Merge branch 'master' of gitlab.inria.fr:learninglab/mooc-rr/mooc-rr-ressources

.gitignore

+*~
+*.vrb
+*.aux
+*.log
+*.nav
+*.out
+*.snm
+*.toc
+*.tex
+_minted*
+svg-inkscape*
+*-svg.pdf
\ No newline at end of file

.gitlab-ci.yml

-image: alpine:latest
-
-pages:
-  stage: deploy
-  script:
-  - echo 'Nothin to do ...'
-  artifacts:
-    paths:
-    - public
-  only:
-  - master
-

module1/slides/Makefile

+PATH_LOCAL=~/public_html/PITCHME/
+PATH_BIN=../bin/
+PATH_ASSETS=../assets/
+
+sync_local: PITCHME.md
+	mkdir -p $(PATH_LOCAL)/assets/md/img/
+	cp PITCHME.md $(PATH_LOCAL)/assets/md/PITCHME.md
+	cp $(PATH_ASSETS)/img/* $(PATH_LOCAL)/assets/img/
+
+$(PATH_LOCAL)/assets/md/PITCHME.md: PITCHME.md
+	sed 's|https://rawgit.com/alegrand/RR_MOOC/master/||g' < $< > $@
+
+C028AL_slides_module1-en-gz.pdf: slides_module1.pdf
+	mv $< $@
+
+C028AL_slides_module1-fr-gz.pdf: diapos_module1.pdf
+	mv $< $@
+
+%-gz.pdf: %.pdf
+	gzprez $<
+
+%.pdf: %.tex
+	pdflatex --shell-escape $^
+	pdflatex --shell-escape $^
+
+%.tex: %.org
+	emacs -batch $^  --funcall org-beamer-export-to-latex
+#	sed -i -e 's|includegraphics\(.*\)../assets/img/|includegraphics\1../assets/img/thumbnail/|' -e 's/\.png}/.jpg}/i' -e 's/\.JPG}/.jpg}/i' $@

module1/slides/misc/Etiquette_avec_Markdown.md

+# Comment rajouter des étiquettes dans un fichier Markdown ?
+
+Pour rajouter une étiquette ou un mot clé visible par un `moteur de recherche de bureau`, nous pouvons les insérer dans des `commentaires`, c'est-à-dire des parties du fichier texte `source` qui ne seront pas montrées par le logiciel de rendu — comme le navigateur internet lors de la génération d'une sortie au format `HTML`.
+
+Le [didacticiel Markdown](https://enacit1.epfl.ch/markdown-pandoc) de Jean-Daniel Bonjour nous explique clairement comment faire cela en section `3.2.7.4 Autres remarques sur les listes`. Pour rajouter en commentaire l'étiquette `:ceci-est-une-étiquette:`, il suffit de taper : `<!-- :ceci-est-une-étiquette: -->`. Nous pouvons ainsi étiqueter les différents éléments d'une liste :
+
+* le premier élément ; <!-- :étiquette-1: -->
+* le deuxième élément. <!-- :étiquette-2: -->
+ 
+ Et voilà !
\ No newline at end of file

module1/slides/misc/description_sequences_module1.org

+#+OPTIONS: ':nil *:t -:t ::t <:t H:3 \n:nil ^:t arch:headline
+#+OPTIONS: author:t broken-links:nil c:nil creator:nil
+#+OPTIONS: d:(not "LOGBOOK") date:t e:t email:nil f:t inline:t num:t
+#+OPTIONS: p:nil pri:nil prop:nil stat:t tags:t tasks:t tex:t
+#+OPTIONS: timestamp:t title:t toc:t todo:t |:t
+#+TITLE: Une phrase de description pour les séquences du module 1
+#+DATE: <2018-07-05 jeu.>
+#+AUTHOR: Christophe Pouzat
+#+EMAIL: christophe.pouzat@parisdescartes.fr
+#+LANGUAGE: en
+#+SELECT_TAGS: export
+#+EXCLUDE_TAGS: noexport
+#+CREATOR: Emacs 25.3.1 (Org mode 9.0.9)
+
+* Séquence 1
+- Quelques exemples, célèbres et moins célèbres, de prise de notes.
+- Some famous and less famous examples of note-taking.
+
+* Séquence 2
+- Une courte histoire de la navigation dans le livre et les notes.
+- A brief history of navigation within the book and notes.
+
+* Séquence 3
+- L'intérêt des fichiers textes et des langages de balisage légers.
+- Why should we use text fromats and ligthweight markup languages?
+
+* Séquence 4 
+- Comment archiver des notes tout en les faisant évoluer ? L'intérêt des logiciels de gestion de version. 
+- How to archive notes while letting them evolve? The case for version control systems.
+
+* Sèquence 5
+- S'y retrouver dans ses notes avec des mots-clés et un moteur de recherche de bureau.
+- Finding one's way in a large notes collection with key-words and desktop search software.
+

module2/ressources/emacs_orgmode.org

@@ -17,6 +17,26 @@ the [[https://www.fun-mooc.fr/courses/course-v1:inria+41016+session01bis/jump_to
 
 The next section provides information on how to install emacs.
 
+* Table of Contents                                                     :TOC:
+ - [[#installing-emacs-org-mode-ess-and-auctex][Installing emacs, org-mode, ess, and auctex.]]
+     - [[#linux-debian-ubuntu][Linux (Debian, Ubuntu)]]
+     - [[#macos][macOS]]
+     - [[#windows][Windows]]
+     - [[#all-platforms-pretty-code-in-html-export][All platforms: pretty code in HTML export]]
+ - [[#a-simple-reproducible-research-emacs-configuration-][A simple "/reproducible research/" emacs configuration ]]
+     - [[#step-0-backup-and-download-our-configuration][Step 0: Backup and download our configuration]]
+     - [[#step-1-prepare-your-journal][Step 1: Prepare your journal]]
+     - [[#step-2-set-up-emacs-configuration][Step 2: Set up Emacs configuration]]
+     - [[#step-3-adapt-the-configuration-to-your-specific-needs-if-required][Step 3: Adapt the configuration to your specific needs if required]]
+     - [[#step-4-check-whether-the-installation-is-working-or-not][Step 4: Check whether the installation is working or not]]
+     - [[#step-5-open-and-play-with-your-journal][Step 5: Open and play with your journal:]]
+ - [[#a-stub-of-a-replicable-article][A stub of a replicable article]]
+ - [[#emacs-tips-and-tricks][Emacs tips and tricks]]
+     - [[#cheat-sheets][Cheat-sheets]]
+     - [[#video-tutorials][Video tutorials]]
+     - [[#additional-useful-emacs-packages][Additional useful emacs packages]]
+     - [[#other-resources][Other resources]]
+
 * Installing emacs, org-mode, ess, and auctex.
 ** Linux (Debian, Ubuntu)
 We provide here only instructions for Debian-based distributions. Feel

module2/slides/Makefile

+C028AL_slides_module2-en-gz.pdf: slides_module2.pdf
+	mv $< $@
+
+C028AL_slides_module2-fr-gz.pdf: diapos_module2.pdf
+	mv $< $@
+
+%-gz.pdf: %.pdf
+	gzprez $<
+
+%.pdf: %.tex
+	pdflatex --shell-escape $^
+	pdflatex --shell-escape $^
+
+%.tex: %.org
+	emacs -batch --eval "(setq enable-local-eval t)" --eval "(setq enable-local-variables t)" $^ --funcall org-beamer-export-to-latex
+	# sed -i -e 's|includegraphics\(.*\)../assets/img/|includegraphics\1../assets/img/thumbnail/|' -e 's/\.png}/.jpg}/i' $@