téléchargement du csv et modification du script pour l'ajout en local

module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd

@@ -23,7 +23,18 @@ knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
 
 Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. L'URL est:
 ```{r}
-data_url = "C:\\Users\\Reineix\\Desktop\\formations\\recherche_reproductible\\incidence-PAY-3.csv"
+data_url = "http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv"
+
+```
+
+Téléchargement d'une copie locale du csv, afin de se prémunir contre une éventuelle disparition ou modification du dataset, ou bien du lien:
+
+```{r}
+data_file = "syndrome_grippal.csv"
+	
+if (!file.exists(data_file)) {	
+    download.file(data_url, data_file, method="auto")	
+}
 ```
 
 Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://ns.sentiweb.fr/incidence/csv-schema-v1.json):
@@ -44,7 +55,7 @@ Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://
 La première ligne du fichier CSV est un commentaire, que nous ignorons en précisant `skip=1`.
 ### Téléchargement
 ```{r}
-data = read.csv(data_url, skip=1)
+data = read.csv(data_file, skip=1)
 ```
 
 Regardons ce que nous avons obtenu: