diff --git a/documents/tuto_jupyter_windows/tuto_jupyter_windows_v2.html b/documents/tuto_jupyter_windows/tuto_jupyter_windows_v2.html deleted file mode 100644 index bca9bfcdf7c60262357969c91aa39ee8955e8ca9..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/documents/tuto_jupyter_windows/tuto_jupyter_windows_v2.html +++ /dev/null @@ -1,554 +0,0 @@ - - - - - - - - - - - - - -Tuto Jupyter Windows - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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https://gitlab.inria.fr/learninglab/mooc-rr/mooc-rr-ressources/blob/master/module2/ressources/jupyter_fr.org

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FUN : Jupyter : trucs et astuces, Installation et configuration

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1 Installer Python

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La façon de procéder est très bien expliquée ici.

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2 Installer le package Jupyter

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pip install jupyter
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NB : Le raccourci ^v ne fonctionne pas dans l’invite de commande dos. La fonction “coller” est disponible avec le bouton droit de la souris.

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3 Lancer Jupyper

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jupyter notebook
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4 Autres langages

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Jupyper permet par défaut d’exécuter du code Python. Des packages permettent d’exécuter d’autres langages.

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4.1 Le package R IRkernel permet d’exécuter du code R dans un notebook R

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  • Lancer R ou RStudio

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  • Installer le package IRkernel

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install.packages("IRkernel",dep=TRUE)
-IRkernel::installspec()  # to register the kernel in the current R installation
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> packageVersion("IRkernel")
-[1] ‘1.1’
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Anciennement :

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  • Installer le package devtools
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install.packages('devtools',dep=TRUE)
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  • Définir le proxy le cas échéant
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library(httr)
-set_config(use_proxy(url="proxy", port=80, username="username", password="password"))
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  • Installer IRkernel
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devtools::install_github('IRkernel/IRkernel')
-IRkernel::installspec()  # to register the kernel in the current R installation
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4.2 Le package Python rpy2 permet d’exécuter du code R dans un notebook Python

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  • Le package rpy2 s’installe difficilement par méthode standard.

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  • Télécharger le fichier binaire qui correspond au système d’exploitation ici

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  • Ouvrir une invite de commande dos

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  • Se placer dans le dossier de télécharment

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  • Exécuter la commande suivante

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python -m pip install rpy2‑2.9.4‑cp37‑cp37m‑win_amd64.whl # adapter le nom du fichier
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  • Lancer Jupiter et créer un notebook Python

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  • Exécuter la commande suivante

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%load_ext rpy2.ipython
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NB : Je n’ai pas eu besoin de définir les variables d’environnement R_HOME et R_USER.

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4.3 Le package Python SASKernel permet d’exécuter du code SAS dans un notebook SAS

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  • Installer le package sas_kernel à l’aide de la commande pip

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  • Modifier le fichier C:\Program Files\Python\Python37\Lib\site-packages\saspy\sascfg_sav.py pour l’adapter à votre système

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Dans les deux images ci-dessous, la fenêtre de gauche correspond au fichier initial et celle de droite au fichier modifié.

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sascfg1

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sascfg2

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  • Problèmes rencontrés
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Pandas module not available.
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–> Installer le package pandas à l’aide de la commande pip

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Attempted to run program C:\\Program Files\\SASHome\\SASPrivateJavaRuntimeEnvironment\\9.4\\jrin\\java
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–> Vérifier que tous les antislashs sont doublés

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Be sure the path to sspiauth.dll is in your System PATH
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–> Ajouter le chemin C:\Program Files\SASHOME\SASFoundation\9.4\core\sasext dans la variable PATH de Windows

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4.4 Le package Python SASPy permet d’exécuter du code SAS dans un notebook Python

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  • Installer le package saspy à l’aide de la commande pip
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