diff --git a/journal/notes_module_2.md b/journal/notes_module_2.md index 079a57c0893cc1641f5c0e866a03266c9bc336d7..38f098b174e678d160750f2f6f635daf1b53cb40 100644 --- a/journal/notes_module_2.md +++ b/journal/notes_module_2.md @@ -1,2 +1,48 @@ # Module 2 : documents computationnels +Rappel : c'est une question de communication +- collaboration scientifique pour produire +- traçabilité de ce qui est diffusé +- transparence sur le procédé calculatoire + +## les mauvais exemples + +1) Reinhart et Rogoff 2010 : growth in a time of debt + +=> concluent que la dette réduit la croissance + +On finit par leur demander leurs calculs, même si c'est des pointures... +"erreurs de programmation, exclusions de certaines données, pondérations stat non-conventionnelles" +(2013) + +Malheureusement, ce genre de non-publication des calculs est courant en économie... + +2) IRM fonctionnelles + +2010 Benett et le saumon mort... détectent une activité cérébrale. +Une question de bruit dans ces machines, mais bon... + +2016 : Eklund, Nichols, and Knutsson. "A bug in fmri software could invalidate 15 years of brain research" +Et bien sûr dans ce domaine, on ne peut pas se permettre de stocker trop de données... +(Heureusement, ils sont amenés à revoir à la baisse leur estimation, de 40k articles à 3600 articles potentiellement concernés.) +C'est un problème méthodologique, qui nuit à la vérifiabilité des calculs. + +3) cristallographie + +Geoffrey Chang étudie les protéines de bactéries résistantes aux antibiotiques (3 articles 2001-05) +Mais des résultats contradictoires arrivent d'autres chercheurs... +Il vérifie donc ses calculs et patatras, tout vient de 2 colonnes inversées dans son code. +(Erreur qui a eu le temps de se répandre...) -> rétractation de 5 articles ! + +Oncologie (1/2 d'études prestigieuses ne peuvent pas passer vers l'industrie), +psychologie (1/3 de repro ?) +=> Peu de domaines épargnés + +Science : rigueur, transparence, remise en cause + +(Première fois que je me plante sur des quizz ! +Insiste sur la chronologie avec le politique/les lobbys : ils exploitent a posteriori, +leur influence n'est pas forcément primordiale. +Moins de transparence, c'est effectivement plus de lisibilité, vu la complexité des matières traitées. +) +