diff --git a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.org b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.org index 1720b70df3a93009c79592b68d1dcf57a53f6341..d3f83bb8074d73dc880466ac4f39f95726af30d3 100644 --- a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.org +++ b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.org @@ -64,7 +64,15 @@ Voici l'explication des colonnes donnée sur [[https://ns.sentiweb.fr/incidence/ L'indication d'une semaine calendaire en format [[https://en.wikipedia.org/wiki/ISO_8601][ISO-8601]] est populaire en Europe, mais peu utilisée aux Etats-Unis. Ceci explique peut-être que peu de logiciels savent gérer ce format. Le langage Python le fait depuis la version 3.6. Nous utilisons donc ce langage pour la préparation de nos données, ce qui a l'avantage de ne nécessiter aucune bibliothèque supplémentaire. (Note: nous expliquerons dans le module 4 pourquoi il est avantageux pour la réproductibilité de se limiter à un minimum de bibliothèques.) ** Téléchargement -Après avoir téléchargé les données, nous commençons par l'extraction des données qui nous intéressent. D'abord nous découpons le contenu du fichier en lignes, dont nous jetons la première qui ne contient qu'un commentaire. Les autres lignes sont découpées en colonnes. +Pour nous protéger contre une éventuelle disparition ou modification du serveur du Réseau Sentinelles, nous faisons une copie locale de ce jeux de données que nous préservons avec notre analyse. Il est inutile et même risquée de télécharger les données à chaque exécution, car dans le cas d'une panne nous pourrions remplacer nos données par un fichier défectueux. Pour cette raison, nous téléchargeons les données seulement si la copie locale n'existe pas. +#+BEGIN_SRC python :results output :var data_url=data-url +data_file = "syndrome-grippal.csv" +import os +import urllib.request +if not os.path.exists(data_file): + urllib.request.urlretrieve(data_url, data_file) +#+END_SRC +Nous commençons le traitement par l'extraction des données qui nous intéressent. D'abord nous découpons le contenu du fichier en lignes, dont nous jetons la première qui ne contient qu'un commentaire. Les autres lignes sont découpées en colonnes. #+BEGIN_SRC python :results silent :var data_url=data-url from urllib.request import urlopen