diff --git a/module2/exo2/exercice_R_fr.org b/module2/exo2/exercice_R_fr.org index 1bb8f61f1d11b486ceb724afcdd14d11e5329545..845bdc1e9d39a2b12e85b7da47afda981fdebd0a 100644 --- a/module2/exo2/exercice_R_fr.org +++ b/module2/exo2/exercice_R_fr.org @@ -1,6 +1,5 @@ -#+TITLE: Votre titre -#+AUTHOR: Votre nom -#+DATE: La date du jour +#+TITLE: Module 2 exo 2 +#+AUTHOR: Julien EMMANUEL #+LANGUAGE: fr # #+PROPERTY: header-args :eval never-export @@ -11,74 +10,29 @@ #+HTML_HEAD: #+HTML_HEAD: -* Quelques explications +* Exercice 2 du module 2 -Ceci est un document org-mode avec quelques exemples de code -R. Une fois ouvert dans emacs, ce document peut aisément être -exporté au format HTML, PDF, et Office. Pour plus de détails sur -org-mode vous pouvez consulter https://orgmode.org/guide/. - -Lorsque vous utiliserez le raccourci =C-c C-e h o=, ce document sera -compilé en html. Tout le code contenu sera ré-exécuté, les résultats -récupérés et inclus dans un document final. Si vous ne souhaitez pas -ré-exécuter tout le code à chaque fois, il vous suffit de supprimer -le # et l'espace qui sont devant le ~#+PROPERTY:~ au début de ce -document. - -Comme nous vous l'avons montré dans la vidéo, on inclut du code -R de la façon suivante (et on l'exécute en faisant ~C-c C-c~): - -#+begin_src R :results output :exports both -print("Hello world!") -#+end_src - -#+RESULTS: -: [1] "Hello world!" - -Voici la même chose, mais avec une session R (c'est le cas le -plus courant, R étant vraiment un langage interactif), donc une -persistance d'un bloc à l'autre (et on l'exécute toujours en faisant -~C-c C-c~). +Exercice de stats sur des chiffres plutôt inintéressants #+begin_src R :results output :session *R* :exports both -summary(cars) +lst <- list(14.0, 7.6, 11.2, 12.8, 12.5, 9.9, 14.9, 9.4, 16.9, 10.2, 14.9, 18.1, 7.3, 9.8, 10.9,12.2, 9.9, 2.9, 2.8, 15.4, 15.7, 9.7, 13.1, 13.2, 12.3, 11.7, 16.0, 12.4, 17.9, 12.2, 16.2, 18.7, 8.9, 11.9, 12.1, 14.6, 12.1, 4.7, 3.9, 16.9, 16.8, 11.3, 14.4, 15.7, 14.0, 13.6, 18.0, 13.6, 19.9, 13.7, 17.0, 20.5, 9.9, 12.5, 13.2, 16.1, 13.5, 6.3, 6.4, 17.6, 19.1, 12.8, 15.5, 16.3, 15.2, 14.6, 19.1, 14.4, 21.4, 15.1, 19.6, 21.7, 11.3, 15.0, 14.3, 16.8, 14.0, 6.8, 8.2, 19.9, 20.4, 14.6, 16.4, 18.7, 16.8, 15.8, 20.4, 15.8, 22.4, 16.2, 20.3, 23.4, 12.1, 15.5, 15.4, 18.4, 15.7, 10.2, 8.9, 21.0) +mean(unlist(lst)) +min(unlist(lst)) +max(unlist(lst)) +median(unlist(lst)) +sd(unlist(lst)) #+end_src #+RESULTS: -: speed dist -: Min. : 4.0 Min. : 2.00 -: 1st Qu.:12.0 1st Qu.: 26.00 -: Median :15.0 Median : 36.00 -: Mean :15.4 Mean : 42.98 -: 3rd Qu.:19.0 3rd Qu.: 56.00 -: Max. :25.0 Max. :120.00 +#+begin_example -Et enfin, voici un exemple de sortie graphique: -#+begin_src R :results output graphics :file "./cars.png" :exports results :width 600 :height 400 :session *R* -plot(cars) -#+end_src - -#+RESULTS: -[[file:./cars.png]] +[1] 14.113 -Vous remarquerez le paramètre ~:exports results~ qui indique que le code -ne doit pas apparaître dans la version finale du document. Nous vous -recommandons dans le cadre de ce MOOC de ne pas changer ce paramètre -(indiquer ~both~) car l'objectif est que vos analyses de données soient -parfaitement transparentes pour être reproductibles. +[1] 2.8 -Attention, la figure ainsi générée n'est pas stockée dans le document -org. C'est un fichier ordinaire, ici nommé ~cars.png~. N'oubliez pas -de le committer si vous voulez que votre analyse soit lisible et -compréhensible sur GitLab. +[1] 23.4 -Enfin, pour les prochains exercices, nous ne vous fournirons pas -forcément de fichier de départ, ça sera à vous de le créer, par -exemple en repartant de ce document et de le commiter vers -gitlab. N'oubliez pas que nous vous fournissons dans les ressources de -ce MOOC une configuration avec un certain nombre de raccourcis -claviers permettant de créer rapidement les blocs de code R (en -faisant ~ + + + + + + +Module 2 exo 3 + + + + + + + + + + + + +
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Module 2 exo 3

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1 Exercice 3 du module 2

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+Affichage graphique des données de l'exercice précédent +

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+Si on était malin on mettrait les données dans un CSV commun plutôt +que de les copier à chaque fois, mais bon, flemme, et puis comme ça +les exercices sont bien indépendants (quelle excuse pourrite) +

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1.1 Formattage des données

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lst <- list(14.0, 7.6, 11.2, 12.8, 12.5, 9.9, 14.9, 9.4, 16.9, 10.2, 14.9, 18.1, 7.3, 9.8, 10.9,12.2, 9.9, 2.9, 2.8, 15.4, 15.7, 9.7, 13.1, 13.2, 12.3, 11.7, 16.0, 12.4, 17.9, 12.2, 16.2, 18.7, 8.9, 11.9, 12.1, 14.6, 12.1, 4.7, 3.9, 16.9, 16.8, 11.3, 14.4, 15.7, 14.0, 13.6, 18.0, 13.6, 19.9, 13.7, 17.0, 20.5, 9.9, 12.5, 13.2, 16.1, 13.5, 6.3, 6.4, 17.6, 19.1, 12.8, 15.5, 16.3, 15.2, 14.6, 19.1, 14.4, 21.4, 15.1, 19.6, 21.7, 11.3, 15.0, 14.3, 16.8, 14.0, 6.8, 8.2, 19.9, 20.4, 14.6, 16.4, 18.7, 16.8, 15.8, 20.4, 15.8, 22.4, 16.2, 20.3, 23.4, 12.1, 15.5, 15.4, 18.4, 15.7, 10.2, 8.9, 21.0)
+
+df <- data.frame(X=integer(), Y=double())
+
+# This is probably the dumbest way to do it, but I'm bad at R
+for (i in 1:length(lst)) {
+  df[nrow(df) + 1,] = c(i-1,lst[[i]])
+}
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+
+ +
+

1.2 Diagramme de séquence

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library(ggplot2)
+ggplot(df, aes(x=X,y=Y)) + geom_line(color="blue") + 
+theme_bw() + 
+theme(axis.title.x = element_blank()) + 
+theme(axis.title.y = element_blank()) + 
+coord_cartesian(expand = c(0,0), xlim = c(0, 100), ylim = c(0,25)) + 
+theme(plot.margin=unit(c(1,1,1,1),"cm"))
+
+
+ + +
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sequence.png +

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1.3 Histogram

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+Ces paramètres d'histogrammes sont abominables, mais c'est absolument +le seul set de paramètres que j'ai trouvé qui donne quelque chose de +similaire à la figure demandée +

+ +
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ggplot(df, aes(x=Y)) + geom_histogram(binwidth = 2.06, boundary = min(unlist(lst)), color="black", fill="blue") + 
+theme_bw() + 
+theme(axis.title.x = element_blank()) + 
+theme(axis.title.y = element_blank()) + 
+coord_cartesian(expand = c(0,0), xlim = c(0, 25), ylim = c(0,25)) + 
+theme(plot.margin=unit(c(1,1,1,1),"cm"))
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histogram.png +

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Auteur: Julien EMMANUEL

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Created: 2020-06-10 Wed 17:14

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Validate

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+ + diff --git a/module2/exo3/exercice_R_fr.org b/module2/exo3/exercice_R_fr.org index 1bb8f61f1d11b486ceb724afcdd14d11e5329545..a8529bb47c76e87d1cae31f72922b61f4b23d5f5 100644 --- a/module2/exo3/exercice_R_fr.org +++ b/module2/exo3/exercice_R_fr.org @@ -1,6 +1,5 @@ -#+TITLE: Votre titre -#+AUTHOR: Votre nom -#+DATE: La date du jour +#+TITLE: Module 2 exo 3 +#+AUTHOR: Julien EMMANUEL #+LANGUAGE: fr # #+PROPERTY: header-args :eval never-export @@ -11,74 +10,56 @@ #+HTML_HEAD: #+HTML_HEAD: -* Quelques explications +* Exercice 3 du module 2 -Ceci est un document org-mode avec quelques exemples de code -R. Une fois ouvert dans emacs, ce document peut aisément être -exporté au format HTML, PDF, et Office. Pour plus de détails sur -org-mode vous pouvez consulter https://orgmode.org/guide/. +Affichage graphique des données de l'exercice précédent -Lorsque vous utiliserez le raccourci =C-c C-e h o=, ce document sera -compilé en html. Tout le code contenu sera ré-exécuté, les résultats -récupérés et inclus dans un document final. Si vous ne souhaitez pas -ré-exécuter tout le code à chaque fois, il vous suffit de supprimer -le # et l'espace qui sont devant le ~#+PROPERTY:~ au début de ce -document. +Si on était malin on mettrait les données dans un CSV commun plutôt +que de les copier à chaque fois, mais bon, flemme, et puis comme ça +les exercices sont bien indépendants (/quelle excuse pourrite/) -Comme nous vous l'avons montré dans la vidéo, on inclut du code -R de la façon suivante (et on l'exécute en faisant ~C-c C-c~): +** Formattage des données +#+begin_src R :results output :session *R* :exports both +lst <- list(14.0, 7.6, 11.2, 12.8, 12.5, 9.9, 14.9, 9.4, 16.9, 10.2, 14.9, 18.1, 7.3, 9.8, 10.9,12.2, 9.9, 2.9, 2.8, 15.4, 15.7, 9.7, 13.1, 13.2, 12.3, 11.7, 16.0, 12.4, 17.9, 12.2, 16.2, 18.7, 8.9, 11.9, 12.1, 14.6, 12.1, 4.7, 3.9, 16.9, 16.8, 11.3, 14.4, 15.7, 14.0, 13.6, 18.0, 13.6, 19.9, 13.7, 17.0, 20.5, 9.9, 12.5, 13.2, 16.1, 13.5, 6.3, 6.4, 17.6, 19.1, 12.8, 15.5, 16.3, 15.2, 14.6, 19.1, 14.4, 21.4, 15.1, 19.6, 21.7, 11.3, 15.0, 14.3, 16.8, 14.0, 6.8, 8.2, 19.9, 20.4, 14.6, 16.4, 18.7, 16.8, 15.8, 20.4, 15.8, 22.4, 16.2, 20.3, 23.4, 12.1, 15.5, 15.4, 18.4, 15.7, 10.2, 8.9, 21.0) + +df <- data.frame(X=integer(), Y=double()) -#+begin_src R :results output :exports both -print("Hello world!") +# This is probably the dumbest way to do it, but I'm bad at R +for (i in 1:length(lst)) { + df[nrow(df) + 1,] = c(i-1,lst[[i]]) +} #+end_src #+RESULTS: -: [1] "Hello world!" -Voici la même chose, mais avec une session R (c'est le cas le -plus courant, R étant vraiment un langage interactif), donc une -persistance d'un bloc à l'autre (et on l'exécute toujours en faisant -~C-c C-c~). +** Diagramme de séquence -#+begin_src R :results output :session *R* :exports both -summary(cars) +#+begin_src R :results output graphics :file sequence.png :exports both :width 600 :height 400 :session *R* +library(ggplot2) +ggplot(df, aes(x=X,y=Y)) + geom_line(color="blue") + +theme_bw() + +theme(axis.title.x = element_blank()) + +theme(axis.title.y = element_blank()) + +coord_cartesian(expand = c(0,0), xlim = c(0, 100), ylim = c(0,25)) + +theme(plot.margin=unit(c(1,1,1,1),"cm")) #+end_src #+RESULTS: -: speed dist -: Min. : 4.0 Min. : 2.00 -: 1st Qu.:12.0 1st Qu.: 26.00 -: Median :15.0 Median : 36.00 -: Mean :15.4 Mean : 42.98 -: 3rd Qu.:19.0 3rd Qu.: 56.00 -: Max. :25.0 Max. :120.00 - -Et enfin, voici un exemple de sortie graphique: -#+begin_src R :results output graphics :file "./cars.png" :exports results :width 600 :height 400 :session *R* -plot(cars) +[[file:sequence.png]] + +** Histogramme +Ces paramètres d'histogrammes sont abominables, mais c'est absolument +le seul set de paramètres que j'ai trouvé qui donne quelque chose de +similaire à la figure demandée + +#+begin_src R :results output graphics :file histogram.png :exports both :width 600 :height 400 :session *R* +ggplot(df, aes(x=Y)) + geom_histogram(binwidth = 2.06, boundary = min(unlist(lst)), color="black", fill="blue") + +theme_bw() + +theme(axis.title.x = element_blank()) + +theme(axis.title.y = element_blank()) + +coord_cartesian(expand = c(0,0), xlim = c(0, 25), ylim = c(0,25)) + +theme(plot.margin=unit(c(1,1,1,1),"cm")) #+end_src #+RESULTS: -[[file:./cars.png]] - -Vous remarquerez le paramètre ~:exports results~ qui indique que le code -ne doit pas apparaître dans la version finale du document. Nous vous -recommandons dans le cadre de ce MOOC de ne pas changer ce paramètre -(indiquer ~both~) car l'objectif est que vos analyses de données soient -parfaitement transparentes pour être reproductibles. - -Attention, la figure ainsi générée n'est pas stockée dans le document -org. C'est un fichier ordinaire, ici nommé ~cars.png~. N'oubliez pas -de le committer si vous voulez que votre analyse soit lisible et -compréhensible sur GitLab. - -Enfin, pour les prochains exercices, nous ne vous fournirons pas -forcément de fichier de départ, ça sera à vous de le créer, par -exemple en repartant de ce document et de le commiter vers -gitlab. N'oubliez pas que nous vous fournissons dans les ressources de -ce MOOC une configuration avec un certain nombre de raccourcis -claviers permettant de créer rapidement les blocs de code R (en -faisant ~