From 581802f297b0113f6e34198b95708611e5b051f0 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Waad ALMASRI Date: Mon, 3 Aug 2020 22:38:33 +0200 Subject: [PATCH] .Rmd R.org & python.org submitted --- module2/exo2/exercice_R_fr.org | 85 +++++---------------- module2/exo2/exercice_fr.Rmd | 42 ++++++---- module2/exo2/exercice_python_fr.org | 114 +++++++++++----------------- 3 files changed, 91 insertions(+), 150 deletions(-) diff --git a/module2/exo2/exercice_R_fr.org b/module2/exo2/exercice_R_fr.org index 1bb8f61..8cc8201 100644 --- a/module2/exo2/exercice_R_fr.org +++ b/module2/exo2/exercice_R_fr.org @@ -1,6 +1,5 @@ -#+TITLE: Votre titre -#+AUTHOR: Votre nom -#+DATE: La date du jour +#+TITLE: Calculs Statistiques avec R +#+AUTHOR: Waad ALMASRI #+LANGUAGE: fr # #+PROPERTY: header-args :eval never-export @@ -11,74 +10,30 @@ #+HTML_HEAD: #+HTML_HEAD: -* Quelques explications +#+PROPERTY: header-args :session :exports both -Ceci est un document org-mode avec quelques exemples de code -R. Une fois ouvert dans emacs, ce document peut aisément être -exporté au format HTML, PDF, et Office. Pour plus de détails sur -org-mode vous pouvez consulter https://orgmode.org/guide/. - -Lorsque vous utiliserez le raccourci =C-c C-e h o=, ce document sera -compilé en html. Tout le code contenu sera ré-exécuté, les résultats -récupérés et inclus dans un document final. Si vous ne souhaitez pas -ré-exécuter tout le code à chaque fois, il vous suffit de supprimer -le # et l'espace qui sont devant le ~#+PROPERTY:~ au début de ce -document. - -Comme nous vous l'avons montré dans la vidéo, on inclut du code -R de la façon suivante (et on l'exécute en faisant ~C-c C-c~): - -#+begin_src R :results output :exports both -print("Hello world!") +* Moyenne +#+begin_src R :results output :session *R* :exports both +x = c(14.0, 7.6, 11.2, 12.8, 12.5, 9.9, 14.9, 9.4, 16.9, 10.2, 14.9, 18.1, 7.3, 9.8, 10.9,12.2, 9.9, 2.9, 2.8, 15.4, 15.7, 9.7, 13.1, 13.2, 12.3, 11.7, 16.0, 12.4, 17.9, 12.2, 16.2, 18.7, 8.9, 11.9, 12.1, 14.6, 12.1, 4.7, 3.9, 16.9, 16.8, 11.3, 14.4, 15.7, 14.0, 13.6, 18.0, 13.6, 19.9, 13.7, 17.0, 20.5, 9.9, 12.5, 13.2, 16.1, 13.5, 6.3, 6.4, 17.6, 19.1, 12.8, 15.5, 16.3, 15.2, 14.6, 19.1, 14.4, 21.4, 15.1, 19.6, 21.7, 11.3, 15.0, 14.3, 16.8, 14.0, 6.8, 8.2, 19.9, 20.4, 14.6, 16.4, 18.7, 16.8, 15.8, 20.4, 15.8, 22.4, 16.2, 20.3, 23.4, 12.1, 15.5, 15.4, 18.4, 15.7, 10.2, 8.9, 21.0) +mean(x) #+end_src -#+RESULTS: -: [1] "Hello world!" - -Voici la même chose, mais avec une session R (c'est le cas le -plus courant, R étant vraiment un langage interactif), donc une -persistance d'un bloc à l'autre (et on l'exécute toujours en faisant -~C-c C-c~). - +* Ecart type #+begin_src R :results output :session *R* :exports both -summary(cars) +sd(x) #+end_src -#+RESULTS: -: speed dist -: Min. : 4.0 Min. : 2.00 -: 1st Qu.:12.0 1st Qu.: 26.00 -: Median :15.0 Median : 36.00 -: Mean :15.4 Mean : 42.98 -: 3rd Qu.:19.0 3rd Qu.: 56.00 -: Max. :25.0 Max. :120.00 - -Et enfin, voici un exemple de sortie graphique: -#+begin_src R :results output graphics :file "./cars.png" :exports results :width 600 :height 400 :session *R* -plot(cars) +* Min +#+begin_src R :results output :session *R* :exports both +min(x) #+end_src -#+RESULTS: -[[file:./cars.png]] - -Vous remarquerez le paramètre ~:exports results~ qui indique que le code -ne doit pas apparaître dans la version finale du document. Nous vous -recommandons dans le cadre de ce MOOC de ne pas changer ce paramètre -(indiquer ~both~) car l'objectif est que vos analyses de données soient -parfaitement transparentes pour être reproductibles. - -Attention, la figure ainsi générée n'est pas stockée dans le document -org. C'est un fichier ordinaire, ici nommé ~cars.png~. N'oubliez pas -de le committer si vous voulez que votre analyse soit lisible et -compréhensible sur GitLab. - -Enfin, pour les prochains exercices, nous ne vous fournirons pas -forcément de fichier de départ, ça sera à vous de le créer, par -exemple en repartant de ce document et de le commiter vers -gitlab. N'oubliez pas que nous vous fournissons dans les ressources de -ce MOOC une configuration avec un certain nombre de raccourcis -claviers permettant de créer rapidement les blocs de code R (en -faisant ~. +```{r} +mean(x) +``` -Lorsque vous cliquerez sur le bouton **Knit** ce document sera compilé afin de ré-exécuter le code R et d'inclure les résultats dans un document final. Comme nous vous l'avons montré dans la vidéo, on inclue du code R de la façon suivante: +## Ecart-Type -```{r cars} -summary(cars) +```{r} +sd(x) ``` -Et on peut aussi aisément inclure des figures. Par exemple: +## Min -```{r pressure, echo=FALSE} -plot(pressure) +```{r} +min(x) ``` -Vous remarquerez le paramètre `echo = FALSE` qui indique que le code ne doit pas apparaître dans la version finale du document. Nous vous recommandons dans le cadre de ce MOOC de ne pas utiliser ce paramètre car l'objectif est que vos analyses de données soient parfaitement transparentes pour être reproductibles. +## Mediane -Comme les résultats ne sont pas stockés dans les fichiers Rmd, pour faciliter la relecture de vos analyses par d'autres personnes, vous aurez donc intérêt à générer un HTML ou un PDF et à le commiter. +```{r} +median(x) +max(x) +``` + +## Max -Maintenant, à vous de jouer! Vous pouvez effacer toutes ces informations et les remplacer par votre document computationnel. +```{r} +max(x) +``` diff --git a/module2/exo2/exercice_python_fr.org b/module2/exo2/exercice_python_fr.org index c7157ba..cbd24db 100644 --- a/module2/exo2/exercice_python_fr.org +++ b/module2/exo2/exercice_python_fr.org @@ -1,8 +1,6 @@ -#+TITLE: Votre titre -#+AUTHOR: Votre nom -#+DATE: La date du jour +#+TITLE: Calculs Statistiques avec Numpy +#+AUTHOR: Waad ALMASRI #+LANGUAGE: fr -# #+PROPERTY: header-args :eval never-export #+HTML_HEAD: #+HTML_HEAD: @@ -11,83 +9,57 @@ #+HTML_HEAD: #+HTML_HEAD: -* Quelques explications +#+PROPERTY: header-args :session :exports both -Ceci est un document org-mode avec quelques exemples de code -python. Une fois ouvert dans emacs, ce document peut aisément être -exporté au format HTML, PDF, et Office. Pour plus de détails sur -org-mode vous pouvez consulter https://orgmode.org/guide/. +* Moyenne -Lorsque vous utiliserez le raccourci =C-c C-e h o=, ce document sera -compilé en html. Tout le code contenu sera ré-exécuté, les résultats -récupérés et inclus dans un document final. Si vous ne souhaitez pas -ré-exécuter tout le code à chaque fois, il vous suffit de supprimer -le # et l'espace qui sont devant le ~#+PROPERTY:~ au début de ce -document. +#+begin_src python :results value :session *python* :exports both +import numpy as np +x = [14.0, 7.6, 11.2, 12.8, 12.5, 9.9, 14.9, 9.4, 16.9, 10.2, 14.9, 18.1, 7.3, 9.8, 10.9,12.2, 9.9, 2.9, 2.8, 15.4, 15.7, 9.7, 13.1, 13.2, 12.3, 11.7, 16.0, 12.4, 17.9, 12.2, 16.2, 18.7, 8.9, 11.9, 12.1, 14.6, 12.1, 4.7, 3.9, 16.9, 16.8, 11.3, 14.4, 15.7, 14.0, 13.6, 18.0, 13.6, 19.9, 13.7, 17.0, 20.5, 9.9, 12.5, 13.2, 16.1, 13.5, 6.3, 6.4, 17.6, 19.1, 12.8, 15.5, 16.3, 15.2, 14.6, 19.1, 14.4, 21.4, 15.1, 19.6, 21.7, 11.3, 15.0, 14.3, 16.8, 14.0, 6.8, 8.2, 19.9, 20.4, 14.6, 16.4, 18.7, 16.8, 15.8, 20.4, 15.8, 22.4, 16.2, 20.3, 23.4, 12.1, 15.5, 15.4, 18.4, 15.7, 10.2, 8.9, 21.0] -Comme nous vous l'avons montré dans la vidéo, on inclue du code -python de la façon suivante (et on l'exécute en faisant ~C-c C-c~): +np.mean(x) +#+end_src + +#+RESULTS: +: 14.113 + +* Ecart type +#+begin_src python :results value :session *python* :exports both + +np.std(x, ddof=1) + +#+end_src + +#+RESULTS: +: 4.3340944553 + +* Min +#+begin_src python :results value :session *python* :exports both + +np.min(x) -#+begin_src python :results output :exports both -print("Hello world!") #+end_src #+RESULTS: -: Hello world! - -Voici la même chose, mais avec une session python, donc une -persistance d'un bloc à l'autre (et on l'exécute toujours en faisant -~C-c C-c~). -#+begin_src python :results output :session :exports both -import numpy -x=numpy.linspace(-15,15) -print(x) +: 2.8 + +* Mediane + +#+begin_src python :results value :session *python* :exports both + +np.median(x) + #+end_src #+RESULTS: -#+begin_example -[-15. -14.3877551 -13.7755102 -13.16326531 -12.55102041 - -11.93877551 -11.32653061 -10.71428571 -10.10204082 -9.48979592 - -8.87755102 -8.26530612 -7.65306122 -7.04081633 -6.42857143 - -5.81632653 -5.20408163 -4.59183673 -3.97959184 -3.36734694 - -2.75510204 -2.14285714 -1.53061224 -0.91836735 -0.30612245 - 0.30612245 0.91836735 1.53061224 2.14285714 2.75510204 - 3.36734694 3.97959184 4.59183673 5.20408163 5.81632653 - 6.42857143 7.04081633 7.65306122 8.26530612 8.87755102 - 9.48979592 10.10204082 10.71428571 11.32653061 11.93877551 - 12.55102041 13.16326531 13.7755102 14.3877551 15. ] -#+end_example - -Et enfin, voici un exemple de sortie graphique: -#+begin_src python :results output file :session :var matplot_lib_filename="./cosxsx.png" :exports results -import matplotlib.pyplot as plt - -plt.figure(figsize=(10,5)) -plt.plot(x,numpy.cos(x)/x) -plt.tight_layout() - -plt.savefig(matplot_lib_filename) -print(matplot_lib_filename) +: 14.5 + +* Max +#+begin_src python :results value :session *python* :exports both + +np.max(x) + #+end_src #+RESULTS: -[[file:./cosxsx.png]] - -Vous remarquerez le paramètre ~:exports results~ qui indique que le code -ne doit pas apparaître dans la version finale du document. Nous vous -recommandons dans le cadre de ce MOOC de ne pas changer ce paramètre -(indiquer ~both~) car l'objectif est que vos analyses de données soient -parfaitement transparentes pour être reproductibles. - -Attention, la figure ainsi générée n'est pas stockée dans le document -org. C'est un fichier ordinaire, ici nommé ~cosxsx.png~. N'oubliez pas -de le committer si vous voulez que votre analyse soit lisible et -compréhensible sur GitLab. - -Enfin, n'oubliez pas que nous vous fournissons dans les ressources de -ce MOOC une configuration avec un certain nombre de raccourcis -claviers permettant de créer rapidement les blocs de code python (en -faisant ~