module 2 exo 4

module2/exo4/data.csv

+year;month;day;t_morning;t_afternoon;t_evening;humidity;wind_speed;IQA
+2020;04;03;5;16;11;0;10;42
+2020;04;10;6;26;21;0;5;51

module2/exo4/exercice_R_fr.org

-#+TITLE:  Votre titre
-#+AUTHOR: Votre nom
-#+DATE:   La date du jour
+#+TITLE:  Améliorer son journal de bord
+#+AUTHOR: Antoine RICHARD
+#+DATE:   10/04/2020
 #+LANGUAGE: fr
 # #+PROPERTY: header-args :eval never-export
 
@@ -11,74 +11,84 @@
 #+HTML_HEAD: <script type="text/javascript" src="http://www.pirilampo.org/styles/lib/js/jquery.stickytableheaders.js"></script>
 #+HTML_HEAD: <script type="text/javascript" src="http://www.pirilampo.org/styles/readtheorg/js/readtheorg.js"></script>
 
-* Quelques explications
 
-Ceci est un document org-mode avec quelques exemples de code
-R. Une fois ouvert dans emacs, ce document peut aisément être
-exporté au format HTML, PDF, et Office. Pour plus de détails sur
-org-mode vous pouvez consulter https://orgmode.org/guide/.
+* Données récoltées
 
-Lorsque vous utiliserez le raccourci =C-c C-e h o=, ce document sera
-compilé en html. Tout le code contenu sera ré-exécuté, les résultats
-récupérés et inclus dans un document final. Si vous ne souhaitez pas
-ré-exécuter tout le code à chaque fois, il vous suffit de supprimer
-le # et l'espace qui sont devant le ~#+PROPERTY:~ au début de ce
-document.
+Tout d'abord chargeons les données collectées durant ce mooc.
 
-Comme nous vous l'avons montré dans la vidéo, on inclut du code
-R de la façon suivante (et on l'exécute en faisant ~C-c C-c~):
-
-#+begin_src R :results output :exports both
-print("Hello world!")
+#+begin_src R :results output :session *R* :exports both
+data <- read.csv("data.csv", sep=";", header=TRUE)
+summary(data)
 #+end_src
 
 #+RESULTS:
-: [1] "Hello world!"
+#+begin_example
 
-Voici la même chose, mais avec une session R (c'est le cas le
-plus courant, R étant vraiment un langage interactif), donc une
-persistance d'un bloc à l'autre (et on l'exécute toujours en faisant
-~C-c C-c~).
+      year          month        day          t_morning     t_afternoon  
+ Min.   :2020   Min.   :4   Min.   : 3.00   Min.   :5.00   Min.   :16.0  
+ 1st Qu.:2020   1st Qu.:4   1st Qu.: 4.75   1st Qu.:5.25   1st Qu.:18.5  
+ Median :2020   Median :4   Median : 6.50   Median :5.50   Median :21.0  
+ Mean   :2020   Mean   :4   Mean   : 6.50   Mean   :5.50   Mean   :21.0  
+ 3rd Qu.:2020   3rd Qu.:4   3rd Qu.: 8.25   3rd Qu.:5.75   3rd Qu.:23.5  
+ Max.   :2020   Max.   :4   Max.   :10.00   Max.   :6.00   Max.   :26.0  
+   t_evening       humidity   wind_speed         IQA       
+ Min.   :11.0   Min.   :0   Min.   : 5.00   Min.   :42.00  
+ 1st Qu.:13.5   1st Qu.:0   1st Qu.: 6.25   1st Qu.:44.25  
+ Median :16.0   Median :0   Median : 7.50   Median :46.50  
+ Mean   :16.0   Mean   :0   Mean   : 7.50   Mean   :46.50  
+ 3rd Qu.:18.5   3rd Qu.:0   3rd Qu.: 8.75   3rd Qu.:48.75  
+ Max.   :21.0   Max.   :0   Max.   :10.00   Max.   :51.00
+#+end_example
 
-#+begin_src R :results output :session *R* :exports both
-summary(cars)
-#+end_src
+** Temporalité des collectes
 
-#+RESULTS:
-:      speed           dist       
-:  Min.   : 4.0   Min.   :  2.00  
-:  1st Qu.:12.0   1st Qu.: 26.00  
-:  Median :15.0   Median : 36.00  
-:  Mean   :15.4   Mean   : 42.98  
-:  3rd Qu.:19.0   3rd Qu.: 56.00  
-:  Max.   :25.0   Max.   :120.00
-
-Et enfin, voici un exemple de sortie graphique:
-#+begin_src R :results output graphics :file "./cars.png" :exports results :width 600 :height 400 :session *R* 
-plot(cars)
-#+end_src
+ Analysons le nombre de données collectées par mois
 
-#+RESULTS:
-[[file:./cars.png]]
-
-Vous remarquerez le paramètre ~:exports results~ qui indique que le code
-ne doit pas apparaître dans la version finale du document. Nous vous
-recommandons dans le cadre de ce MOOC de ne pas changer ce paramètre
-(indiquer ~both~) car l'objectif est que vos analyses de données soient
-parfaitement transparentes pour être reproductibles.
-
-Attention, la figure ainsi générée n'est pas stockée dans le document
-org. C'est un fichier ordinaire, ici nommé ~cars.png~. N'oubliez pas
-de le committer si vous voulez que votre analyse soit lisible et
-compréhensible sur GitLab.
-
-Enfin, pour les prochains exercices, nous ne vous fournirons pas
-forcément de fichier de départ, ça sera à vous de le créer, par
-exemple en repartant de ce document et de le commiter vers
-gitlab. N'oubliez pas que nous vous fournissons dans les ressources de
-ce MOOC une configuration avec un certain nombre de raccourcis
-claviers permettant de créer rapidement les blocs de code R (en
-faisant ~<r~ ou ~<R~ suivi de ~Tab~).
-
-Maintenant, à vous de jouer! Vous pouvez effacer toutes ces
-informations et les remplacer par votre document computationnel.
+ #+begin_src R :results output graphics :file (org-babel-temp-file "figure" ".png") :exports both :width 600 :height 400 :session *R* 
+hist(data$month)
+ #+end_src
+
+ #+RESULTS:
+ [[file:/tmp/babel-bJ246X/figureDu3YQn.png]]
+
+** Évolutions des données
+
+ Analysons l'évolution des températures
+
+ #+begin_src R :results output graphics :file (org-babel-temp-file "figure" ".png") :exports both :width 600 :height 400 :session *R* 
+plot(data$t_morning ~ data$day, type="l", col="blue", ylim=c(0.0,40.0), xlab="days", ylab="Temperature (°C)")
+lines(data$t_afternoon ~ data$day, col="red")
+lines(data$t_evening ~ data$day, col="green")
+legend(1,40,legend=c("Morning","Afternoon","Evening"),col=c("blue","red","green"),lty=1)
+ #+end_src
+
+ #+RESULTS:
+ [[file:/tmp/babel-bJ246X/figurerWKWF0.png]]
+
+
+ De l'humidité:
+
+ #+begin_src R :results output graphics :file (org-babel-temp-file "figure" ".png") :exports both :width 600 :height 400 :session *R* 
+plot(data$humidity ~ data$day, type="l", col="blue", xlab="days", ylab="Humidity (%)")
+ #+end_src
+
+ #+RESULTS:
+ [[file:/tmp/babel-bJ246X/figureYIQvch.png]]
+
+ De la vitesse du vent:
+
+ #+begin_src R :results output graphics :file (org-babel-temp-file "figure" ".png") :exports both :width 600 :height 400 :session *R* 
+plot(data$wind ~ data$day, type="l", col="blue", xlab="days", ylab="Wind Speed (km/h)")
+ #+end_src
+
+ #+RESULTS:
+ [[file:/tmp/babel-bJ246X/figureUv3yAT.png]]
+
+ De l'Indice de qualité de l'air:
+
+ #+begin_src R :results output graphics :file (org-babel-temp-file "figure" ".png") :exports both :width 600 :height 400 :session *R* 
+plot(data$IQA ~ data$day, type="l", col="blue", xlab="time", ylab="Air Quality")
+ #+end_src
+
+ #+RESULTS:
+ [[file:/tmp/babel-bJ246X/figureZp2Kv3.png]]