# Module 1 – Cahier de notes, cahier de laboratoire

## 0. Introduction

> **Objectifs**
> Comprendre l’importance de la traçabilité dans un travail de recherche
> - comprendre le fonctionnement d’un cahier de laboratoire
> - Maîtriser la gestion d’un cahier de laboratoire électronique
> - Maîtriser le fonctionnement d’un outil de suivi de gestion

> Ce qui nous intéresse ici est la notion de supports (papiers ou numériques) dans
> lesquels des informations sont stockées au fil du temps – contrairement au cas 
> d’un mémoire ou d’un article où c’est la logique de l’argumentation qui 
> structure le contenu – ; ces informations sont de plus de nature souvent 
> hétérogène et leurs supports, lorsqu’ils sont multiples, aussi (par exemple, un 
> cahier de notes associé à des fichiers textes).


## 1. Nous utilisons tous des cahiers de notes
Prise de note rigoureuse, va dans le sens d’une recherche reproductible
- Pr Anne Estrade, professeure de mathématique à l’Université de Paris-Descartes

Utilisation des feuilles volantes datées et numérotées

- Marie-Noëlle Bourguet, Professeure émérite d’Histoire moderne à l’Université 
Paris-Diderot

- Annie Lacroix-Riz, Professeure émérite d’Histoire contemporaine à l’Université
Paris-Diderot

Beaucoup d’annotations, l’arrivée du numérique permet de rendre des comptes et
surtout facilité les annotations

Phase de note / phase synthése

- Isabel Llano est Neurophysiologiste au CNRS et à l’Université Paris-Descartes

## 2. Un aperçu historique de la prise de notes
Prise de note = matérialité

Tablette d’argile, tablette de cire, un rouleau(volumen), cahier de note(codex),
fiche, post-it, ordinateur

Grosse lettre en rouge dans les parchemins, rebrication

Canon eusédien

Leishu -> manuscrit sur papier

Fiche peut être reclassé ou réutilisée directement

## 3. Du fichier texte au langage de balisage léger
Utilisation de fichier texte ! UTF-8, les logiciels de versionning les utilisent
pleinement

Mais impossible de faire de la mise en page

Langage de balisage (mark, html) mais besoin d’un éditeur spécialisé
- Langage de balisage léger, facile à lire sous forme non formaté

### La Text Encoding Initiative (TEI), un vocabulaire et des spécifications pour une analyse textuelle transparente
> Il s'agit d'un balisage s'appuyant sur le langage XML et qui se présente comme
> un dictionnaire de balises couvrant à peu près toutes les situations". Il 
> s'agit de permettre à une machine de lire ces données.

> La TEI permet d'introduire dans le texte des informations allant bien au-delà 
> des éléments formels comme le montre ce comparatif tiré de Wikipédia entre 
> d'une part, un encodage en HTML, où l'on prend en compte uniquement les 
> aspects de présentation, et d'autre part, un encodage en TEI, où l'on peut 
> introduire des informations sur les personnages, la versification des éléments.

> La TEI met l'accent sur la sémantique des objets représentés

> La TEI est devenue la référence incontournable pour tout projet d'édition
> numérique de sources en sciences humaines


## 4. Pérennité et évolutivité des notes avec la gestion de version (git)
Git c’est la vie …

Sauvegarde et historique des modifications d’un ou plusieurs fichiers gérés.

Libreoffice word -> comparer deux version successif d’un fichier

Wikidoc -> modif d’un fichier à la fois

Les deux -> sauvegarde à la charge de ‘l’utilisateur

Git -> goto Git c’est la vie

### Démystifions Git, Github, Gitlab
Outil de gestion -> 70

Git -> 2005

Sauvegarde d’historique de modification

Collaborer = gérer un historique de modification

Faire des commit diffèrent pour les modifications de fond et de forme 

Github/gitlab -> réseau social

Fork -> faire une copie intégrale du projet

Pull request -> proposer des modifications dans projet ou l’on n’a pas les
droits d’écritures

Intégration continue -> test réalisé pour s’assurer que des bugs ne sont pas
introduite par des modifications

## 5. Les étiquettes et logiciels d’indexation pour s’y retrouver
- Moteur de recherche de bureau -> **docfetcher**

Ajout d’étiquette dans des fichiers textes dans des commentaires pour faciliter
la recherche de fichier vie ces explorateurs

- Accés metadonnée des images -> **exiftool**

ajout d'étiquettes et autres informations (URL ...) en ligne de commande dans
les metadonnées des images