diff --git a/journal/module2-comparaison-outils.md b/journal/module2-comparaison-outils.md index e69de29bb2d1d6434b8b29ae775ad8c2e48c5391..9b797ef683ddcc928f2c930086a8f7089ad01f2c 100644 --- a/journal/module2-comparaison-outils.md +++ b/journal/module2-comparaison-outils.md @@ -0,0 +1,64 @@ +# Vidéo : Analyse comparée des différents outils + +## Un cours ou un tutoriel + +Un notebook Jupyter est un document dynamique, facile à prendre en main. + +## Un journal + +Journal en org-mode : prise de notes sur les réunions, le code, etc. + +- un seul auteur +- organisation chronologique +- étiquettes sur chaque entrée ; très faciles à filtrer sur OrgMode +- contient : notes, liens, codes (pour éventuellement pouvoir le réutiliser plus tard) + +## Cahier de laboratoire en org-mode + +Ici : cahier de labo informatique +Sections : +- expériences +- analyses + +Au sein de ces sections : organisation dans l'ordre chronologique + +## Un article reproductible + +Utilisation de org-mode +Permet d'avoir : +- plusieurs auteurs +- régénération des figures +- permet au lecteur averti de revenir aux sources + +## Conclusion de la vidéo ... + +Utilisation de Rstudio/knitr facile, mais navigation limitée. Ecriture d'un article : possible. +Org-Mode : utilisation plus complexe, mais navigation puissante. Pas spécifique d'un langage particulier. +Jupyter : environnement web, très facile d'accès + +**L 'outil importe peu** : ce qui importe c'est : +- collecter l'information +- l'organiser et la rendre exploitable +- la rendre disponible + +Mais ces trois environnements sont matures. + +## Notes d'après les questions + +Ces trois environnements fonctionnement sur tous les systèmes d'exploitations. +Jupyter, OrgMode et Rstudio se distinguent par : +a. La facilité d’installation et de prise en main +b. L’année de création et le langage sous-jacent +c. La capacité à rédiger des documents respectant un style bien spécifique et prêt à la soumission à un journal ou une conférence +d. Le format de fichier utilisé (JSON pour Jupyter, Rmd pour Rstudio, Org pour Org-Mode) + +L'utilisation de l'un ou de l'autre des trois documents se justifie par : +- le type de document que l'on souhaite rédiger +- le public amené à l'utiliser + +Pour que l'information d'un document computationnel soit exploitable, il est important de : +Gérer le document à l’aide d’un gestionnaire de version +a. Structurer le document pour le rendre le plus lisible possible +b. Expliquer en langage naturel l’idée générale derrière un calcul ainsi que pourquoi on prend telle ou telle décision de calcul +c. Utiliser des mots-clés pour faciliter l’indexation et la navigation +d. Réfléchir à qui l’information s’adresse \ No newline at end of file