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title: "Analyse de l'incidence du syndrôme grippal" title: "Analyse de l'incidence du syndrôme grippal"
author: "Konrad Hinsen" author: "Konrad Hinsen"
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...@@ -28,13 +28,7 @@ data_url = "http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv" ...@@ -28,13 +28,7 @@ data_url = "http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv"
# Download data from *Réseau Sentinelles* and read data stored as `csv` from local files. Best choice to assure permanent access to dataset. # Download data from *Réseau Sentinelles* and read data stored as `csv` from local files. Best choice to assure permanent access to dataset.
`` ``` `` ```
Pour nous protéger contre une éventuelle disparition ou modification du serveur du Réseau Sentinelles, nous faisons une copie locale de ce jeux de données que nous préservons avec notre analyse. Il est inutile et même risquée de télécharger les données à chaque exécution, car dans le cas d'une panne nous pourrions remplacer nos données par un fichier défectueux. Pour cette raison, nous téléchargeons les données seulement si la copie locale n'existe pas.
```{r}
data_file = "syndrome-grippal.csv"
if (!file.exists(data_file)) {
download.file(data_url, data_file, method="auto")
}
```
Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://ns.sentiweb.fr/incidence/csv-schema-v1.json): Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://ns.sentiweb.fr/incidence/csv-schema-v1.json):
...@@ -52,9 +46,9 @@ Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https:// ...@@ -52,9 +46,9 @@ Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://
| `geo_name` | Libellé de la zone géographique (ce libellé peut être modifié sans préavis) | | `geo_name` | Libellé de la zone géographique (ce libellé peut être modifié sans préavis) |
La première ligne du fichier CSV est un commentaire, que nous ignorons en précisant `skip=1`. La première ligne du fichier CSV est un commentaire, que nous ignorons en précisant `skip=1`.
### Lecture ### Téléchargement
```{r} ```{r}
data = read.csv(data_file, skip=1) data = read.csv(data_url, skip=1)
``` ```
Regardons ce que nous avons obtenu: Regardons ce que nous avons obtenu:
......
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