diff --git a/journal/Journal.md b/journal/Journal.md index 95ca1f2a9594d946106035de32988b0997ddc876..140b4b7b78f41d6318eb36129ce840f8a4aba5de 100644 --- a/journal/Journal.md +++ b/journal/Journal.md @@ -98,4 +98,44 @@ Solutions facile à mettre en oeuvre : - docu wiki Solutions un peu plus complexes mais plus puissante : -- gitlab \ No newline at end of file +- gitlab +- + +## Module 2 - Le document computationel + +Objs : +- tracabilité des calculs et résultats +- code + résultats dans un doc scientifique +- 3 outils possibles : Jupyter / RStudio / Emacs&Org-mode + +**Rigeur** et **transparence** nécessaire pour permettre la reproductibilitée + +### Difficultés + +cause technique sur la difficulté de la reproductibilité : +- sources et données (non disponibles) +- choix (sur les données) +- ordinateur = sources d'erreurs + - tableur + - pile logicielle complexe (logiciel proprio) + - bug +- manque rigeur et organisation + - non backup + - non histo + - pas controle de qual +- dimension culturelle et saines + - (article : version simplifié du proto) + +craintes : +- on montre nos faiblesses +- qqun peut trouver une erreur +- qqun peut en tirer avantage +- LEGITIMES : données sensibles / ressources limitées + +solutions : +- format texte et non proprio + ==> formats textes : markdown, orgmode, csv, hdf5, ... +- logiciel et langage libre + ==> scilab, R, python +- stockage data + ==> famadrop, gitlab, github \ No newline at end of file