Replace exercice_fr.Rmd

parent 7a47ac01
--- #+TITLE: Exo 2
title: "Votre titre" :premambule:
author: "Votre nom" #+AUTHOR: V. Ledda
date: "La date du jour" #+DATE: <2024-03-30 sam.>
output: html_document #+LANGUAGE: fr
--- #+PROPERTY: header-args :eval never-export
#+HTML_HEAD: <link rel="stylesheet" type="text/css" href="http://www.pirilampo.org/styles/readtheorg/css/htmlize.css"/>
#+HTML_HEAD: <link rel="stylesheet" type="text/css" href="http://www.pirilampo.org/styles/readtheorg/css/readtheorg.css"/>
#+HTML_HEAD: <script src="https://ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/2.1.3/jquery.min.js"></script>
#+HTML_HEAD: <script src="https://maxcdn.bootstrapcdn.com/bootstrap/3.3.4/js/bootstrap.min.js"></script>
#+HTML_HEAD: <script type="text/javascript" src="http://www.pirilampo.org/styles/lib/js/jquery.stickytableheaders.js"></script>
#+HTML_HEAD: <script type="text/javascript" src="http://www.pirilampo.org/styles/readtheorg/js/readtheorg.js"></script>
```{r setup, include=FALSE} #+startup:overview indent inlineimages
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```
## Quelques explications #+latex_header: \usepackage{xcolor}
#+latex_header: \definecolor{CBlue}{HTML}{dcf2ff}
#+LATEX_HEADER: \definecolor{LightGray}{gray}{0.9}
#+latex_header: \definecolor{CBlue}{HTML}{dcf2ff}
#+latex_header: \definecolor{dark}{HTML}{272822}
#+attr_latex: :options bgcolor=CBlue
#+latex_header: \usemintedstyle{solarized-light}
#+latex_header: \usepackage{xcolor}
#+LATEX_HEADER:\usepackage{geometry} \geometry{ a4paper, total={190mm,257mm}, left=10mm, top=20mm, }
#+LATEX_HEADER:\usepackage{fancyhdr}\pagestyle{fancy}\fancyhead[L]{}\fancyhead[R]{MSP}\fancyfoot[R]{V. Ledda}
#+LATEX_HEADER:\usepackage{vmargin}
#+email: vincent.ledda@centralelille.fr
#+INFOJS_OPT:
#+PROPERTY: header-args :tangle yes
#+PROPERTY: header-args:jupyter-R :exports both
#+PROPERTY: header-args:jupyter-R+ :session /jpy::ir
#+PROPERTY: cache yes
#+LaTeX_CLASS_OPTIONS:[12pt]
#+EXPORT_EXCLUDE_TAGS: noexport
:end:
Ceci est un document R markdown que vous pouvez aisément exporter au format HTML, PDF, et MS Word. Pour plus de détails sur R Markdown consultez <http://rmarkdown.rstudio.com>. #+name: scrollImage
#+begin_src elisp :exports none
(defun org-image-resize (frame)
(setq org-export-allow-bind-keywords t)
(when (derived-mode-p 'org-mode)
(if (< (window-total-width) 80)
(setq org-image-actual-width (* 4 window-pixel-width))
(setq org-image-actual-width (* 42 (window-font-width))))
(org-redisplay-inline-images)))
Lorsque vous cliquerez sur le bouton **Knit** ce document sera compilé afin de ré-exécuter le code R et d'inclure les résultats dans un document final. Comme nous vous l'avons montré dans la vidéo, on inclue du code R de la façon suivante:
```{r cars}
summary(cars)
```
Et on peut aussi aisément inclure des figures. Par exemple: (add-hook 'window-size-change-functions 'org-image-resize)
(visual-line-mode t)
(variable-pitch-mode t)
(add-hook 'org-babel-after-execute-hook 'org-redisplay-inline-images)
#+end_src
```{r pressure, echo=FALSE} #+RESULTS: scrollImage
plot(pressure) | org-redisplay-inline-images |
```
Vous remarquerez le paramètre `echo = FALSE` qui indique que le code ne doit pas apparaître dans la version finale du document. Nous vous recommandons dans le cadre de ce MOOC de ne pas utiliser ce paramètre car l'objectif est que vos analyses de données soient parfaitement transparentes pour être reproductibles.
Comme les résultats ne sont pas stockés dans les fichiers Rmd, pour faciliter la relecture de vos analyses par d'autres personnes, vous aurez donc intérêt à générer un HTML ou un PDF et à le commiter. #+begin_src elisp :exports none
(setq org-latex-listings 'minted)
(add-to-list 'org-latex-packages-alist '("" "minted"))
(setq org-latex-listings 'minted
Maintenant, à vous de jouer! Vous pouvez effacer toutes ces informations et les remplacer par votre document computationnel. org-latex-pdf-process
'("pdflatex -shell-escape -interaction nonstopmode -output-directory %o %f"
"pdflatex -shell-escape -interaction nonstopmode -output-directory %o %f"))
(setq org-latex-minted-options '(
("frame" "leftline")
("fontsize" "\\scriptsize")
("xleftmargin" "\\parindent")
("rulecolor" "CBlue")
("bgcolor" "LightGray")
))
#+end_src
#+RESULTS:
| frame | leftline |
| fontsize | \scriptsize |
| xleftmargin | \parindent |
| rulecolor | CBlue |
| bgcolor | LightGray |
* Savoir faire un calcul simple soi-même
#+begin_src jupyter-R :exports both :results raw drawer
data<-c(14.0, 7.6, 11.2, 12.8, 12.5, 9.9, 14.9, 9.4, 16.9, 10.2, 14.9, 18.1, 7.3, 9.8, 10.9,12.2, 9.9, 2.9, 2.8, 15.4, 15.7, 9.7, 13.1, 13.2, 12.3, 11.7, 16.0, 12.4, 17.9, 12.2, 16.2, 18.7, 8.9, 11.9, 12.1, 14.6, 12.1, 4.7, 3.9, 16.9, 16.8, 11.3, 14.4, 15.7, 14.0, 13.6, 18.0, 13.6, 19.9, 13.7, 17.0, 20.5, 9.9, 12.5, 13.2, 16.1, 13.5, 6.3, 6.4, 17.6, 19.1, 12.8, 15.5, 16.3, 15.2, 14.6, 19.1, 14.4, 21.4, 15.1, 19.6, 21.7, 11.3, 15.0, 14.3, 16.8, 14.0, 6.8, 8.2, 19.9, 20.4, 14.6, 16.4, 18.7, 16.8, 15.8, 20.4, 15.8, 22.4, 16.2, 20.3, 23.4, 12.1, 15.5, 15.4, 18.4, 15.7, 10.2, 8.9, 21.0)
summary(data)
sd(data)
#+end_src
#+RESULTS:
:RESULTS:
: Min. 1st Qu. Median Mean 3rd Qu. Max.
: 2.80 11.85 14.50 14.11 16.80 23.40
#+begin_export html
4.33409445530145
#+end_export
:END:
* Réaliser un graph
#+begin_src jupyter-R :exports both :results raw drawer
library(tidyverse)
#+end_src
#+RESULTS:
#+begin_src jupyter-R :exports both :results raw drawer
ggplot(data=data.frame(x=seq(length(data)),y=data),aes(x=x,y=y))+geom_line()
#+end_src
#+RESULTS:
:RESULTS:
#+attr_org: :width 630 :height 630
[[./.ob-jupyter/a2097194cb52f4b5bd272ca5fed1287e1d061dbd.png]]
:END:
#+begin_src jupyter-R :exports both :results raw drawer
ggplot(data=data.frame(x=seq(length(data)),y=data),aes(x=y,after_stat(count)))+
geom_histogram(alpha=0.4,binwidth=2,col="blue",position="identity")
#+end_src
#+RESULTS:
:RESULTS:
#+attr_org: :width 630 :height 630
[[./.ob-jupyter/7353fef23bdf8d55fa351472211c5051ad408ba0.png]]
:END:
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