From 73a21cbcdddb1a1abc35fa6af8cf7d7b10c39e66 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Lana Scravaglieri Date: Fri, 10 Nov 2023 11:21:08 +0100 Subject: [PATCH] Exo 4 --- module2/exo4/data.csv | 1 + module2/exo4/exercice_python_fr.org | 114 ++++++++++++---------------- 2 files changed, 51 insertions(+), 64 deletions(-) create mode 100644 module2/exo4/data.csv diff --git a/module2/exo4/data.csv b/module2/exo4/data.csv new file mode 100644 index 0000000..2de2fe9 --- /dev/null +++ b/module2/exo4/data.csv @@ -0,0 +1 @@ +14.0,7.6,11.2,12.8,12.5,9.9,14.9,9.4,16.9,10.2,14.9,18.1,7.3,9.8,10.9,12.2,9.9,2.9,2.8,15.4,15.7,9.7,13.1,13.2,12.3,11.7,16.0,12.4,17.9,12.2,16.2,18.7,8.9,11.9,12.1,14.6,12.1,4.7,3.9,16.9,16.8,11.3,14.4,15.7,14.0,13.6,18.0,13.6,19.9,13.7,17.0,20.5,9.9,12.5,13.2,16.1,13.5,6.3,6.4,17.6,19.1,12.8,15.5,16.3,15.2,14.6,19.1,14.4,21.4,15.1,19.6,21.7,11.3,15.0,14.3,16.8,14.0,6.8,8.2,19.9,20.4,14.6,16.4,18.7,16.8,15.8,20.4,15.8,22.4,16.2,20.3,23.4,12.1,15.5,15.4,18.4,15.7,10.2,8.9,21.0 diff --git a/module2/exo4/exercice_python_fr.org b/module2/exo4/exercice_python_fr.org index c7157ba..7a0c48d 100644 --- a/module2/exo4/exercice_python_fr.org +++ b/module2/exo4/exercice_python_fr.org @@ -1,6 +1,6 @@ -#+TITLE: Votre titre -#+AUTHOR: Votre nom -#+DATE: La date du jour +#+TITLE: Exo 4 +#+AUTHOR: Lana Huong Scravaglieri +#+DATE: 2023-11-09 #+LANGUAGE: fr # #+PROPERTY: header-args :eval never-export @@ -11,83 +11,69 @@ #+HTML_HEAD: #+HTML_HEAD: -* Quelques explications +* Get data -Ceci est un document org-mode avec quelques exemples de code -python. Une fois ouvert dans emacs, ce document peut aisément être -exporté au format HTML, PDF, et Office. Pour plus de détails sur -org-mode vous pouvez consulter https://orgmode.org/guide/. +#+begin_src python :results output :session :exports both +import numpy as np -Lorsque vous utiliserez le raccourci =C-c C-e h o=, ce document sera -compilé en html. Tout le code contenu sera ré-exécuté, les résultats -récupérés et inclus dans un document final. Si vous ne souhaitez pas -ré-exécuter tout le code à chaque fois, il vous suffit de supprimer -le # et l'espace qui sont devant le ~#+PROPERTY:~ au début de ce -document. +data = np.loadtxt("data.csv", delimiter=",", dtype=float) +#+end_src -Comme nous vous l'avons montré dans la vidéo, on inclue du code -python de la façon suivante (et on l'exécute en faisant ~C-c C-c~): +#+RESULTS: -#+begin_src python :results output :exports both -print("Hello world!") +* Basic statistics + +#+begin_src python :results output :session :exports both +print("Mean : ", np.mean(data)) +print("Std : ", np.std(data, ddof=1)) +print("Min : ", np.min(data)) +print("Median : ", np.median(data)) +print("Max : ", np.max(data)) #+end_src #+RESULTS: -: Hello world! +: Mean : 14.113000000000001 +: Std : 4.334094455301447 +: Min : 2.8 +: Median : 14.5 +: Max : 23.4 -Voici la même chose, mais avec une session python, donc une -persistance d'un bloc à l'autre (et on l'exécute toujours en faisant -~C-c C-c~). -#+begin_src python :results output :session :exports both -import numpy -x=numpy.linspace(-15,15) -print(x) +* Graphs + +** Sequence plot + +#+begin_src python :results file :session :exports both :var fname="seq-plot.png" +import matplotlib.pyplot as plt +import seaborn as sb + +x = np.linspace(0,data.size, 100) + +plt.figure(figsize=(10,5)) +sb.lineplot(x=x, y=data) +plt.tight_layout() + +plt.savefig(fname) +plt.close() +fname #+end_src #+RESULTS: -#+begin_example -[-15. -14.3877551 -13.7755102 -13.16326531 -12.55102041 - -11.93877551 -11.32653061 -10.71428571 -10.10204082 -9.48979592 - -8.87755102 -8.26530612 -7.65306122 -7.04081633 -6.42857143 - -5.81632653 -5.20408163 -4.59183673 -3.97959184 -3.36734694 - -2.75510204 -2.14285714 -1.53061224 -0.91836735 -0.30612245 - 0.30612245 0.91836735 1.53061224 2.14285714 2.75510204 - 3.36734694 3.97959184 4.59183673 5.20408163 5.81632653 - 6.42857143 7.04081633 7.65306122 8.26530612 8.87755102 - 9.48979592 10.10204082 10.71428571 11.32653061 11.93877551 - 12.55102041 13.16326531 13.7755102 14.3877551 15. ] -#+end_example - -Et enfin, voici un exemple de sortie graphique: -#+begin_src python :results output file :session :var matplot_lib_filename="./cosxsx.png" :exports results +[[file:seq-plot.png]] + + +** Frequency plot + +#+begin_src python :results file :session :exports both :var fname="hist-plot.png" import matplotlib.pyplot as plt plt.figure(figsize=(10,5)) -plt.plot(x,numpy.cos(x)/x) +sb.histplot(data=data) plt.tight_layout() -plt.savefig(matplot_lib_filename) -print(matplot_lib_filename) +plt.savefig(fname) +plt.close() +fname #+end_src #+RESULTS: -[[file:./cosxsx.png]] - -Vous remarquerez le paramètre ~:exports results~ qui indique que le code -ne doit pas apparaître dans la version finale du document. Nous vous -recommandons dans le cadre de ce MOOC de ne pas changer ce paramètre -(indiquer ~both~) car l'objectif est que vos analyses de données soient -parfaitement transparentes pour être reproductibles. - -Attention, la figure ainsi générée n'est pas stockée dans le document -org. C'est un fichier ordinaire, ici nommé ~cosxsx.png~. N'oubliez pas -de le committer si vous voulez que votre analyse soit lisible et -compréhensible sur GitLab. - -Enfin, n'oubliez pas que nous vous fournissons dans les ressources de -ce MOOC une configuration avec un certain nombre de raccourcis -claviers permettant de créer rapidement les blocs de code python (en -faisant ~