diff --git a/module2/exo4/exercice_R_fr.org b/module2/exo4/exercice_R_fr.org index 1bb8f61f1d11b486ceb724afcdd14d11e5329545..e9f08b64c92f3193a0a4f34b98c27f140d34623e 100644 --- a/module2/exo4/exercice_R_fr.org +++ b/module2/exo4/exercice_R_fr.org @@ -1,8 +1,9 @@ -#+TITLE: Votre titre -#+AUTHOR: Votre nom -#+DATE: La date du jour -#+LANGUAGE: fr -# #+PROPERTY: header-args :eval never-export +# -*- mode: org -*- +# -*- coding: utf-8 -*- +#+STARTUP: overview indent inlineimages logdrawer +#+TITLE: Journal +#+AUTHOR: Put your name here +#+LANGUAGE: en #+HTML_HEAD: #+HTML_HEAD: @@ -11,34 +12,27 @@ #+HTML_HEAD: #+HTML_HEAD: -* Quelques explications - -Ceci est un document org-mode avec quelques exemples de code -R. Une fois ouvert dans emacs, ce document peut aisément être -exporté au format HTML, PDF, et Office. Pour plus de détails sur -org-mode vous pouvez consulter https://orgmode.org/guide/. - -Lorsque vous utiliserez le raccourci =C-c C-e h o=, ce document sera -compilé en html. Tout le code contenu sera ré-exécuté, les résultats -récupérés et inclus dans un document final. Si vous ne souhaitez pas -ré-exécuter tout le code à chaque fois, il vous suffit de supprimer -le # et l'espace qui sont devant le ~#+PROPERTY:~ au début de ce -document. - -Comme nous vous l'avons montré dans la vidéo, on inclut du code -R de la façon suivante (et on l'exécute en faisant ~C-c C-c~): - -#+begin_src R :results output :exports both -print("Hello world!") -#+end_src - -#+RESULTS: -: [1] "Hello world!" - -Voici la même chose, mais avec une session R (c'est le cas le -plus courant, R étant vraiment un langage interactif), donc une -persistance d'un bloc à l'autre (et on l'exécute toujours en faisant -~C-c C-c~). +#+LATEX_HEADER: \usepackage[utf8]{inputenc} +#+LATEX_HEADER: \usepackage[T1]{fontenc} +#+LATEX_HEADER: \usepackage[a4paper,margin=.8in]{geometry} +#+LATEX_HEADER: \usepackage[french]{babel} +#+TAGS: LIG(L) HOME(H) Europe(E) Blog(B) noexport(n) Stats(S) +#+TAGS: Epistemology(E) Vulgarization(V) Teaching(T) R(R) OrgMode(O) Python(P) +#+EXPORT_SELECT_TAGS: Blog +#+OPTIONS: H:3 num:t toc:t \n:nil @:t ::t |:t ^:t -:t f:t *:t <:t +#+OPTIONS: TeX:t LaTeX:nil skip:nil d:nil todo:t pri:nil tags:not-in-toc +#+EXPORT_SELECT_TAGS: export +#+EXPORT_EXCLUDE_TAGS: noexport +#+COLUMNS: %25ITEM %TODO %3PRIORITY %TAGS +#+SEQ_TODO: TODO(t!) STARTED(s!) WAITING(w@) APPT(a!) | DONE(d!) CANCELLED(c!) DEFERRED(f!) + +* 2021 +** 2021-03 mars +*** 2021-03-02 mardi +**** Premier pas avec org mode + +-note1 +-note2 #+begin_src R :results output :session *R* :exports both summary(cars) @@ -53,32 +47,120 @@ summary(cars) : 3rd Qu.:19.0 3rd Qu.: 56.00 : Max. :25.0 Max. :120.00 -Et enfin, voici un exemple de sortie graphique: -#+begin_src R :results output graphics :file "./cars.png" :exports results :width 600 :height 400 :session *R* +#+begin_src R :results output graphics :file (org-babel-temp-file "figure" ".png") :exports both :width 600 :height 400 :session *R* +plot(cars) +#+end_src + +#+RESULTS: +#+begin_src R :results output graphics :file (org-babel-temp-file "figure" ".png") :exports both :width 600 :height 400 :session *R* plot(cars) #+end_src #+RESULTS: -[[file:./cars.png]] - -Vous remarquerez le paramètre ~:exports results~ qui indique que le code -ne doit pas apparaître dans la version finale du document. Nous vous -recommandons dans le cadre de ce MOOC de ne pas changer ce paramètre -(indiquer ~both~) car l'objectif est que vos analyses de données soient -parfaitement transparentes pour être reproductibles. - -Attention, la figure ainsi générée n'est pas stockée dans le document -org. C'est un fichier ordinaire, ici nommé ~cars.png~. N'oubliez pas -de le committer si vous voulez que votre analyse soit lisible et -compréhensible sur GitLab. - -Enfin, pour les prochains exercices, nous ne vous fournirons pas -forcément de fichier de départ, ça sera à vous de le créer, par -exemple en repartant de ce document et de le commiter vers -gitlab. N'oubliez pas que nous vous fournissons dans les ressources de -ce MOOC une configuration avec un certain nombre de raccourcis -claviers permettant de créer rapidement les blocs de code R (en -faisant ~|t|) +(Intercept) -17.5791 6.7584 -2.601 0.0123 * +speed 3.9324 0.4155 9.464 1.49e-12 *** +--- +codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1 + +Residual standard error: 15.38 on 48 degrees of freedom +Multiple R-squared: 0.6511, Adjusted R-squared: 0.6438 +F-statistic: 89.57 on 1 and 48 DF, p-value: 1.49e-12 +#+end_example + +LinearMod, both these p-Values are well below the 0.05 +threshold, so I can conclude our model is indeed statistically +significant, which mean, now i'm sure that the speed influence the distance