diff --git a/module1/MonJournalDeBord_MOOC_RR.md b/module1/MonJournalDeBord_MOOC_RR.md index 98467c7d38bd52a1bbd4fb5c4a4c1457d2537779..0a162ac15670bc9c6ce50b62694a5dccf1dba5bd 100644 --- a/module1/MonJournalDeBord_MOOC_RR.md +++ b/module1/MonJournalDeBord_MOOC_RR.md @@ -99,3 +99,25 @@ Quiz : !! LibreOffice permet de comparer deux versions successives d’un même https://app-learninglab.inria.fr/moocrr/gitlab/learning-lab/mooc-rr-exo1/blob/master/module1/exo1/aebef6b0a5.txt https://app-learninglab.inria.fr/moocrr/gitlab/learning-lab/mooc-rr-exo1/blob/master/module1/exo1/f683bbad4b.txt + +## Module 2 - La vitrine et l'envers du décor : le document computationnel + +améliorer la traçabilité d'un calcul / présentation des travaux / accès aux calculs sous-jacents à l'analyse + +1. **Exemples récents d'études assez discutées** + +2. **Pourquoi est-ce difficile?** + +- Données non disponibles= résultats difficiles à vérifier +- Choix non expliqués = choix suspicieux +- Ordinateur permet d'aller plus vite, mais sources d'erreur, erreur de programmation et de manipulation de données +- Important de savoir si chaque brique de l'analyse est digne de confiance +- Open data mais risque divulgation données sensibles, quota stockage dépassé + +3. **Le document computationnel : principe** + +- Jypyter : principalement pour code Python +- Rstudio/knitR : plus adapté au code R +- Org mode/Emacs : utilisé par les formateurs inria, plus complexe à mettre en oeuvre +- contenu du doc computationnel (**notebook**) : explications / code / résultats ; permettant inspection et réexécution +- console Python ou R assure que les variables sont persistentes d'un fragment de code à un autre