diff --git a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd index 771e78faac371f23c921f7f7aecc87f2100e9059..731e0ad8d584bd50865becf4981a8b5419c5fa83 100644 --- a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd +++ b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd @@ -23,7 +23,7 @@ knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE) Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. L'URL est: ```{r} -data_url = "http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv" +data_url = "http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv" ``` Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://ns.sentiweb.fr/incidence/csv-schema-v1.json): @@ -45,7 +45,12 @@ La première ligne du fichier CSV est un commentaire, que nous ignorons en préc ### Téléchargement ```{r} data = read.csv(data_url, skip=1) +setwd("~/Desktop/FUN MOOC 2020/recherche reproductible") +data1 = read.csv2("etat_grippal.csv") #données téléchargées à la date 16 avril 2020 à comparer avec les données de l'url + ``` +Si data1=data alors ne rien changer au script. mais si data1 est différent de data alors remplacer "data1" par "data" pour n'utiliser que le fichier enregistré le 16 avril 2020. + Regardons ce que nous avons obtenu: ```{r}