diff --git a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd index 771e78faac371f23c921f7f7aecc87f2100e9059..52cc5fe9721c6a0953d990a201e2c376f694ac2b 100644 --- a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd +++ b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd @@ -21,10 +21,9 @@ knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE) ## Préparation des données -Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. L'URL est: -```{r} -data_url = "http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv" -``` +Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. +L'URL qui nous a permis de télécharger les données est accessible : [ici](https://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv) + Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://ns.sentiweb.fr/incidence/csv-schema-v1.json): @@ -44,7 +43,7 @@ Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https:// La première ligne du fichier CSV est un commentaire, que nous ignorons en précisant `skip=1`. ### Téléchargement ```{r} -data = read.csv(data_url, skip=1) +data = read.csv(file = 'C:/Users/utilisateur/Downloads/incidence-PAY-3.csv', skip=1) ``` Regardons ce que nous avons obtenu: @@ -161,3 +160,5 @@ Enfin, un histogramme montre bien que les épidémies fortes, qui touchent envir ```{r} hist(inc_annuelle$incidence, breaks=10, xlab="Incidence annuelle", ylab="Nb d'observations", main="") ``` + +```