Update analyse-syndrome-grippal.Rmd

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...@@ -23,11 +23,12 @@ knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE) ...@@ -23,11 +23,12 @@ knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. L'URL est: Les données de l'incidence du syndrome grippal sont disponibles du site Web du [Réseau Sentinelles](http://www.sentiweb.fr/). Nous les récupérons sous forme d'un fichier en format CSV dont chaque ligne correspond à une semaine de la période demandée. Nous téléchargeons toujours le jeu de données complet, qui commence en 1984 et se termine avec une semaine récente. L'URL est:
```{r} ```{r}
# Downloaded file locally to avoid changes in URL, etc.
file="incidence-PAY-3.csv" file="incidence-PAY-3.csv"
if(!file.exists(file)){ if(!file.exists(file)){
data_url = "http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv" data_url = "http://www.sentiweb.fr/datasets/incidence-PAY-3.csv"
download.file(url = data_url, destfile = "incidence-PAY-3.csv")) download.file(url = data_url, destfile = "incidence-PAY-3.csv"))
data=read.csv("incidence-PAY-3.csv") data=read.csv("incidence-PAY-3.csv", skip = 1)
} }
``` ```
...@@ -47,10 +48,6 @@ Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https:// ...@@ -47,10 +48,6 @@ Voici l'explication des colonnes donnée sur le [sur le site d'origine](https://
| `geo_name` | Libellé de la zone géographique (ce libellé peut être modifié sans préavis) | | `geo_name` | Libellé de la zone géographique (ce libellé peut être modifié sans préavis) |
La première ligne du fichier CSV est un commentaire, que nous ignorons en précisant `skip=1`. La première ligne du fichier CSV est un commentaire, que nous ignorons en précisant `skip=1`.
### Téléchargement
```{r}
data = read.csv(data_url, skip=1)
```
Regardons ce que nous avons obtenu: Regardons ce que nous avons obtenu:
```{r} ```{r}
......
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