fr.org b/module2/exo3/exercice_R_fr.org index 1bb8f61..97c7868 100644 --- a/module2/exo3/exercice_R_fr.org +++ b/module2/exo3/exercice_R_fr.org @@ -1,6 +1,6 @@ -#+TITLE: Votre titre -#+AUTHOR: Votre nom -#+DATE: La date du jour +#+TITLE: Graphes +#+AUTHOR: Lionel Sicot +#+DATE: 21/10/2022 #+LANGUAGE: fr # #+PROPERTY: header-args :eval never-export @@ -11,74 +11,41 @@ #+HTML_HEAD: #+HTML_HEAD: -* Quelques explications -Ceci est un document org-mode avec quelques exemples de code -R. Une fois ouvert dans emacs, ce document peut aisément être -exporté au format HTML, PDF, et Office. Pour plus de détails sur -org-mode vous pouvez consulter https://orgmode.org/guide/. - -Lorsque vous utiliserez le raccourci =C-c C-e h o=, ce document sera -compilé en html. Tout le code contenu sera ré-exécuté, les résultats -récupérés et inclus dans un document final. Si vous ne souhaitez pas -ré-exécuter tout le code à chaque fois, il vous suffit de supprimer -le # et l'espace qui sont devant le ~#+PROPERTY:~ au début de ce -document. - -Comme nous vous l'avons montré dans la vidéo, on inclut du code -R de la façon suivante (et on l'exécute en faisant ~C-c C-c~): - -#+begin_src R :results output :exports both -print("Hello world!") +#+begin_src R :results output :exports both :session *R* +c_data <- c(14.0, 7.6, 11.2, 12.8, 12.5, 9.9, 14.9, 9.4, 16.9, 10.2, 14.9, 18.1, +7.3, 9.8, 10.9,12.2, 9.9, 2.9, 2.8, 15.4, 15.7, 9.7, 13.1, 13.2, 12.3, 11.7, +16.0, 12.4, 17.9, 12.2, 16.2, 18.7, 8.9, 11.9, 12.1, 14.6, 12.1, 4.7, 3.9, 16.9, +16.8, 11.3, 14.4, 15.7, 14.0, 13.6, 18.0, 13.6, 19.9, 13.7, 17.0, 20.5, 9.9, +12.5, 13.2, 16.1, 13.5, 6.3, 6.4, 17.6, 19.1, 12.8, 15.5, 16.3, 15.2, 14.6, +19.1, 14.4, 21.4, 15.1, 19.6, 21.7, 11.3, 15.0, 14.3, 16.8, 14.0, 6.8, 8.2, +19.9, 20.4, 14.6, 16.4, 18.7, 16.8, 15.8, 20.4, 15.8, 22.4, 16.2, 20.3, 23.4, +12.1, 15.5, 15.4, 18.4, 15.7, 10.2, 8.9, 21.0) #+end_src -#+RESULTS: -: [1] "Hello world!" - -Voici la même chose, mais avec une session R (c'est le cas le -plus courant, R étant vraiment un langage interactif), donc une -persistance d'un bloc à l'autre (et on l'exécute toujours en faisant -~C-c C-c~). - -#+begin_src R :results output :session *R* :exports both -summary(cars) +#+BEGIN_SRC R :exports both :session *R* :results output graphics file :file plot.png + plot(c_data, las = 1, col = "blue", type = "l", + xlab = "", ylab = "", + xlim = c(0, 100), ylim = c(0, 25), + xaxs = "i", yaxs = "i") + abline(v = axTicks(1), col = "grey", lty = 2) + abline(h = axTicks(2), col = "grey", lty = 2) + box() #+end_src #+RESULTS: -: speed dist -: Min. : 4.0 Min. : 2.00 -: 1st Qu.:12.0 1st Qu.: 26.00 -: Median :15.0 Median : 36.00 -: Mean :15.4 Mean : 42.98 -: 3rd Qu.:19.0 3rd Qu.: 56.00 -: Max. :25.0 Max. :120.00 - -Et enfin, voici un exemple de sortie graphique: -#+begin_src R :results output graphics :file "./cars.png" :exports results :width 600 :height 400 :session *R* -plot(cars) +[[file:plot.png]] + +#+BEGIN_SRC R :exports both :session *R* :results output graphics file :file hist.png + hist(c_data, las = 1, col = "blue", type = "l", + xlab = "", ylab = "", main ="", + xlim = c(0, 25), ylim = c(0, 25), + xaxs = "i", yaxs = "i") + abline(v = axTicks(1), col = "grey", lty = 2) + abline(h = axTicks(2), col = "grey", lty = 2) + box() #+end_src #+RESULTS: -[[file:./cars.png]] - -Vous remarquerez le paramètre ~:exports results~ qui indique que le code -ne doit pas apparaître dans la version finale du document. Nous vous -recommandons dans le cadre de ce MOOC de ne pas changer ce paramètre -(indiquer ~both~) car l'objectif est que vos analyses de données soient -parfaitement transparentes pour être reproductibles. - -Attention, la figure ainsi générée n'est pas stockée dans le document -org. C'est un fichier ordinaire, ici nommé ~cars.png~. N'oubliez pas -de le committer si vous voulez que votre analyse soit lisible et -compréhensible sur GitLab. - -Enfin, pour les prochains exercices, nous ne vous fournirons pas -forcément de fichier de départ, ça sera à vous de le créer, par -exemple en repartant de ce document et de le commiter vers -gitlab. N'oubliez pas que nous vous fournissons dans les ressources de -ce MOOC une configuration avec un certain nombre de raccourcis -claviers permettant de créer rapidement les blocs de code R (en -faisant ~