From 68f26317c42cdbeebd0248c3ef7a953d815c7ba3 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: f754b224d0f39e1e5985bdfc02ba215f Date: Fri, 2 Aug 2024 08:34:54 +0000 Subject: [PATCH] =?UTF-8?q?R=C3=A9alisation=20exercice=201=20module=203=20?= =?UTF-8?q?:=20copie=20des=20donn=C3=A9es=20=C3=A0=20l'URL=20donn=C3=A9e?= MIME-Version: 1.0 Content-Type: text/plain; charset=UTF-8 Content-Transfer-Encoding: 8bit --- module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd | 10 +++++++--- 1 file changed, 7 insertions(+), 3 deletions(-) diff --git a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd index 771e78f..bcb939e 100644 --- a/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd +++ b/module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd @@ -17,13 +17,17 @@ header-includes: ```{r setup, include=FALSE} knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE) +setwd("C:/Users/blond/Documents/Thèse/Formations/RechercheReproductible") ``` ## Préparation des données -Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. L'URL est: +Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous réalisons une copie du jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. L'URL est: ```{r} data_url = "http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv" +data_file = "incidence-PAY-3.csv" +download.file(data_url,data_file,method = "auto") + ``` Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://ns.sentiweb.fr/incidence/csv-schema-v1.json): @@ -42,9 +46,9 @@ Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https:// | `geo_name` | Libellé de la zone géographique (ce libellé peut être modifié sans préavis) | La première ligne du fichier CSV est un commentaire, que nous ignorons en précisant `skip=1`. -### Téléchargement +### Lecture ```{r} -data = read.csv(data_url, skip=1) +data = read.csv(data_file, skip=1) ``` Regardons ce que nous avons obtenu: -- 2.18.1