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module3/exo1/analyse-syndrome-grippal.Rmd

@@ -24,6 +24,12 @@ knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
 Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. L'URL est:
 ```{r}
 data_url = "http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv"
+
+data_file = "Incidence_grippe.csv"
+
+if (!file.exists(data_file)) {
+    download.file(data_url, data_file, method="auto")
+}
 ```
 
 Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://ns.sentiweb.fr/incidence/csv-schema-v1.json):
@@ -44,7 +50,7 @@ Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://
 La première ligne du fichier CSV est un commentaire, que nous ignorons en précisant `skip=1`.
 ### Téléchargement
 ```{r}
-data = read.csv(data_url, skip=1)
+data = read.csv(data_file, skip=1, na.strings = "-")
 ```
 
 Regardons ce que nous avons obtenu: