diff --git a/module2/ressources/emacs_orgmode.md b/module2/ressources/emacs_orgmode.md index 3a6f7b690525fa63963cd8d6211145c4a5be211c..d3a8deea9efd56d20bf6e559d3913206ba12e393 100644 --- a/module2/ressources/emacs_orgmode.md +++ b/module2/ressources/emacs_orgmode.md @@ -1,7 +1,7 @@ --- -title: Emacs/org-mode -author: Arnaud Legrand -date: June, 2018 +TITLE: Emacs/org-mode +AUTHOR: Arnaud Legrand +Date: Mon Feb 18 09:52:09 2019 --- **Disclaimer:** The two sections *A simple "reproducible research" emacs configuration* and *A stub of replicable article* explain how to set up emacs/org-mode for this MOOC. These are very important sections in the context of this MOOC. **These sections are illustrated in two out of the [three video tutorials of this sequence](https://www.fun-mooc.fr/courses/course-v1:inria+41016+session02/jump_to_id/9cfc7500f0ef46d288d2317ec7b037b4), and** **which you really should follow carefully**. **Otherwise, you may have trouble doing the exercises later on**. Likewise, I strongly encourage you to watch the ["emacs and git" video tutorial available at the same place](https://www.fun-mooc.fr/courses/course-v1:inria+41016+session02/jump_to_id/9cfc7500f0ef46d288d2317ec7b037b4). diff --git a/module2/ressources/gitlab.md b/module2/ressources/gitlab.md index 8bcdab934413659245ab0771209b2d03ac643d1d..2e78fbc368dfc84ca35d4db7e6fe35513003875b 100644 --- a/module2/ressources/gitlab.md +++ b/module2/ressources/gitlab.md @@ -1,3 +1,9 @@ +--- +TITLE: Git and GitLab +AUTHOR: Arnaud Legrand +Date: Tue Feb 19 15:42:13 2019 +--- + **This document is particularly important if you follow the RStudio or the Org-Mode path.** **If you follow the Jupyter path, it can be ignored at first** **as we have closely integrated Jupyter and GitLab in the context of this MOOC.** So far, you only used git via the web interface from the GitLab we deployed for the MOOC: @@ -251,5 +257,3 @@ Now, let's start! ``` Only then will you be able to `git push`. - - diff --git a/module2/ressources/gitlab_fr.md b/module2/ressources/gitlab_fr.md index e4b92b579cf32b65ac0081dc622bcde01bf212bf..4d53155175ba5c7df8053336cd29b4a7100f95b1 100644 --- a/module2/ressources/gitlab_fr.md +++ b/module2/ressources/gitlab_fr.md @@ -1,3 +1,9 @@ +--- +TITLE: Git et GitLab +AUTHOR: Arnaud Legrand +Date: Tue Feb 19 15:42:13 2019 +--- + **Ce document est particulièrement important si vous suivez le parcours RStudio ou Org-Mode. Vous pouvez l’ignorer dans un premier temps si** **vous suivez le parcours Jupyter car nous avons étroitement intégré Jupyter et GitLab dans le contexte de ce MOOC.** Jusqu'à présent, vous avez utilisé Git uniquement via l'interface web du GitLab que nous avons déployée pour le MOOC : [](https://app-learninglab.inria.fr/gitlab/) @@ -252,5 +258,3 @@ Maintenant, commençons ! ``` Alors seulement pourrez-vous exécuter le `git push`. - - diff --git a/module2/ressources/jupyter.md b/module2/ressources/jupyter.md index 7cf3e6ab18ab2710fa7bffccc146f0aacd5b8b4d..b68078450d2ec958bfcd8b98bcfc47cc539bd07f 100644 --- a/module2/ressources/jupyter.md +++ b/module2/ressources/jupyter.md @@ -1,3 +1,9 @@ +--- +TITLE: Jupyter : tips and tricks, Installing and configuring +AUTHOR: Arnaud Legrand, Benoit Rospars, Konrad Hinsen +Date: Tue Feb 19 15:42:13 2019 +--- + Table of Contents ============================================================== diff --git a/module2/ressources/maintaining_a_journal.md b/module2/ressources/maintaining_a_journal.md index 3523dda50b222ae48a89cf659ade658f96a76da4..711565087bcf5fceb245ae274ac1faaf791b8b53 100644 --- a/module2/ressources/maintaining_a_journal.md +++ b/module2/ressources/maintaining_a_journal.md @@ -1,3 +1,9 @@ +--- +TITLE: Maintaining a journal +AUTHOR: Arnaud Legrand +Date: Tue Feb 19 15:42:13 2019 +--- + Table of Contents ============================================================== diff --git a/module2/ressources/orgmode_examples/README.md b/module2/ressources/orgmode_examples/README.md index 466b0fc34da42a80e4399c18bfb5a2245264c917..c83ffe6a86539870324f61c2426ff7e6369ced1a 100644 --- a/module2/ressources/orgmode_examples/README.md +++ b/module2/ressources/orgmode_examples/README.md @@ -1,3 +1,9 @@ +--- +TITLE: Org document examples +AUTHOR: Arnaud Legrand +Date: Tue Feb 19 16:08:56 2019 +--- + Table of Contents ============================================================== @@ -25,4 +31,3 @@ Here are a few links to other kind of examples: - a set of templates for various computer science journals/conferences: [IEEE](https://github.com/schnorr/ieeeorg), [Wiley](https://github.com/schnorr/wileyorg), [ACM](https://github.com/schnorr/acmorg), [LNCS](https://github.com/schnorr/llncsorg) - his lecture on programming languages for undergrads: - John Kitchin is an expert org-mode user and he maintains a very interesting [blog with many interesting tips](http://kitchingroup.cheme.cmu.edu/blog/). You may want to check this [seminar he gave at SciPy](https://www.youtube.com/watch?v=IsSMs-4GlT8&list=FLQp2VLAOlvq142YN3JO3y8w&app=desktop). - diff --git a/module2/ressources/rstudio.md b/module2/ressources/rstudio.md index 22e4bc254428be2a79ebda22a2a3111b2ab064bf..9345da2f858a013a8f70de897b0b8c4b90e7e32f 100644 --- a/module2/ressources/rstudio.md +++ b/module2/ressources/rstudio.md @@ -1,3 +1,9 @@ +--- +TITLE: Rstudio +AUTHOR: Arnaud Legrand +Date: Tue Feb 19 15:42:13 2019 +--- + Table of Contents ============================================================== @@ -150,5 +156,3 @@ Modifying a file **NB**: You won't be able to propagate your modifications on GitLab if some modifications have been done on GitLab in the meantime. ![](rstudio_images/push4.png) - You should first merge these remote modifications locally. Click on `pull` to get these modifications on your machine. - - diff --git a/module2/ressources/rstudio_fr.md b/module2/ressources/rstudio_fr.md index 9bfc3bf5820552c657d2753317f51dfe75911d30..f0a36d7aa630c2d32a01a30390e5e15880c7e224 100644 --- a/module2/ressources/rstudio_fr.md +++ b/module2/ressources/rstudio_fr.md @@ -1,3 +1,9 @@ +--- +TITLE: Rstudio +AUTHOR: Arnaud Legrand +Date: Tue Feb 19 15:42:13 2019 +--- + Table des matières =============================================================== @@ -154,5 +160,3 @@ Modifier un fichier ![](rstudio_images/push4.png) - Il faut d’abord récupérer ces modifications distantes sur votre machine locale. Pour ce faire cliquer sur `pull`. - - diff --git a/module4/ressources/resources_environment.md b/module4/ressources/resources_environment.md index 5264beed28715f1ef844a05ea1fa146918bdebdb..886b8ce1872526553d9f4d2af7d2d7937057abb4 100644 --- a/module4/ressources/resources_environment.md +++ b/module4/ressources/resources_environment.md @@ -1,3 +1,9 @@ +--- +TITLE: Tracking environment information +AUTHOR: Arnaud Legrand +Date: Tue Feb 19 15:28:06 2019 +--- + Table of Contents ============================================================== @@ -442,4 +448,3 @@ There are a few potential issues that may arise with installing older versions o - You may be losing functionality or bug fixes that are only present in the newer versions of the packages. - The older package version needed may not be compatible with the version of R you have installed. In this case, you will either need to downgrade R to a compatible version or update your R code to work with a newer version of the package. - diff --git a/module4/ressources/resources_environment_fr.md b/module4/ressources/resources_environment_fr.md index 31cedfb17b5980d953f42e3f8924e9720a456a91..b0f6ba5d7cc9c444fbc3fb6c3770372150225551 100644 --- a/module4/ressources/resources_environment_fr.md +++ b/module4/ressources/resources_environment_fr.md @@ -1,3 +1,9 @@ +--- +TITLE: Informations sur l'environnement +AUTHOR: Arnaud Legrand +Date: Tue Feb 19 15:28:06 2019 +--- + Table des matières =============================================================== @@ -444,4 +450,3 @@ Quelques problèmes sont susceptibles de survenir lors de l'installation d'ancie - Vous pouvez perdre des fonctionnalités ou des corrections de bugs qui ne sont présentes que dans les versions les plus récentes des packages. - L'ancienne version de package requise peut ne pas être compatible avec la version de R que vous avez installée. Dans ce cas, vous devrez soit rétrograder R vers une version compatible, soit mettre à jour votre code R pour qu'il fonctionne avec une version plus récente du package. - diff --git a/module4/ressources/resources_refs.md b/module4/ressources/resources_refs.md index 76c2bb62eee4c9320548b028cc32caa0e5181ac6..1813394d423fdb62f5039dfb6056b5633197e791 100644 --- a/module4/ressources/resources_refs.md +++ b/module4/ressources/resources_refs.md @@ -1,3 +1,9 @@ +--- +TITLE: Additional references +AUTHOR: Arnaud Legrand +Date: Tue Feb 19 15:42:13 2019 +--- + Table of Contents ============================================================== @@ -80,4 +86,3 @@ Experimentation Experimentation was not covered in this MOOC, although it is an essential part of science. The main reason is that practices and constraints can vary so wildly from one domain to another that it could not be properly covered in a first edition. We would be happy to gather references you consider as interesting in your domain so do not hesitate to provide us with such references by using the forum and we will update this page. - [A recent talk by Lucas Nussbaum on Experimental Testbeds in Computer Science](https://github.com/alegrand/RR_webinars/blob/master/9_experimental_testbeds/index.org). - diff --git a/module4/ressources/resources_refs_fr.md b/module4/ressources/resources_refs_fr.md index 2bf1f4cab20d5302824283aea0099230af8502dd..9469449b5e6c00d3096be24b78dc886f6a37e087 100644 --- a/module4/ressources/resources_refs_fr.md +++ b/module4/ressources/resources_refs_fr.md @@ -1,3 +1,9 @@ +--- +TITLE: Références complémentaires +AUTHOR: Arnaud Legrand +Date: Tue Feb 19 15:42:13 2019 +--- + Table des matières =============================================================== @@ -80,4 +86,3 @@ Expérimentation L'expérimentation n'est pas couverte dans ce MOOC bien qu'il s'agisse d'un élément essentiel de la science. La raison principale est que les pratiques et les contraintes varient tellement d'un domaine à l'autre que ce thème ne pouvait pas être correctement couvert dans une première édition. Nous serions heureux de rassembler les références que vous jugez intéressantes dans votre domaine. N'hésitez donc pas à nous les fournir à l'aide du forum. Nous les intégrerons dans cette page. - [Une récente conférence de Lucas Nussbaum sur les bancs d’essais expérimentaux en informatique](https://github.com/alegrand/RR_webinars/blob/master/9_experimental_testbeds/index.org). -