From c582dc4fe7ff1b79ec99ad3a9d05d88a1efe5db9 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: b33409b2dd66284cfe7147b7057bc536 Date: Mon, 4 May 2020 13:53:44 +0000 Subject: [PATCH] Update analyse-syndrome-grippal.Rmd --- module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd | 14 ++++++++++++-- 1 file changed, 12 insertions(+), 2 deletions(-) diff --git a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd index 771e78f..73442be 100644 --- a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd +++ b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd @@ -26,6 +26,16 @@ Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du data_url = "http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv" ``` + +Pour nous protéger contre une éventuelle disparition ou modification du serveur du Réseau Sentinelles, nous faisons une copie locale de ce jeux de données que nous préservons avec notre analyse. Il est inutile et même risquée de télécharger les données à chaque exécution, car dans le cas d'une panne nous pourrions remplacer nos données par un fichier défectueux. Pour cette raison, nous téléchargeons les données seulement si la copie locale n'existe pas. +```{r} +data_file = "syndrome-grippal.csv" +if (!file.exists(data_file)) { + download.file(data_url, data_file, method="auto") +} +``` + + Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://ns.sentiweb.fr/incidence/csv-schema-v1.json): | Nom de colonne | Libellé de colonne | @@ -42,9 +52,9 @@ Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https:// | `geo_name` | Libellé de la zone géographique (ce libellé peut être modifié sans préavis) | La première ligne du fichier CSV est un commentaire, que nous ignorons en précisant `skip=1`. -### Téléchargement +### Lecture ```{r} -data = read.csv(data_url, skip=1) +data = read.csv(data_file, skip=1) ``` Regardons ce que nous avons obtenu: -- 2.18.1