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#+TITLE:       Galerie de Notebooks
#+AUTHOR:      Laurence Farhi
#+STARTUP: overview indent inlineimages logdrawer
#+LANGUAGE:    fr

Voici un document qui recense quelques documents computationnels
"remarquables" dans toutes les disciplines et tous les domaines.

* Table of Contents                                                     :TOC:
- [[#notebooks-jupyter][Notebooks Jupyter]]
- [[#notebooks-rstudio][Notebooks RStudio]]
- [[#notebooks-org-mode][Notebooks Org-mode]]

* Notebooks Jupyter
- [[https://github.com/norvig/pytudes/blob/master/ipynb/Economics.ipynb][Simulation d'un marché économique]],  Peter Norvig (github @norvig)
- [[https://github.com/mikhailklassen/Mining-the-Social-Web-3rd-Edition][Un complément exécutable (Python/Jupyter) pour le livre "Mining the Social Web", (O'Reilly, 2019)]], Mikhail Klassen (github @mikhailklassen)
- [[http://darribas.org/gds19][Des supports de cours ("Geographic Data Science") avec des notebooks
  Jupyter]], (voir sous "labs"),  Dr. Dani Arribas-Bel, Automne 2019 à
  l'Université de Liverpool.
- [[https://github.com/lesteve/euroscipy-2019-scikit-learn-tutorial/tree/master/notebooks][EuroSciPy 2019 - scikit-learn tutorial]], Olivier Grisel (github
  @ogrisel)
- [[https://github.com/jupyter/jupyter/wiki/A-gallery-of-interesting-Jupyter-Notebooks][A gallery of interesting Jupyter Notebooks]] :
  un entrepôt github qui regroupe de nombreux notebooks Jupyter tous domaines

* Notebooks RStudio
- [[http://rpubs.com/alegrand/46031][Images Panini]], Arnaud Legrand
- [[http://rpubs.com/alegrand/224732][Les yeux bleus]], Arnaud Legrand
- [[https://gitlab.com/c_pouzat/etudes-de-cas-m1/blob/master/TriDesPA][Enregistrements extracellulaires et le tri des potentiel d'action :
  supports de cours et les codes associés]] ([[https://gitlab.com/c_pouzat/etudes-de-cas-m1/blob/master/TriDesPA/Pouzat_TriDesPA_20190128.pdf][Pdf]]), Christophe Pouzat (github @c_pouzat)
- [[https://gitlab.com/c_pouzat/etudes-de-cas-m1/blob/master/FluoCalcium][Mesures de concentrations calciques au moyen de sondes
  fluorescentes : supports de cours et les codes associés]] ([[https://gitlab.com/c_pouzat/etudes-de-cas-m1/blob/master/FluoCalcium/Pouzat_FluoCalcium_20180309.pdf][Pdf]]), Christophe
  Pouzat (gitlab @c_pouzat)
- [[https://github.com/christophe-pouzat/YRLS2017][YRLS2017: R for statistics and reproducible research in the life
  sciences]] ([[http://htmlpreview.github.io/?https://github.com/christophe-pouzat/YRLS2017/blob/master/Pouzat_YRLS_RR_20170516.html][Html]]), Christophe Pouzat (github @christophe-pouzat)


* Notebooks Org-mode

- [[https://gitlab.com/c_pouzat/etudes-de-cas-m1/blob/master/TriDesPA/Pouzat_TriDesPA_20190128.org][Enregistrements extracellulaires et le tri des potentiel d'action :
  supports de cours et les codes associés]] ([[https://gitlab.com/c_pouzat/etudes-de-cas-m1/blob/master/TriDesPA/Pouzat_TriDesPA_20190128.pdf][Pdf]]), Christophe Pouzat (github @c_pouzat)
- [[https://gitlab.com/c_pouzat/etudes-de-cas-m1/blob/master/FluoCalcium/Pouzat_FluoCalcium_20180309.org][Mesures de concentrations calciques au moyen de sondes
  fluorescentes : supports de cours et les codes associés]] ([[https://gitlab.com/c_pouzat/etudes-de-cas-m1/blob/master/FluoCalcium/Pouzat_FluoCalcium_20180309.pdf][Pdf]]), Christophe
  Pouzat (gitlab @c_pouzat)
- [[https://github.com/jkitchin/dft-book][Un livre de chimie théorique écrit en Org-Mode]] ([[https://github.com/jkitchin/dft-book/raw/master/dft.pdf][Pdf version of the book]]), John Kitchin (github @jkitchin). 
- [[https://plmlab.math.cnrs.fr/xtof/interacting_neurons_with_stp/blob/master/interacting_neurons_with_stp.org][A system of interacting neurons with short term plasticity]], (org
  avec du C, gnuplot, shell) ([[https://plmlab.math.cnrs.fr/xtof/interacting_neurons_with_stp/blob/master/interacting_neurons_with_stp.Pdf][Pdf]]), Christophe Pouzat
- [[https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01224765][Supplementary Material for: Homogeneity and identity tests for unidimensional Poisson processes with an application to  neurophysiological peri-stimulus time histograms--R version]], (org
  avec R), ([[https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01224765/document][Pdf]]), Christophe Pouzat
- [[https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01224764][Supplementary  Material for: Homogeneity and identity tests for unidimensional Poisson processes with an application to neurophysiological peri-stimulus time histograms--Python version]],
  (org avec Python, mais les mêmes calculs que le précédent),([[https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01224764/document][Pdf]]), Christophe Pouzat
- [[https://gitlab.inria.fr/learninglab/mooc-rr/mooc-rr-ressources/tree/master/module2/ressources/sequence6_examples][Les documents montrés en exemple dans les vidéos du MOOC]]