From e6b49b9ee0546d1cb097ae4c60d90ae97aa68dc0 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Arnaud Legrand Date: Fri, 22 Mar 2019 18:29:52 +0100 Subject: [PATCH] [HTML] Fix multi-line links that were not correctly handled. --- module4/ressources/resources_refs.org | 14 +++++--------- module4/ressources/resources_refs_fr.org | 17 ++++++----------- 2 files changed, 11 insertions(+), 20 deletions(-) diff --git a/module4/ressources/resources_refs.org b/module4/ressources/resources_refs.org index 6e405d0..e1609aa 100644 --- a/module4/ressources/resources_refs.org +++ b/module4/ressources/resources_refs.org @@ -62,11 +62,11 @@ control your environment: - The easy (preserve the mess) ones: [[http://www.pgbovine.net/cde.html][CDE]] or [[https://vida-nyu.github.io/reprozip/][ReproZip]] - The more demanding (encourage cleanliness) where you start with a clean environment and install only what's strictly necessary (and document it): - - The very well known [[https://www.docker.io/][Docker]] + - The very well known [[https://www.docker.io/][Docker]]; - [[https://singularity.lbl.gov/][Singularity]] or [[https://spack.io/][Spack]], which are more targeted toward the specific - needs of high performance computing users + needs of high performance computing users; - [[https://www.gnu.org/software/guix/][Guix]], [[https://nixos.org/][Nix]] that are very clean (perfect?) solutions to this - dependency hell and which we recommend + dependency hell and which we recommend. It may be hard to understand the difference between these different approaches and decide which one is better in your context. @@ -103,12 +103,8 @@ Bio-informatics: Current Status, Solutions and Research Opportunities We have mentioned these topics in our MOOC but we could by no way cover them properly. We only suggest here a few interesting talks about this. -- [[https://github.com/alegrand/RR_webinars/blob/master/10_statistics_and_replication_in_HCI/index.org][In this talk, Pierre Dragicevic provides a nice illustration of the - consequences of statistical uncertainty and of how some concepts - (e.G. p-values) are commonly badly understood.]] -- [[https://github.com/alegrand/RR_webinars/blob/master/3_numerical_reproducibility/index.org][Nathalie Revol, Philippe Langlois and Stef Graillat present the main - challenges encountered when trying to achieve numerical - reproducibility and present recent research work on this topic.]] +- [[https://github.com/alegrand/RR_webinars/blob/master/10_statistics_and_replication_in_HCI/index.org][In this talk, Pierre Dragicevic provides a nice illustration of the consequences of statistical uncertainty and of how some concepts (e.g., p-values) are commonly badly understood.]] +- [[https://github.com/alegrand/RR_webinars/blob/master/3_numerical_reproducibility/index.org][Nathalie Revol, Philippe Langlois and Stef Graillat present the main challenges encountered when trying to achieve numerical reproducibility and present recent research work on this topic.]] * Publication practices You may want to have a look at the following two webinars: - [[https://github.com/alegrand/RR_webinars/blob/master/8_artifact_evaluation/index.org][Enabling open and reproducible research at computer systems’ diff --git a/module4/ressources/resources_refs_fr.org b/module4/ressources/resources_refs_fr.org index bd71877..2a35c86 100644 --- a/module4/ressources/resources_refs_fr.org +++ b/module4/ressources/resources_refs_fr.org @@ -78,11 +78,11 @@ solutions permettent de contrôler votre environnement : - Les plus exigeants (encourageant la propreté) où vous commencez avec un environnement propre et n’installez que ce qui est strictement nécessaire (et le documentez) : - - Le très connu [[https://www.docker.io/][Docker]] + - Le très connu [[https://www.docker.io/][Docker]]; - [[https://singularity.lbl.gov/][Singularity]] ou [[https://spack.io/][Spack]], qui sont plus ciblés sur les besoins - spécifiques des utilisateurs d'informatique de haute performance + spécifiques des utilisateurs d'informatique de haute performance; - [[https://www.gnu.org/software/guix/][Guix]], [[https://nixos.org/][Nix]] qui sont des solutions très propres (parfaites ?) à cet - enfer de dépendance et que nous recommandons + enfer de dépendance et que nous recommandons. Il peut être difficile de comprendre la différence entre ces différentes approches et de décider laquelle est la meilleure dans @@ -125,13 +125,8 @@ Jérôme Chopard)]]. Nous avons mentionné ces sujets dans notre MOOC mais nous ne pourrions en aucun cas les couvrir correctement. Nous ne suggérons ici que quelques présentations intéressantes à ce sujet. -- [[https://github.com/alegrand/RR_webinars/blob/master/10_statistics_and_replication_in_HCI/index.org][Pierre Dragicevic donne une belle illustration des conséquences de - l’incertitude statistique et de la manière dont certains concepts - (par exemple les p-values) sont généralement mal compris]]. -- [[https://github.com/alegrand/RR_webinars/blob/master/3_numerical_reproducibility/index.org][Nathalie Revol, Philippe Langlois et Stef Graillat présentent les - principaux problèmes rencontrés en essayant d'obtenir une - reproductibilité numérique et présentent les travaux de recherche - récents en la matière]]. +- [[https://github.com/alegrand/RR_webinars/blob/master/10_statistics_and_replication_in_HCI/index.org][Pierre Dragicevic donne une belle illustration des conséquences de l'incertitude statistique et de la manière dont certains concepts par exemple les p-values) sont généralement mal compris]]. +- [[https://github.com/alegrand/RR_webinars/blob/master/3_numerical_reproducibility/index.org][Nathalie Revol, Philippe Langlois et Stef Graillat présentent les principaux problèmes rencontrés en essayant d'obtenir une reproductibilité numérique et présentent les travaux de recherche récents en la matière]]. * Pratiques de publication Vous souhaiterez peut-être consulter les webinaires suivants : @@ -157,4 +152,4 @@ références que vous jugez intéressantes dans votre domaine. N'hésitez donc pas à nous les fournir à l'aide du forum. Nous les intégrerons dans cette page. -- [[https://github.com/alegrand/RR_webinars/blob/master/9_experimental_testbeds/index.org][Une récente conférence de Lucas Nussbaum sur les bancs d’essais expérimentaux en informatique]]. +- [[https://github.com/alegrand/RR_webinars/blob/master/9_experimental_testbeds/index.org][Une récente conférence de Lucas Nussbaum sur les plates-formes expérimentales en informatique]]. -- 2.18.1