Commit a94d4ae6 authored by Valentin Mathieu's avatar Valentin Mathieu

Exercice module 2

parent 76aa2de2
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title: "Votre titre" title: "Savoir faire un calcul simple soi-même"
author: "Votre nom" author: "Valentin Mathieu"
date: "La date du jour" date: "01 Mars 2024"
output: html_document output: html_document
--- ---
...@@ -10,24 +10,20 @@ output: html_document ...@@ -10,24 +10,20 @@ output: html_document
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE) knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
``` ```
## Quelques explications ## Création d'un vecteur
Ceci est un document R markdown que vous pouvez aisément exporter au format HTML, PDF, et MS Word. Pour plus de détails sur R Markdown consultez <http://rmarkdown.rstudio.com>. Stockage des données dans un vecteur numérique appelé *data* :
Lorsque vous cliquerez sur le bouton **Knit** ce document sera compilé afin de ré-exécuter le code R et d'inclure les résultats dans un document final. Comme nous vous l'avons montré dans la vidéo, on inclue du code R de la façon suivante: ```{r}
data <- c(14.0, 7.6, 11.2, 12.8, 12.5, 9.9, 14.9, 9.4, 16.9, 10.2, 14.9, 18.1, 7.3, 9.8, 10.9,12.2, 9.9, 2.9, 2.8, 15.4, 15.7, 9.7, 13.1, 13.2, 12.3, 11.7, 16.0, 12.4, 17.9, 12.2, 16.2, 18.7, 8.9, 11.9, 12.1, 14.6, 12.1, 4.7, 3.9, 16.9, 16.8, 11.3, 14.4, 15.7, 14.0, 13.6, 18.0, 13.6, 19.9, 13.7, 17.0, 20.5, 9.9, 12.5, 13.2, 16.1, 13.5, 6.3, 6.4, 17.6, 19.1, 12.8, 15.5, 16.3, 15.2, 14.6, 19.1, 14.4, 21.4, 15.1, 19.6, 21.7, 11.3, 15.0, 14.3, 16.8, 14.0, 6.8, 8.2, 19.9, 20.4, 14.6, 16.4, 18.7, 16.8, 15.8, 20.4, 15.8, 22.4, 16.2, 20.3, 23.4, 12.1, 15.5, 15.4, 18.4, 15.7, 10.2, 8.9, 21.0)
```{r cars}
summary(cars)
``` ```
Et on peut aussi aisément inclure des figures. Par exemple: ## Calcul sur les données
```{r pressure, echo=FALSE}
plot(pressure)
```
Vous remarquerez le paramètre `echo = FALSE` qui indique que le code ne doit pas apparaître dans la version finale du document. Nous vous recommandons dans le cadre de ce MOOC de ne pas utiliser ce paramètre car l'objectif est que vos analyses de données soient parfaitement transparentes pour être reproductibles. Statistiques descriptives sur le jeu de données :
Comme les résultats ne sont pas stockés dans les fichiers Rmd, pour faciliter la relecture de vos analyses par d'autres personnes, vous aurez donc intérêt à générer un HTML ou un PDF et à le commiter. ```{r}
summary(data)
sd(data)
```
Maintenant, à vous de jouer! Vous pouvez effacer toutes ces informations et les remplacer par votre document computationnel.
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title: "Votre titre" title: "Réaliser un affichage graphique"
author: "Votre nom" author: "Valentin Mathieu"
date: "La date du jour" date: "01 Mars 2024"
output: html_document output: html_document
--- ---
...@@ -10,24 +10,33 @@ output: html_document ...@@ -10,24 +10,33 @@ output: html_document
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE) knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
``` ```
## Quelques explications ## Création d'un vecteur
Ceci est un document R markdown que vous pouvez aisément exporter au format HTML, PDF, et MS Word. Pour plus de détails sur R Markdown consultez <http://rmarkdown.rstudio.com>. Stockage des données dans un vecteur numérique appelé *data* :
Lorsque vous cliquerez sur le bouton **Knit** ce document sera compilé afin de ré-exécuter le code R et d'inclure les résultats dans un document final. Comme nous vous l'avons montré dans la vidéo, on inclue du code R de la façon suivante: ```{r}
data <- c(14.0, 7.6, 11.2, 12.8, 12.5, 9.9, 14.9, 9.4, 16.9, 10.2, 14.9, 18.1, 7.3, 9.8, 10.9,12.2, 9.9, 2.9, 2.8, 15.4, 15.7, 9.7, 13.1, 13.2, 12.3, 11.7, 16.0, 12.4, 17.9, 12.2, 16.2, 18.7, 8.9, 11.9, 12.1, 14.6, 12.1, 4.7, 3.9, 16.9, 16.8, 11.3, 14.4, 15.7, 14.0, 13.6, 18.0, 13.6, 19.9, 13.7, 17.0, 20.5, 9.9, 12.5, 13.2, 16.1, 13.5, 6.3, 6.4, 17.6, 19.1, 12.8, 15.5, 16.3, 15.2, 14.6, 19.1, 14.4, 21.4, 15.1, 19.6, 21.7, 11.3, 15.0, 14.3, 16.8, 14.0, 6.8, 8.2, 19.9, 20.4, 14.6, 16.4, 18.7, 16.8, 15.8, 20.4, 15.8, 22.4, 16.2, 20.3, 23.4, 12.1, 15.5, 15.4, 18.4, 15.7, 10.2, 8.9, 21.0)
data_df <- data.frame(data)
```
Création des valeurs en abscisse pour les plots
```{r cars} ```{r}
summary(cars) x <- seq(0, length(data)-1)
``` ```
Et on peut aussi aisément inclure des figures. Par exemple: ## Séquence plot
```{r pressure, echo=FALSE} ```{r}
plot(pressure) library(ggplot2)
ggplot(data = data_df, aes(x = x, y=data_df))+geom_line(color = "blue")
``` ```
Vous remarquerez le paramètre `echo = FALSE` qui indique que le code ne doit pas apparaître dans la version finale du document. Nous vous recommandons dans le cadre de ce MOOC de ne pas utiliser ce paramètre car l'objectif est que vos analyses de données soient parfaitement transparentes pour être reproductibles. ## Histogramme
Comme les résultats ne sont pas stockés dans les fichiers Rmd, pour faciliter la relecture de vos analyses par d'autres personnes, vous aurez donc intérêt à générer un HTML ou un PDF et à le commiter. ```{r}
#library(ggplot2)
#ggplot(data = data_df, aes(x=data_df))+geom_histogram(color = "blue")
hist(data, breaks = 8, xlim = c(0, 25), ylim = c(0,25), col = "blue")
```
Maintenant, à vous de jouer! Vous pouvez effacer toutes ces informations et les remplacer par votre document computationnel.
...@@ -42,7 +42,7 @@ dysfonctionnements, nous nous concentrons sur les expériences où au ...@@ -42,7 +42,7 @@ dysfonctionnements, nous nous concentrons sur les expériences où au
moins un joint a été défectueux. moins un joint a été défectueux.
```{r} ```{r}
data = data[data$Malfunction>0,] #data = data[data$Malfunction>0,]
data data
``` ```
...@@ -70,7 +70,7 @@ $p=p(t)$. Pour relier $p(t)$ à $t$, on va donc effectuer une ...@@ -70,7 +70,7 @@ $p=p(t)$. Pour relier $p(t)$ à $t$, on va donc effectuer une
régression logistique. régression logistique.
```{r} ```{r}
logistic_reg = glm(data=data, Malfunction/Count ~ Temperature, weights=Count, logistic_reg = glm(data=data, formula = Malfunction/Count ~ Temperature, weights=Count,
family=binomial(link='logit')) family=binomial(link='logit'))
summary(logistic_reg) summary(logistic_reg)
``` ```
......
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