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715d998f42c58555b2fbdb5aca4064cb
mooc-rr
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852bb21f
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852bb21f
authored
Jul 21, 2020
by
715d998f42c58555b2fbdb5aca4064cb
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exercice_R_fr.org
module2/exo2/exercice_R_fr.org
+17
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No files found.
module2/exo2/exercice_R_fr.org
View file @
852bb21f
#+TITLE:
Votre titr
e
#+TITLE:
Calcul Simpl
e
#+AUTHOR:
Votre nom
#+AUTHOR:
Guilain Leduc
#+DATE:
La date du jour
#+DATE:
21 juillet 2020
#+LANGUAGE: fr
#+LANGUAGE: fr
#
#+PROPERTY: header-args :eval never-export
#
+PROPERTY: header-args :session :exports both
#+HTML_HEAD: <link rel="stylesheet" type="text/css" href="http://www.pirilampo.org/styles/readtheorg/css/htmlize.css"/>
#+HTML_HEAD: <link rel="stylesheet" type="text/css" href="http://www.pirilampo.org/styles/readtheorg/css/htmlize.css"/>
#+HTML_HEAD: <link rel="stylesheet" type="text/css" href="http://www.pirilampo.org/styles/readtheorg/css/readtheorg.css"/>
#+HTML_HEAD: <link rel="stylesheet" type="text/css" href="http://www.pirilampo.org/styles/readtheorg/css/readtheorg.css"/>
...
@@ -11,74 +11,20 @@
...
@@ -11,74 +11,20 @@
#+HTML_HEAD: <script type="text/javascript" src="http://www.pirilampo.org/styles/lib/js/jquery.stickytableheaders.js"></script>
#+HTML_HEAD: <script type="text/javascript" src="http://www.pirilampo.org/styles/lib/js/jquery.stickytableheaders.js"></script>
#+HTML_HEAD: <script type="text/javascript" src="http://www.pirilampo.org/styles/readtheorg/js/readtheorg.js"></script>
#+HTML_HEAD: <script type="text/javascript" src="http://www.pirilampo.org/styles/readtheorg/js/readtheorg.js"></script>
* Quelques explications
#+begin_src python :results output :exports both
import numpy as np
Ceci est un document org-mode avec quelques exemples de code
data= np.array([14.0, 7.6, 11.2, 12.8, 12.5, 9.9, 14.9, 9.4, 16.9, 10.2, 14.9, 18.1, 7.3, 9.8, 10.9,12.2, 9.9, 2.9, 2.8, 15.4, 15.7, 9.7, 13.1, 13.2, 12.3, 11.7, 16.0, 12.4, 17.9, 12.2, 16.2, 18.7, 8.9, 11.9, 12.1, 14.6, 12.1, 4.7, 3.9, 16.9, 16.8, 11.3, 14.4, 15.7, 14.0, 13.6, 18.0, 13.6, 19.9, 13.7, 17.0, 20.5, 9.9, 12.5, 13.2, 16.1, 13.5, 6.3, 6.4, 17.6, 19.1, 12.8, 15.5, 16.3, 15.2, 14.6, 19.1, 14.4, 21.4, 15.1, 19.6, 21.7, 11.3, 15.0, 14.3, 16.8, 14.0, 6.8, 8.2, 19.9, 20.4, 14.6, 16.4, 18.7, 16.8, 15.8, 20.4, 15.8, 22.4, 16.2, 20.3, 23.4, 12.1, 15.5, 15.4, 18.4, 15.7, 10.2, 8.9, 21.0])
R. Une fois ouvert dans emacs, ce document peut aisément être
print("Moyenne : ", round( data.mean(),2))
exporté au format HTML, PDF, et Office. Pour plus de détails sur
print("Min : ", round(min(data),2))
org-mode vous pouvez consulter https://orgmode.org/guide/.
print("Max : ", round(max(data),2))
print("Médiane : ", round(np.median(data),2))
Lorsque vous utiliserez le raccourci =C-c C-e h o=, ce document sera
print("Ecart-Type : ", round(np.std(data, ddof=1),2))
compilé en html. Tout le code contenu sera ré-exécuté, les résultats
récupérés et inclus dans un document final. Si vous ne souhaitez pas
ré-exécuter tout le code à chaque fois, il vous suffit de supprimer
le # et l'espace qui sont devant le ~#+PROPERTY:~ au début de ce
document.
Comme nous vous l'avons montré dans la vidéo, on inclut du code
R de la façon suivante (et on l'exécute en faisant ~C-c C-c~):
#+begin_src R :results output :exports both
print("Hello world!")
#+end_src
#+RESULTS:
: [1] "Hello world!"
Voici la même chose, mais avec une session R (c'est le cas le
plus courant, R étant vraiment un langage interactif), donc une
persistance d'un bloc à l'autre (et on l'exécute toujours en faisant
~C-c C-c~).
#+begin_src R :results output :session *R* :exports both
summary(cars)
#+end_src
#+end_src
#+RESULTS:
#+RESULTS:
: speed dist
: Moyenne : 14.11
: Min. : 4.0 Min. : 2.00
: Min : 2.8
: 1st Qu.:12.0 1st Qu.: 26.00
: Max : 23.4
: Median :15.0 Median : 36.00
: Médiane : 14.5
: Mean :15.4 Mean : 42.98
: Ecart-Type : 4.33
: 3rd Qu.:19.0 3rd Qu.: 56.00
\ No newline at end of file
: Max. :25.0 Max. :120.00
Et enfin, voici un exemple de sortie graphique:
#+begin_src R :results output graphics :file "./cars.png" :exports results :width 600 :height 400 :session *R*
plot(cars)
#+end_src
#+RESULTS:
[[file:./cars.png]]
Vous remarquerez le paramètre ~:exports results~ qui indique que le code
ne doit pas apparaître dans la version finale du document. Nous vous
recommandons dans le cadre de ce MOOC de ne pas changer ce paramètre
(indiquer ~both~) car l'objectif est que vos analyses de données soient
parfaitement transparentes pour être reproductibles.
Attention, la figure ainsi générée n'est pas stockée dans le document
org. C'est un fichier ordinaire, ici nommé ~cars.png~. N'oubliez pas
de le committer si vous voulez que votre analyse soit lisible et
compréhensible sur GitLab.
Enfin, pour les prochains exercices, nous ne vous fournirons pas
forcément de fichier de départ, ça sera à vous de le créer, par
exemple en repartant de ce document et de le commiter vers
gitlab. N'oubliez pas que nous vous fournissons dans les ressources de
ce MOOC une configuration avec un certain nombre de raccourcis
claviers permettant de créer rapidement les blocs de code R (en
faisant ~<r~ ou ~<R~ suivi de ~Tab~).
Maintenant, à vous de jouer! Vous pouvez effacer toutes ces
informations et les remplacer par votre document computationnel.
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