Update journal/md2_doc_computationnel.md

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......@@ -73,7 +73,6 @@ Recherche reproductible = pouvoir aller dans les 2 sens
* inspecter
* refaire : vérifier, corriger, réutiliser
### Caractéristiques
* vitrine : comme un article au format pdf
* envers du décor : notebook jupyter par exemple
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## Présentation des outils
### Jupyter
### OrgMode
* permet de combiner différents langages
* langage de balisage léger
......@@ -100,27 +102,28 @@ Recherche reproductible = pouvoir aller dans les 2 sens
#### Exécution des blocs
* template pour différens langages
* template pour différens langages (r, python, shell)
* exemple `<r >` pour langage r
* blocs pour des sorties textuels et blocs pour des sorties graphiques
* insepecter les buffer pour voir les consoles actives
* insepecter les buffer pour voir les consoles actives dans les différents langages
* attention il peut y avoir des incohérences si on modifie les données puis qu'on rééxécute la session
* __tout rééexécuter depuis le début__
* commandes
* CTRL C CTRL C pour exécuter
* `alt-x org-babel-execute-buffer` : ré-éxécuter le la session
* `CTRL C CTRL C` pour exécuter un bloc
* `alt-x org-babel-execute-buffer` : ré-éxécuter la session au complet
* `ho` : exporter en html
* `C-c C-q noexport enter` : exclure toute une section de l'export
* avoir plusieurs langages avec template
* commandes shell aussi
* avec l'historique riche de la session =>on peut faire du ssh dedans !
* avec l'historique riche de la session =>on peut faire du ssh dedans ! se connecter à d'autres machines !
* plusieurs sessions possibles
#### Production et partage du document final
* attention au stockage penser aussi à stocker les fichiers produits
* une solution juste pour voir contenu : exporter html ou pdf
* contrôler la visibilité
* contrôler la visibilité (stocker aussi les fichiers produits si on veut permettre aux autres de voir)
* `export results` VS `export both`
* __difficulté/ avantage principal : maîtriser les raccourcis clavier !!__
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