From 8de9626b345efea981963deccd55d39216665028 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: 935a59be81732a9b709feab7407d41d0 <935a59be81732a9b709feab7407d41d0@app-learninglab.inria.fr> Date: Thu, 15 Dec 2022 08:55:12 +0000 Subject: [PATCH] =?UTF-8?q?Ajout=20des=20explications=20et=20de=20la=20v?= =?UTF-8?q?=C3=A9rification=20de=20l'existence=20du=20fichier.?= MIME-Version: 1.0 Content-Type: text/plain; charset=UTF-8 Content-Transfer-Encoding: 8bit --- module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd | 12 ++++++++++++ 1 file changed, 12 insertions(+) diff --git a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd index da5a5c2..8c8feb6 100644 --- a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd +++ b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd @@ -22,9 +22,21 @@ knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE) ## Préparation des données Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. L'URL est: + +Pour nous protéger contre une éventuelle disparition ou modification du serveur du Réseau Sentinelles, nous faisons une copie locale de ce jeux de données que nous préservons avec notre analyse. Il est inutile et même risquée de télécharger les données à chaque exécution, car dans le cas d'une panne nous pourrions remplacer nos données par un fichier défectueux. Pour cette raison, nous téléchargeons les données seulement si la copie locale n'existe pas. + + ```{r} data_url = "http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv" + +if (!file.exists(data_local)) { +    download.file(data_url, data_file, method="auto") +} data_loca = "/home/goffette-nagot/Documents/références/recherche_reproductible/2022_12_fun_mooc_recherche_repro/clone_gitlab/mooc-rr/module3/exo1/incidence-PAY-3.csv" + +```{r} +data_file = "syndrome-grippal.csv" + ``` Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://ns.sentiweb.fr/incidence/csv-schema-v1.json): -- 2.18.1