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module3/chabert.ipynb

@@ -25,6 +25,13 @@
     "import isoweek "
    ]
   },
+  {
+   "cell_type": "markdown",
+   "metadata": {},
+   "source": [
+    "Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](https://websenti.u707.jussieu.fr/sentiweb/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente."
+   ]
+  },
   {
    "cell_type": "markdown",
    "metadata": {},
@@ -3178,7 +3185,7 @@
     "hidePrompt": false
    },
    "source": [
-    "toute la colonne 'inc' est représantée par des chaines de caractères à a cause de trai en semain 19"
+    "Toute la colonne 'inc' est représantée par des chaines de caractères en trait à cause de l'abscence de donnée de la semaine 19 de 1989, il faut donc la prendre en compte pour que les données soit exploitable"
    ]
   },
   {
@@ -3249,6 +3256,20 @@
     "sorted_data['inc'][-200:].plot()"
    ]
   },
+  {
+   "cell_type": "markdown",
+   "metadata": {},
+   "source": [
+    "## etude de l'incidence annuel"
+   ]
+  },
+  {
+   "cell_type": "markdown",
+   "metadata": {},
+   "source": [
+    "Début de l'analyse des données à partir d'octobre 1984"
+   ]
+  },
   {
    "cell_type": "code",
    "execution_count": 14,
@@ -3260,6 +3281,14 @@
     "                                    sorted_data.index[-1].year)]"
    ]
   },
+  {
+   "cell_type": "markdown",
+   "metadata": {},
+   "source": [
+    "On a fait le choix de commencer l'année de notre analyse au 1er aout car c'est la période du creu épidémique d'Influenza, il faut donc trier les données en fonction de ce critère.\n",
+    "Il faut aussi vérifier que les années font bien entre 51 et 52 semaines."
+   ]
+  },
   {
    "cell_type": "code",
    "execution_count": 16,
@@ -3287,6 +3316,13 @@
     "yearly_incidence = pd.Series(data=yearly_incidence, index=year) "
    ]
   },
+  {
+   "cell_type": "markdown",
+   "metadata": {},
+   "source": [
+    "Graphique de l'incidence de grippe en fonction des années"
+   ]
+  },
   {
    "cell_type": "code",
    "execution_count": 18,
@@ -3374,6 +3410,13 @@
     "yearly_incidence.sort_values()"
    ]
   },
+  {
+   "cell_type": "markdown",
+   "metadata": {},
+   "source": [
+    "Représentation en histogramme des épidémie les plus fort au cours des 36 dernière années"
+   ]
+  },
   {
    "cell_type": "code",
    "execution_count": 20,