diff --git a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd index 75efe1e7faf78f4294a10fe02a9921fc8fff1653..19bd011c0571cbcd1c698531d031827835be5d1e 100644 --- a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd +++ b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd @@ -24,8 +24,25 @@ knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE) Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. L'URL est: ```{r} +data_url = "http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv" +``` + +Copie locale du fichier faite dans le répertoire module 3 exo1 +le téléchargement sur le site ne se fera que si la sauvergarde locale n'existe pas. +Je suis obligée de faire un setwd car il ne se met pas automatiquement dans le bon répertoire (à revoir dans la configuration du r setup au départ je pense + + + + +```{r} +data_file = "incidence-PAY-3.csv" setwd("C:/Users/berga/Seafile/MOOC/mooc-rr/module3/exo1") -data<-read.csv("incidence-PAY-3.csv") + + +if (!file.exists(data_file)) { + download.file(data_url, data_file, method="auto") +} + ``` Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://ns.sentiweb.fr/incidence/csv-schema-v1.json):