From 33c48a1c54a180a22230b42cbd7d57126075206a Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: =?UTF-8?q?=C3=89mile=20Jetzer?= Date: Thu, 14 May 2020 12:06:13 -0400 Subject: [PATCH] Exercice org-mode --- journal/Readme.md | 12 +- .../exo1/toy_document_orgmode_python_fr.org | 126 ++++++++---------- .../exo1/toy_document_orgmode_python_fr.org~ | 93 +++++++++++++ 3 files changed, 157 insertions(+), 74 deletions(-) create mode 100644 module2/exo1/toy_document_orgmode_python_fr.org~ diff --git a/journal/Readme.md b/journal/Readme.md index f56eb60..1a68793 100644 --- a/journal/Readme.md +++ b/journal/Readme.md @@ -1,9 +1,7 @@ -# Journal de bord du Mooc / Mooc's logbook +--- +title: Journal de bord du MOOC +author: Émile Jetzer +--- -FR +# Journal de bord du Mooc -Espace réservé au journal de bord du Mooc - -EN - -Reserved for the Mooc's logbook \ No newline at end of file diff --git a/module2/exo1/toy_document_orgmode_python_fr.org b/module2/exo1/toy_document_orgmode_python_fr.org index c7157ba..e5ac8f3 100644 --- a/module2/exo1/toy_document_orgmode_python_fr.org +++ b/module2/exo1/toy_document_orgmode_python_fr.org @@ -1,6 +1,6 @@ -#+TITLE: Votre titre -#+AUTHOR: Votre nom -#+DATE: La date du jour +#+TITLE: À propos du calcul de \(\pi\) +#+AUTHOR: Émile Jetzer +#+DATE: 2020-05-14 #+LANGUAGE: fr # #+PROPERTY: header-args :eval never-export @@ -11,83 +11,75 @@ #+HTML_HEAD: #+HTML_HEAD: -* Quelques explications +* En demandant à la lib maths -Ceci est un document org-mode avec quelques exemples de code -python. Une fois ouvert dans emacs, ce document peut aisément être -exporté au format HTML, PDF, et Office. Pour plus de détails sur -org-mode vous pouvez consulter https://orgmode.org/guide/. +Mon ordinateur m'indique que \(\pi\) vaut /approximativement/: -Lorsque vous utiliserez le raccourci =C-c C-e h o=, ce document sera -compilé en html. Tout le code contenu sera ré-exécuté, les résultats -récupérés et inclus dans un document final. Si vous ne souhaitez pas -ré-exécuter tout le code à chaque fois, il vous suffit de supprimer -le # et l'espace qui sont devant le ~#+PROPERTY:~ au début de ce -document. - -Comme nous vous l'avons montré dans la vidéo, on inclue du code -python de la façon suivante (et on l'exécute en faisant ~C-c C-c~): - -#+begin_src python :results output :exports both -print("Hello world!") +#+begin_src python :export both :session "Python" +import math +math.pi #+end_src #+RESULTS: -: Hello world! - -Voici la même chose, mais avec une session python, donc une -persistance d'un bloc à l'autre (et on l'exécute toujours en faisant -~C-c C-c~). -#+begin_src python :results output :session :exports both -import numpy -x=numpy.linspace(-15,15) -print(x) +: 3.141592653589793 + +* En utilisant la méthode des aiguilles de Buffon + +Mais calculé avec la *méthode* des [aiguilles de +Buffon](https://fr.wikipedia.org/wiki/Aiguille_de_Buffon), on +obtiendrait comme *approximation*: + +#+begin_src python :session "Python" +import numpy as np +np.random.seed(seed=42) +N=10000 +x = np.random.uniform(size=N, low=0, high=1) +theta = np.random.uniform(size=N, low=0, high=math.pi/2) +2/(sum((x+np.sin(theta))>1)/N) #+end_src #+RESULTS: -#+begin_example -[-15. -14.3877551 -13.7755102 -13.16326531 -12.55102041 - -11.93877551 -11.32653061 -10.71428571 -10.10204082 -9.48979592 - -8.87755102 -8.26530612 -7.65306122 -7.04081633 -6.42857143 - -5.81632653 -5.20408163 -4.59183673 -3.97959184 -3.36734694 - -2.75510204 -2.14285714 -1.53061224 -0.91836735 -0.30612245 - 0.30612245 0.91836735 1.53061224 2.14285714 2.75510204 - 3.36734694 3.97959184 4.59183673 5.20408163 5.81632653 - 6.42857143 7.04081633 7.65306122 8.26530612 8.87755102 - 9.48979592 10.10204082 10.71428571 11.32653061 11.93877551 - 12.55102041 13.16326531 13.7755102 14.3877551 15. ] -#+end_example - -Et enfin, voici un exemple de sortie graphique: -#+begin_src python :results output file :session :var matplot_lib_filename="./cosxsx.png" :exports results +: 3.128911138923655 + +* Avec un argument "fréquentiel" de surface + +Sinon, une méthode plus simple à comprendre et ne faisant pas +intervenir d'appel à la fonction sinus se base sur le fait que si +\(X\tilde U(0, 1)\) et \(Y\tilde U(0, 1)\) alors \(P[X^2+Y^2 \leq 1]=\pi /4\) +(voir [méthode de Monte Carle sur +Wikipedia](https://fr.wikipedia.org/wiki/M%C3%A9thode_de_Monte-Carlo#D%C3%A9termination_de_la_valeur_de_%CF%80). Le +code suivant illustre ce fait: + +#+begin_src python :session "Python" :export both import matplotlib.pyplot as plt -plt.figure(figsize=(10,5)) -plt.plot(x,numpy.cos(x)/x) -plt.tight_layout() +np.random.seed(seed=42) +N = 1000 +x = np.random.uniform(size=N, low=0, high=1) +y = np.random.uniform(size=N, low=0, high=1) + +accept = (x*x + y*y) <= 1 +reject = np.logical_not(accept) + +fig, ax = plt.subplots(1) +ax.scatter(x[accept], y[accept], c='b', alpha=0.2, edgecolor=None) +ax.scatter(x[reject], y[reject], c='r', alpha=0.2, edgecolor=None) +ax.set_aspect('equal') plt.savefig(matplot_lib_filename) print(matplot_lib_filename) #+end_src #+RESULTS: -[[file:./cosxsx.png]] - -Vous remarquerez le paramètre ~:exports results~ qui indique que le code -ne doit pas apparaître dans la version finale du document. Nous vous -recommandons dans le cadre de ce MOOC de ne pas changer ce paramètre -(indiquer ~both~) car l'objectif est que vos analyses de données soient -parfaitement transparentes pour être reproductibles. - -Attention, la figure ainsi générée n'est pas stockée dans le document -org. C'est un fichier ordinaire, ici nommé ~cosxsx.png~. N'oubliez pas -de le committer si vous voulez que votre analyse soit lisible et -compréhensible sur GitLab. - -Enfin, n'oubliez pas que nous vous fournissons dans les ressources de -ce MOOC une configuration avec un certain nombre de raccourcis -claviers permettant de créer rapidement les blocs de code python (en -faisant ~ + +Il est alors aisé d'obtenir une approximation (pas terrible) de \(\pi\) + +en comptant combien de fois, en moyenne, \(X^2+Y^2\) est inférieur à 1: + +#+begin_src python :session "Python" +4*np.mean(accept) +#+end_src + +#+RESULTS: +: 3.112 diff --git a/module2/exo1/toy_document_orgmode_python_fr.org~ b/module2/exo1/toy_document_orgmode_python_fr.org~ new file mode 100644 index 0000000..c7157ba --- /dev/null +++ b/module2/exo1/toy_document_orgmode_python_fr.org~ @@ -0,0 +1,93 @@ +#+TITLE: Votre titre +#+AUTHOR: Votre nom +#+DATE: La date du jour +#+LANGUAGE: fr +# #+PROPERTY: header-args :eval never-export + +#+HTML_HEAD: +#+HTML_HEAD: +#+HTML_HEAD: +#+HTML_HEAD: +#+HTML_HEAD: +#+HTML_HEAD: + +* Quelques explications + +Ceci est un document org-mode avec quelques exemples de code +python. Une fois ouvert dans emacs, ce document peut aisément être +exporté au format HTML, PDF, et Office. Pour plus de détails sur +org-mode vous pouvez consulter https://orgmode.org/guide/. + +Lorsque vous utiliserez le raccourci =C-c C-e h o=, ce document sera +compilé en html. Tout le code contenu sera ré-exécuté, les résultats +récupérés et inclus dans un document final. Si vous ne souhaitez pas +ré-exécuter tout le code à chaque fois, il vous suffit de supprimer +le # et l'espace qui sont devant le ~#+PROPERTY:~ au début de ce +document. + +Comme nous vous l'avons montré dans la vidéo, on inclue du code +python de la façon suivante (et on l'exécute en faisant ~C-c C-c~): + +#+begin_src python :results output :exports both +print("Hello world!") +#+end_src + +#+RESULTS: +: Hello world! + +Voici la même chose, mais avec une session python, donc une +persistance d'un bloc à l'autre (et on l'exécute toujours en faisant +~C-c C-c~). +#+begin_src python :results output :session :exports both +import numpy +x=numpy.linspace(-15,15) +print(x) +#+end_src + +#+RESULTS: +#+begin_example +[-15. -14.3877551 -13.7755102 -13.16326531 -12.55102041 + -11.93877551 -11.32653061 -10.71428571 -10.10204082 -9.48979592 + -8.87755102 -8.26530612 -7.65306122 -7.04081633 -6.42857143 + -5.81632653 -5.20408163 -4.59183673 -3.97959184 -3.36734694 + -2.75510204 -2.14285714 -1.53061224 -0.91836735 -0.30612245 + 0.30612245 0.91836735 1.53061224 2.14285714 2.75510204 + 3.36734694 3.97959184 4.59183673 5.20408163 5.81632653 + 6.42857143 7.04081633 7.65306122 8.26530612 8.87755102 + 9.48979592 10.10204082 10.71428571 11.32653061 11.93877551 + 12.55102041 13.16326531 13.7755102 14.3877551 15. ] +#+end_example + +Et enfin, voici un exemple de sortie graphique: +#+begin_src python :results output file :session :var matplot_lib_filename="./cosxsx.png" :exports results +import matplotlib.pyplot as plt + +plt.figure(figsize=(10,5)) +plt.plot(x,numpy.cos(x)/x) +plt.tight_layout() + +plt.savefig(matplot_lib_filename) +print(matplot_lib_filename) +#+end_src + +#+RESULTS: +[[file:./cosxsx.png]] + +Vous remarquerez le paramètre ~:exports results~ qui indique que le code +ne doit pas apparaître dans la version finale du document. Nous vous +recommandons dans le cadre de ce MOOC de ne pas changer ce paramètre +(indiquer ~both~) car l'objectif est que vos analyses de données soient +parfaitement transparentes pour être reproductibles. + +Attention, la figure ainsi générée n'est pas stockée dans le document +org. C'est un fichier ordinaire, ici nommé ~cosxsx.png~. N'oubliez pas +de le committer si vous voulez que votre analyse soit lisible et +compréhensible sur GitLab. + +Enfin, n'oubliez pas que nous vous fournissons dans les ressources de +ce MOOC une configuration avec un certain nombre de raccourcis +claviers permettant de créer rapidement les blocs de code python (en +faisant ~