From 13f51b6bdf01a4361c4f9ea39dbdb9e74fd6da99 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: d7227cde42eb97d8aac791d907b6bbae Date: Wed, 21 Aug 2024 13:07:02 +0000 Subject: [PATCH] Update analyse-syndrome-grippal.Rmd --- module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd | 10 +++++++--- 1 file changed, 7 insertions(+), 3 deletions(-) diff --git a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd index 771e78f..6342d80 100644 --- a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd +++ b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd @@ -21,9 +21,13 @@ knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE) ## Préparation des données -Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. L'URL est: +Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). S'il n'existe pas de fichier local pour les données (une copie doit être conservée pour la traçabilité), nous les récupérons en local sous forme de tableau CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet en local, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. Nous lisons ce jeu de données dans un second temps. ```{r} -data_url = "http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv" +if(!file.exists("./incidence-PAY-3.csv")){ + data_url = "http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv" + data_dwnld = read.csv(data_url) + write.csv(data_dwnld, "./incidence-PAY-3.csv", row.names = FALSE) +} ``` Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://ns.sentiweb.fr/incidence/csv-schema-v1.json): @@ -44,7 +48,7 @@ Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https:// La première ligne du fichier CSV est un commentaire, que nous ignorons en précisant `skip=1`. ### Téléchargement ```{r} -data = read.csv(data_url, skip=1) +data = read.csv("./incidence-PAY-3.csv", skip=1) ``` Regardons ce que nous avons obtenu: -- 2.18.1