diff --git a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd index 82f5e373ba9fd04dc45cccc61228719752531bb0..d5e3520c76af3359c09d5e2d1fa5fb69d9f7bdd2 100644 --- a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd +++ b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd @@ -26,6 +26,15 @@ Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du data_url = "http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv" ``` +Je télécharge une copie locale du fichier pour éviter de le télécharger à chaque fois qu'on lance le script et pour éviter les problèmes si la version en ligne est modifiée. +Je télécharge le fichier depuis Internet si la copie locale n'existe pas. +```{r} +data_file = "incidence-PAY-3.csv" +if (!file.exists(data_file)) { + download.file(data_url, data_file, method="auto") +} +``` + Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://ns.sentiweb.fr/incidence/csv-schema-v1.json): | Nom de colonne | Libellé de colonne | @@ -42,9 +51,9 @@ Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https:// | `geo_name` | Libellé de la zone géographique (ce libellé peut être modifié sans préavis) | La première ligne du fichier CSV est un commentaire, que nous ignorons en précisant `skip=1`. -### Téléchargement +### Lecture ```{r} -data = read.csv("D:/MOOC Reproductibilité de la recherche/incidence-PAY-3.csv", skip=1) +data = read.csv(data_file, skip=1) ``` Regardons ce que nous avons obtenu: