# Module 2

orgmode

mardown pour le texte
csv pour les tableaux
hdf5

R, scilab, python

framadrop, gitlab, github

## Documents computationnels
jupyter, Rstudio/knitr, orgmode

pandoc = ?

## Présentation de R mardown

R cheatsheet dans Help (++)

R sweave (latex), R html (balises) --> formats bien spécifiques

insert, Python
Mais attention, en Python, pas de persistence des variables (les chunks sont indépendants)
On a donc tendance à écrire des codes Python + longs

## Installation de R studio

Dans le point 4. Installation recommandée avec anaconda. Voir détails dans le cours.
Mais je suis partie de ma version installée, dans R studio.

Etapes effectuées :
- clé ssh publique entrée dans mon gitlab du MOOC (se trouve dans  C:\Users\USER\.ssh., fichier id_rsa. pub)
- récupération de mon mot de passe et login du MOOC (se trouve dans module 1, leçon 4, page qui se trouve après le quizz)
- dans le gitlab du MOOC copier l'adresse https dans MOOC-rr, clone, clone with https
- enfin, dans R studio : File / New project / version control / Gitlab --> copier l'adresse url, choisir l'emplacement local du clone, ok
- un clone est créé, on peut éditer en local, sauver, faire des commits en local, faire des push vers gitlab, depuis R studio

Mais j'ai du entrer mon login et mot de passe du mooc gitlab car je n'ai pas configuré ces options comme indiqué.