From 6670c1c43a684ff996be2669adf2019a9588b7ec Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: f00571f25470627155e41c9e649a1d97 Date: Mon, 23 Jun 2025 13:20:37 +0000 Subject: [PATCH] Avancement module 3 --- journal/module 3 - analyse replicable.md | 32 ++++++++++++++++++++++++ 1 file changed, 32 insertions(+) diff --git a/journal/module 3 - analyse replicable.md b/journal/module 3 - analyse replicable.md index af870f7..5345d39 100644 --- a/journal/module 3 - analyse replicable.md +++ b/journal/module 3 - analyse replicable.md @@ -1,3 +1,35 @@ # Module 3 - Analyse Réplicable +## Intro +Analyse traditionelle: résultats -> résumé méthodologique + discussion + +Analyse réplicable: on remplace résumé par code complet + explication choix + +- Plus facile à vérifier +- Plus faciler à étendre pour répondre à de nouvelles questions +- Facile a rééxecuter avec de nouvelles données + +## Étude de cas: incidence de syndromes grippaux + +Réseau sentinelles -> médecins généralistes, surveillance de maladies + +Ne pas supprimer/modifier des données à la main (ex: supprimer un ligne CSV, même si elle est vide/invalide) +-> Modifier la ligne dans le code + +## Importer les données + +Bibliothèques: +- pandas: import données +- matplotlib: affichage graphiques +- isoweek: gérer dates format ISO + +1ère étape: préface contenant librairies + +Import en utilisant URL, `skiprows=1` pour ignorer 1ère ligne de commentaire + +Trouver ligne vide: `data[data.isnull().any(axis=1)]`, puis suppression `data.dropna().copy()` + +## Vérification et inspection + +Première étape vérification données: possibles erreurs dans données ou introduites par nous-même -- 2.18.1