From ea8f0b0a7f3cdf6b03de534d2c531dc5ed73d7bb Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: b28709f97252f192844018d2fa353b2f Date: Mon, 18 Mar 2024 18:47:31 +0000 Subject: [PATCH] =?UTF-8?q?Module=202,=20s=C3=A9quences=200=20=C3=A0=203?= MIME-Version: 1.0 Content-Type: text/plain; charset=UTF-8 Content-Transfer-Encoding: 8bit --- journal/Readme.md | 40 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++-- 1 file changed, 38 insertions(+), 2 deletions(-) diff --git a/journal/Readme.md b/journal/Readme.md index 889da49..9d7ff26 100644 --- a/journal/Readme.md +++ b/journal/Readme.md @@ -1,6 +1,6 @@ # Journal de bord du Mooc / Mooc's logbook -## Partie 1 : Cahier de notes, cahier de laboratoire +## Module 1 : Cahier de notes, cahier de laboratoire 1. Nous utilisons tous des cahiers de notes (2024/03/04) 2. Un aperçu historique de la prise de notes (2024/03/05) @@ -16,4 +16,40 @@ - format sugeré pour les étiquettes : - `:label 1:` - `:label 1:label 2:label 3:` - - penser à enregistrer les sources (i.e., les URLs) des fichiers téléchargés sur Internet dans des commentaires ou des métadonnées \ No newline at end of file + - penser à enregistrer les sources (i.e., les URLs) des fichiers téléchargés sur Internet dans des commentaires ou des métadonnées + +## Module 2 : La vitrine et l'envers du décor : le document computationnel + +1. Exemples récents d'études assez discutés (2024/03/14) + - Économie : politiques d'austérité + - Reinhart et Rogoff + - Les IRM fonctionnelles + - le saumon mort + - Les fausses structures de protéines + - Geoffrey Chang, 5 retractions d'articles +2. Pourquoi est-ce difficile ? (2024/03/18) + - 3 problèmes principaux + - manque d'information, problème d'accès aux données + - erreurs de calcul + - manque de rigueur scientifique et technique + - Les documents computationnels nous aident à résoudre ces problèmes + - la manque de rigueur reste toujours un défi... + - Pourquoi on s'oppose à tout rendre public ? +3. Le document computationnel : principe (2024/03/18) + - La science moderne est souvent un processus iterative qu'implique : + - la collecte des données + - l'analyse des données, avec : + - analyse statistique + - géneration des visualisations + - discussion des hypotèses et des conclusions avec d'autres scientifiques + - si on arrive a des bons résultats, on écrit des articles pour les présenter + - si on n'y arrive pas, on revient à l'analyse ou même à la collecte des données + - Le document computationnel nous permet de garder trace de ce que nous avons fait pour + - l'inspecter -> justifier/comprendre + - le refaire -> vérifier/corriger/réutiliser (les résultats, le code, les méthodes statistiques, ...) + - Un document computationnel contient + - du texte, souvent avec un language de balisage léger + - des extraits de code + - des résultats produits par le code -> chiffres, figures, etc. + - Un document computationnel nous permet de retraiter automatiquement nos données et d'exporter le document en format PDF ou HTML + - nous pouvons choisir quels extraits de code apparaîtront dans le document exporté \ No newline at end of file -- 2.18.1